Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SCART1

scavenger receptor family member expressed on T cells 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
10q26.3
Koordinater
Kromosom 10: 133 453 945–133 469 760 (GRCh38)
Exoner
12 exoner på 15,8 kb
Protein
1 027 aminosyror
Även känd som
CD163c-alpha
MANE Select-transkript
ENST00000640237.2NM_001396050.1
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SCART1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SCART1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 10, med en parentes där SCART1 finns. SCART1 och 19 gener i närheten på kromosom 10, från 132 961 853 till 133 961 852.Kromosom 1010q26.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3133 Mb133,2 Mb133,4 Mb133,6 Mb133,8 MbADGRA1: 133 087 814–133 131 675, framåt-strängADGRA1KNDC1: 133 159 991–133 226 412, framåt-strängKNDC1UTF1: 133 229 352–133 231 558, framåt-strängUTF1VENTX: 133 235 769–133 241 929, framåt-strängVENTXADAM8: 133 262 416–133 276 909, bakåt-strängADAM8TUBGCP2: 133 278 635–133 318 823, bakåt-strängTUBGCP2ZNF511: 133 308 885–133 313 163, framåt-strängZNF511ZNF511-PRAP1: 133 309 410–133 352 529, framåt-strängCALY: 133 324 072–133 336 980, bakåt-strängPRAP1: 133 347 147–133 354 013, framåt-strängFUOM: 133 353 952–133 358 796, bakåt-strängFUOMECHS1: 133 362 368–133 373 714, bakåt-strängECHS1PAOX: 133 378 961–133 393 943, framåt-strängPAOX: 133 380 017–133 420 271, framåt-strängMTG1: 133 394 071–133 422 765, framåt-strängMTG1SPRN: 133 420 666–133 424 625, bakåt-strängSPRNSCART1: 133 453 945–133 469 760, framåt-strängSCART1CYP2E1: 133 520 406–133 561 220, framåt-strängCYP2E1SYCE1: 133 552 822–133 569 835, bakåt-strängSYCE1FRG2B: 133 623 895–133 626 795, bakåt-strängFRG2BDiagram över SCART1: 12 exoner på framåt-strängen av kromosom 10Exon 1: 133 453 945–133 454 064, 120 baserExon 2: 133 456 237–133 456 554, 318 baserExon 3: 133 457 279–133 457 575, 297 baserExon 4: 133 458 360–133 458 656, 297 baserExon 5: 133 459 021–133 459 326, 306 baserExon 6: 133 459 487–133 460 170, 684 baserExon 7: 133 464 606–133 464 911, 306 baserExon 8: 133 465 106–133 465 174, 69 baserExon 9: 133 465 251–133 465 565, 315 baserExon 10: 133 466 235–133 466 381, 147 baserExon 11: 133 467 198–133 467 353, 156 baserExon 12: 133 467 847–133 469 760, 1 914 baser1234567891011125′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,9 kb av genens 15,8 kb, och 3 084 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SCART1

16Måttlig

Hur svår SCART1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Några av SCART1:s exoner ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.

Det som adderar: andelen av SCART1:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet4,7 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner2 %
  • GC-innehåll58 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SCART1-genen: scavenger receptor family member expressed on T cells 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/scart1

Vancouver

Dante Labs. SCART1-genen: scavenger receptor family member expressed on T cells 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/scart1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test