Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

RPUSD4

RNA pseudouridine synthase D4

Sammanfattning

Cytogenetisk position
11q24.2
Koordinater
Kromosom 11: 126 202 096–126 211 650 (GRCh38)
Exoner
7 exoner på 9,6 kb
Protein
377 aminosyror
Även känd som
FLJ14494
MANE Select-transkript
ENST00000298317.9NM_032795.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser RPUSD4 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är RPUSD4 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 11, med en parentes där RPUSD4 finns. RPUSD4 och 16 gener i närheten på kromosom 11, från 125 706 873 till 126 706 872.Kromosom 1111q24.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25125,8 Mb126 Mb126,2 Mb126,4 Mb126,6 MbPATE1: 125 746 279–125 749 867, framåt-strängPATE1PATE2: 125 776 113–125 778 828, bakåt-strängPATE2PATE3: 125 788 127–125 791 600, framåt-strängPATE3PATE4: 125 833 316–125 840 072, framåt-strängPATE4HYLS1: 125 883 614–125 900 846, framåt-strängHYLS1PUS3: 125 892 347–125 903 227, bakåt-strängPUS3DDX25: 125 903 348–125 943 702, framåt-strängDDX25VSIG10L2: 125 946 044–125 958 647, framåt-strängVSIG10L2CDON: 125 955 796–126 063 335, bakåt-strängCDONRPUSD4: 126 202 096–126 211 650, bakåt-strängRPUSD4SIRAL1: 126 211 687–126 265 162, framåt-strängSIRAL1SRPRA: 126 255 132–126 269 144, bakåt-strängSRPRAFOXRED1: 126 269 024–126 281 756, framåt-strängFOXRED1TIRAP: 126 282 497–126 298 845, framåt-strängTIRAPDCPS: 126 303 971–126 350 005, framåt-strängDCPSST3GAL4: 126 354 677–126 442 293, framåt-strängST3GAL4KIRREL3: 126 423 358–127 003 460, bakåt-strängKIRREL3Diagram över RPUSD4: 7 exoner på bakåt-strängen av kromosom 11Exon 7: 126 202 096–126 203 657, 1 562 baserExon 6: 126 204 231–126 204 328, 98 baserExon 5: 126 205 468–126 205 612, 145 baserExon 4: 126 205 688–126 205 781, 94 baserExon 3: 126 209 521–126 209 722, 202 baserExon 2: 126 210 890–126 211 055, 166 baserExon 1: 126 211 450–126 211 650, 201 baser76543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 2,5 kb av genens 9,6 kb, och 1 134 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av RPUSD4

2Lätt

Hur svår RPUSD4 är att sekvensera med korta reads, av 100

Nästan alla exoner i RPUSD4 ligger där korta reads tydligt kan kartläggas.

Det som ökar svårigheten: andelen exoner i RPUSD4 i varje typ av svårt område

  • Mappabilitet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner3,8 %
  • GC-innehåll4,3 %

En Dante Labs-poäng baserad på vår egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). RPUSD4-genen: RNA pseudouridine synthase D4. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/rpusd4

Vancouver

Dante Labs. RPUSD4-genen: RNA pseudouridine synthase D4 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/rpusd4

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test