Gen
PARP8
poly(ADP-ribose) polymerase family member 8
- HGNC 26124↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000151883↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 79668↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5q11.1
- Koordinater
- Kromosom 5: 50 666 637–50 846 519 (GRCh38)
- Exoner
- 26 exoner på 179,9 kb
- Protein
- 854 aminosyror
- Även känd som
- FLJ21308, pART16, ARTD16
- MANE Select-transkript
- ENST00000281631.10NM_024615.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/parp8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs PARP8, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser PARP8 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är PARP8 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 7,5 kb av genens 179,9 kb, och 2 565 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av PARP8
6Lätt
Hur svår PARP8 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i PARP8 ligger där korta läsningar kan kartläggas tydligt.
Det som tillkommer: andelen av PARP8s exoner i varje typ av svårsekvenserad region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så att ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.2,5 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.8,1 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och kanske inte täcker. Vikt 15 %.2,9 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunt. Vikt 10 %.19 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensmonteringen, där det inte finns någon sekvens som läsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, baserad på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av PARP8s exonbaser i den typen av svår region. Poängen väger dem efter hur mycket var och en kostar ett anrop med korta läsningar: 0 när ingen bas ligger i någon av dem, 100 när varje bas ligger i alla.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). PARP8-genen: poly(ADP-ribose) polymerase family member 8. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/parp8
Dante Labs. PARP8-genen: poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/parp8
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor