Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PARP8

poly(ADP-ribose) polymerase family member 8

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
5q11.1
Koordináták
5. kromoszóma: 50 666 637–50 846 519 (GRCh38)
Exonok
26 exon, összesen 179,9 kb
Fehérje
854 aminosav
Más néven ismert
FLJ21308, pART16, ARTD16
MANE Select transzkriptum
ENST00000281631.10NM_024615.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PARP8 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PARP8 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
5. kromoszóma, a PARP8 helyét zárójel jelöli. A PARP8 és környékén 1 gén a 5. kromoszómán, 50 256 578–51 256 577 között.5. kromoszóma5q11.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.350,4 Mb50,6 Mb50,8 Mb51 Mb51,2 MbEMB: 50 382 390–50 443 248, fordított szálEMBPARP8: 50 666 637–50 846 519, előre szálPARP8A PARP8 ábrája: 26 exon a(z) 5. kromoszóma előre szálán1. exon: 50 666 637–50 667 186, 550 bázis2. exon: 50 668 071–50 668 125, 55 bázis3. exon: 50 750 151–50 750 188, 38 bázis4. exon: 50 759 643–50 759 732, 90 bázis5. exon: 50 760 292–50 760 362, 71 bázis6. exon: 50 761 821–50 761 898, 78 bázis7. exon: 50 763 148–50 763 242, 95 bázis8. exon: 50 778 069–50 778 129, 61 bázis9. exon: 50 778 560–50 778 650, 91 bázis10. exon: 50 788 523–50 788 589, 67 bázis11. exon: 50 794 207–50 794 332, 126 bázis12. exon: 50 794 853–50 795 417, 565 bázis13. exon: 50 796 982–50 797 032, 51 bázis14. exon: 50 797 138–50 797 233, 96 bázis15. exon: 50 815 432–50 815 524, 93 bázis16. exon: 50 821 213–50 821 338, 126 bázis17. exon: 50 822 335–50 822 400, 66 bázis18. exon: 50 824 908–50 824 975, 68 bázis19. exon: 50 826 755–50 826 803, 49 bázis20. exon: 50 827 944–50 828 056, 113 bázis21. exon: 50 828 312–50 828 384, 73 bázis22. exon: 50 829 892–50 829 961, 70 bázis23. exon: 50 832 781–50 832 854, 74 bázis24. exon: 50 833 979–50 834 048, 70 bázis25. exon: 50 834 931–50 835 015, 85 bázis26. exon: 50 841 966–50 846 519, 4554 bázis1510152025265′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 179,9 kb-jából 7,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2565 bázis kódolja a fehérjét.

PARP8 szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a PARP8 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A PARP8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a PARP8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség2,5%
  • Homológia8,1%
  • Ismétlődések2,9%
  • GC-tartalom19%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PARP8 gén: poly(ADP-ribose) polymerase family member 8. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/parp8

Vancouver

Dante Labs. PARP8 gén: poly(ADP-ribose) polymerase family member 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/parp8

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet