Spinal muskelatrofi – en av 50 personer är bärare av en SMN1-variant. Att identifiera bärare före familjeplanering och ställa en tidig diagnos hos nyfödda ger tillgång till genterapier som kan förändra sjukdomsförloppet avgörande.
Genomsekvensering av hela genomet identifierar SMN1-deletioner och kopiantalet av SMN2, vilket möjliggör behandling redan innan symtom uppträder med genterapi eller sjukdomsmodifierande läkemedel.
Spinal muskelatrofi (SMA)
Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive motor neuron disease caused by loss of function of SMN1 (survival motor neuron 1) gene, resulting in degeneration of anterior horn motor neurons. Incidence is approximately 1 in 6,000–10,000 live births; carrier frequency is approximately 1 in 50 across populations. SMA is characterized by progressive weakness, starting proximally and advancing distally, with respiratory and bulbar involvement in severe forms. The disease is classified into types based on age of onset and maximum motor function achieved: Type I (severe, onset <6 months, never able to sit independently, often fatal by age 2 without treatment), Type II (intermediate, onset 6–18 months, able to sit but never walk), Type III (mild, onset >18 months, able to walk), and Type IV (adult-onset). Approximately 95–98% of SMA cases are caused by homozygous deletion of SMN1 exons 7–8; the remaining cases result from homozygous or compound heterozygous point mutations. Disease severity is dramatically modulated by SMN2 copy number: SMN2 encodes an almost identical protein but with a critical splicing difference that produces mostly non-functional truncated protein; however, approximately 15% of SMN2 transcripts include exon 7, producing functional SMN protein.
SMN1 och SMN2 är nästan identiska gener (99,9 % sekvenshomologi) som ligger i tandem på kromosom 5q13 – en region med hög sekvenshomologi och frekventa variationer i kopiantal. SMN kodar för survival motor neuron-proteinet, vilket är avgörande för bildandet av snRNP och mRNA-splicing i nervceller; förlust av SMN-proteinet orsakar motorneurondegeneration. SMN2 förekommer i flera kopior hos de flesta individer (1–4 kopior, median 2) på grund av duplicering. Även om SMN2 inte helt kan kompensera för förlusten av SMN1 på grund av bristande splicing av exon 7, avgör antalet SMN2-kopior i hög grad sjukdomens svårighetsgrad: 1–2 kopior ger vanligtvis typ I (svår); 3 kopior ger typ II (mellanliggande); 3–4 kopior korrelerar med typ III (mild). Presymptomatiska SMA-patienter som upptäcks genom nyföddsscreening med 2–3 SMN2-kopior löper risk för typ I eller II; de med ≥4 kopior har lägre omedelbar risk, även om tidig behandling oavsett kan förhindra fenotyputtryck.
Genotypning av SMN1/SMN2 är avgörande för diagnos av SMA och val av behandling. Tre godkända behandlingar finns tillgängliga: nusinersen (Spinraza), ett antisens-oligonukleotid som administreras intratekalt och som reglerar splicingen av SMN2 för att öka inkluderingen av exon 7 och produktionen av SMN2-protein i full längd; onasemnogene abeparvovec (Zolgensma), en genterapi som använder AAV9 för att administrera funktionellt SMN1-cDNA intravenöst som en engångsinfusion – en engångsbehandling som nu föredras hos presymptomatiska patienter; och risdiplam (Evrysdi), en oral splicingmodifierare som möjliggör behandling i hemmet. Presymptomatisk behandling (nyfödda barn som diagnostiserats) ger dramatiskt förbättrade resultat – de flesta behandlade presymptomatiska spädbarn utvecklar aldrig observerbara SMA-symtom och uppnår normala eller nästan normala motoriska milstolpar. Antalet SMN2-kopior hjälper till att förutsäga sjukdomens naturliga svårighetsgrad och styr prognosen, även om tidig behandling kan förhindra fenotyputtryck även hos patienter som är dömda att få typ I.
Standardsekvensering kan inte på ett tillförlitligt sätt skilja SMN1 från SMN2 på grund av den höga sekvenslikheten. Det krävs en specialiserad analys av kopiantalet.
Bestämning av kopiantalet för SMN1/SMN2 kräver specialiserad analys
SMA ingår numera i RUSP (rekommenderad enhetlig screeningpanel för nyfödda) i de flesta amerikanska delstater, och bärarscreening blir allt vanligare. Standardsekvensering kan inte på ett tillförlitligt sätt skilja mellan SMN1- och SMN2-kopior på grund av deras 99,9-procentiga sekvenslikhet; specialiserade tekniker för analys av kopiantal (jämförande genomhybridisering, MLPA eller riktad NGS med specialiserad läsmappning) krävs. Bärarscreeningpaneler detekterar vanligtvis SMN1-deletion men kan inte alltid bestämma SMN2-kopiantalet med precision. Helgenomsekvensering med specialiserade algoritmer för kopiantalsdetektering kan ge en exakt bedömning av SMN1/SMN2-kopiantalet, vilket möjliggör omfattande bärarscreening och förutsägelse av sjukdomens svårighetsgrad.
Antalet kopior av SMN2 avgör sjukdomens svårighetsgrad och ligger till grund för behandling före symtomdebut
Antalet SMN2-kopior är den främsta faktorn som påverkar sjukdomens svårighetsgrad: 1–2 kopior indikerar typ I (svår form, debut i spädbarnsåldern); 3 kopior indikerar typ II (mellanform, debut vid 6–18 månaders ålder); 3–4 kopior motsvarar typ III (mild form, förmåga att gå). Presymptomatiska SMA-patienter som upptäcks genom nyföddsscreening med 2–3 SMN2-kopior löper risk för snabb sjukdomsprogression och behöver omedelbart påbörja behandling. De med ≥4 kopior har lägre omedelbar risk men har nytta av tidig behandling. Tre godkända behandlingar ger transformativa resultat: genterapi (Zolgensma) är en engångsbehandling; antisensbehandling (Spinraza) kräver upprepade intratekala infusioner; oral behandling (Evrysdi) möjliggör behandling i hemmet. Dokumenterad i journalen möjliggör SMN-genotypen presymptomatisk diagnos och snabb behandlingsstart – vilket förhindrar sjukdomsutveckling och möjliggör normal motorisk utveckling.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för spinal muskelatrofi (SMA) och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
