Peutz-Jeghers syndrom – ett ärftligt hamartomsyndrom som medför en kumulativ cancerrisk på över 85 % i sex olika organsystem, och där övervakningsprogram måste inledas redan under barndomen.
STK11 finns med på ACMG:s lista över sekundära fynd (SF v3.2). Hela genomsekvensering ger en fullständig karakterisering av STK11, inklusive de stora genomiska deletionerna som står för cirka 30 % av fallen av PJS och som inte upptäcks på ett tillförlitligt sätt med standardsekvenseringspaneler.
Peutz-Jeghers syndrom
Peutz-Jeghers syndrom (PJS) är ett autosomalt dominant ärftligt syndrom som kännetecknas av gastrointestinal polypos och ökad cancerrisk, orsakat av patogena variationer i STK11-genen (serin/treoninkinas 11, även känd som LKB1) på kromosom 19p13.3. STK11 kodar för ett tumörsuppressorkinas som aktiverar AMPK och reglerar cellpolaritet och energimetabolism. PJS kännetecknas av utveckling av karakteristiska hamartomösa polyper i hela mag-tarmkanalen (framför allt i tunntarmen), distinkt mukokutan pigmentering (melaninflekker på läppar, munslemhinna, fingrar och tår samt perianalområdet) och dramatiskt förhöjd cancerrisk i flera organ. PJS har en prevalens på cirka 1 av 50 000–200 000.
Den sammanlagda livstidsrisken för cancer vid PJS är extremt hög – den uppskattas till över 85 % vid 70 års ålder för alla typer av cancer. De individuella livstidsriskerna för olika cancerformer omfattar: cancer i mag-tarmkanalen (tunntarm ~13 %, tjocktarm och ändtarm ~40 %, magsäck ~29 %), bukspottkörtelcancer (~36 %), bröstcancer (~54 % hos kvinnor), gynekologiska cancerformer (adenokarcinom i livmoderhalsen ~10 %, livmoder ~9 %, sexsträngstumör i äggstockarna med ringformade tubuli ~21 %) och lungcancer (~15 %). Övervakningen måste påbörjas redan i barndomen och omfatta flera organsystem samtidigt. Polyper i tunntarmen orsakar återkommande intussusception under barndomen, vilket ofta kräver akut kirurgi — något som kan förebyggas med regelbunden övervakning av tunntarmen och profylaktisk polypektomi när stora polyper identifieras.
Cirka 94–96 % av PJS-fallen som uppfyller de syndromiska diagnostiska kriterierna har en identifierbar patogen variant i STK11-genen. Stora deletioner eller duplikationer som kan påvisas med MLPA eller genom analys av kopiantalsvariationer står för cirka 30 % av de patogena STK11-varianterna – dessa missas av standardpaneler som endast omfattar exonsekvensering. De återstående ~4–6 % av de kliniska PJS-fallen utan detekterbara STK11-varianter kan representera somatisk mosaik, djupa intronvarianter eller genetisk heterogenitet. STK11 ingår i ACMG SF v3.2-listan över sekundära fynd, vilket återspeglar tillgången till effektiva övervakningsåtgärder som väsentligt minskar cancerdödligheten hos bekräftade bärare.
30 % av de patogena varianterna av STK11 är stora deletioner som inte upptäcks av vanliga sekvenseringspaneler. Vid ett syndrom där cancerövervakning måste inledas redan i barndomen får en försenad diagnos konsekvenser för resten av livet.
Var tredje STK11-variant som orsakar PJS är en deletion – dessa upptäcks inte av vanliga sekvenseringspaneler
Cirka 30 % av de bekräftade patogena varianterna i STK11 är stora genomiska deletioner som sträcker sig över ett eller flera exoner. Standardpaneler för nästa generations sekvensering som sekvenserar STK11:s kodande exoner kan inte på ett tillförlitligt sätt upptäcka stora deletioner utan en särskild analys av kopiantalsvariationer. Flera publicerade PJS-familjer med fullständig klinisk fenotyp – mukokutan pigmentering, multipla hamartomösa polyper och karakteristisk familjehistoria – visade sig ha STK11-deletioner som föregick negativa panelresultat med månader till år. I ett syndrom där övervakning av barns tunntarm börjar vid 8 års ålder (NCCN-rekommendation) och övervakning av bukspottkörteln vid 35 års ålder, har en diagnostisk fördröjning av den omfattningen direkta konsekvenser för cancerförebyggandet.
PJS-övervakningen omfattar sex olika cancerformer samtidigt – vilket innebär att en enda definitiv diagnos krävs för att inleda hela behandlingsprotokollet
När en molekylär diagnos av STK11 fastställs sätts ett övervakningsprotokoll för flera organ i gång som skiljer sig väsentligt från standardrekommendationerna för cancerscreening. NCCN:s riktlinjer för PJS rekommenderar: övre endoskopi och koloskopi från 8–10 års ålder; endoskopi av tunntarmen/kapselendoskopi från 8–10 års ålder; årlig MR-undersökning av brösten från 25 års ålder samt mammografi från 30 års ålder; årlig ultraljudsundersökning av bäckenet eller utvärdering av livmoderslemhinnan från 18 års ålder; övervakning av bukspottkörteln från 35 års ålder (endoskopisk ultraljudsundersökning/MR); samt testikelundersökning hos män från födseln (SCTAT-risk). Inget standardprogram för cancerscreening täcker alla dessa områden – en bekräftad molekylär PJS-diagnos är en förutsättning för att inleda det omfattande protokoll som gör övervakningen meningsfull.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för Peutz-Jeghers syndrom och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
