Ärftlig diffus magcancer — Funktionsförlust i CDH1-genen medför en livstidsrisk för magcancer på upp till 70 %, där cancern utvecklas under magslemhinnan och är osynlig vid endoskopi tills den inte längre kan opereras bort.
Genom att sekvensera hela genomet kan man identifiera alla CDH1-varianter – inklusive stora deletioner och mosaikmutationer – för att ställa den diagnos som ligger till grund för rekommendationen om förebyggande total gastrektomi innan en endoskopiskt osynlig cancer hinner utvecklas.
Ärftlig diffus magcancer
Hereditär diffus magcancer (HDGC) är ett autosomalt dominant cancersyndrom som orsakas av patogena varianter i CDH1 (E-kadherin) på kromosom 16q22.1. CDH1 kodar för ett cell-cell-adhesionsprotein som är avgörande för epitelvävnadens integritet; en funktionsförlust i detta protein leder till det svagt sammanhängande, infiltrerande tillväxtmönster som är karakteristiskt för diffus magcancer (signetringcellskarcinom). HDGC definierades först 1998 i en stor maorisk släkt från Nya Zeeland och är fortfarande ett av de mest dödliga ärftliga cancersyndromen – livstidsrisken för magcancer hos bärare av patogena varianter av CDH1 uppskattas till 40–70 % hos män och 45–70 % hos kvinnor. Medianåldern för insjuknande i familjära fall är 38 år, men fall har dokumenterats hos patienter i 20-årsåldern.
Den kliniska utmaningen med HDGC är att diffus magcancer växer i form av enskilda signetringceller som infiltrerar submukosan – ett tillväxtmönster som inte bildar någon synlig tumör och som inte kan upptäckas på ett tillförlitligt sätt med standardendoskopi. Endoskopisk övervakning, även med systematiska biopsiprotokoll, missar majoriteten av de tidiga HDGC-lesionerna. Varje total gastrektomi som utförs profylaktiskt hos bärare av den patogena varianten av CDH1 avslöjar okulta signetringcellsfoci vid patologisk undersökning – vilket innebär att även ”normalt” utseende magar rymmer mikroskopisk cancer hos praktiskt taget alla bärare. Detta enda biologiska faktum ligger till grund för rekommendationen om profylaktisk total gastrektomi för CDH1-bärare i åldern 18–40 år, snarare än övervakning.
Kvinnliga bärare av CDH1 löper också en avsevärt förhöjd risk för lobulär bröstcancer – uppskattad till 42–56 % under livstiden. Lobulär bröstcancer växer, precis som diffus magcancer, i ett infiltrerande, radformat mönster som vanlig mammografi inte alltid kan upptäcka, vilket gör MR-undersökning av brösten till en viktig del av uppföljningen. CDH1 ingår i ACMG SF v3.2:s lista över sekundära fynd, vilket återspeglar konsensusen att identifiering av CDH1-bärare innan cancer utvecklas är både kliniskt användbart och livräddande. Cirka 40 % av familjerna som uppfyller de kliniska kriterierna för HDGC är CDH1-negativa; vissa av dessa familjer har varianter i CTNNA1 (alfa-E-katenin) eller andra gener, och en omfattande genomisk strategi är indicerad.
Standardpaneler för ärftlig cancer missar stora CDH1-deletioner och mosaikvarianter. Vid ett syndrom där förebyggande kirurgi är beroende av molekylär bekräftelse får ett ofullständigt genetiskt resultat direkta konsekvenser för det kirurgiska ingreppet.
Stora CDH1-deletioner står för 10–15 % av fallen av HDGC och upptäcks inte av exonsekvenseringspaneler
Cirka 10–15 % av de patogena CDH1-varianterna i familjer med hereditär bröstcancer (HDGC) är stora genomiska deletioner som sträcker sig över ett eller flera exoner. Exonsekvenseringspaneler som inte inkluderar analys av deletioner/duplikationer med MLPA eller identifiering av kopiantalsvariationer kommer att missa dessa varianter. Dessutom har somatisk mosaik – där CDH1-varianten endast förekommer i en bråkdel av patientens celler – dokumenterats i vissa familjer och kan missas vid standardsekvenseringsdjup. Helgenomsekvensering möjliggör samtidig detektion av punktmutationer och analys av kopiantalsvariationer över hela CDH1-genen, vilket identifierar både vanliga intrageniska varianter och strukturella omarrangemang i ett enda test.
Förebyggande gastrektomi kräver molekylär bekräftelse – ett negativt panelresultat är inte detsamma som ett verkligt negativt resultat
Total gastrektomi är ett omfattande kirurgiskt ingrepp med betydande långsiktiga konsekvenser för livskvaliteten. Ingreppet rekommenderas för bärare av CDH1-mutationen, eftersom diffus magcancer i tidigt stadium inte kan upptäckas endoskopiskt och övervakning inte har lyckats förhindra dödsfall i familjer där bärarskapet är känt. Denna rekommendation är endast lämplig när en patogen variant av CDH1-genen har bekräftats genom molekylär analys. En ofullständig panel som inte utvärderade stora deletioner eller utförde en omfattande CDH1-analys ger en falsk trygghet till en familj där den patogena varianten fortfarande kan finnas men helt enkelt inte kunde upptäckas med begränsade tester. Hela genomsekvensering undanröjer denna tvetydighet.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för ärftlig diffus magcancer och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
