Fanconis anemi – en komplex störning i DNA-reparationsmekanismen som orsakas av mutationer i något av 23 gener, där den specifika komplementationsgruppen avgör intensiteten i förberedelsen inför benmärgstransplantation samt protokollet för livslång cancerövervakning.
Vid helgenomsekvensering analyseras samtliga 23 gener i Fanconis anemi-komplementationsgruppen samtidigt – vilket är det enda praktiska sättet att fastställa vilken gen som är ansvarig, en uppgift som har direkt inverkan på planeringen av transplantationer och den löpande cancerbehandlingen.
Fanconis anemi
Fanconis anemi (FA) är en autosomal recessiv (och en X-bunden) DNA-reparationsstörning som orsakas av patogena varianter i gener som kodar för någon komponent i Fanconis anemi-BRCA-signalvägen för DNA-skadereaktion. FA är genetiskt heterogen – 23 komplementeringsgrupper har definierats (FANC-A till FANC-V, med ytterligare undergrupper), vilket motsvarar 23 olika gener. Patogena varianter av FANCA står för cirka 60–70 % av FA-fallen; FANCC (~10 %) och FANCG (~10 %) är de näst vanligaste. FA drabbar cirka 1 av 130 000 födda, med högre frekvens i specifika populationer: FANCC c.711+4A>T är vanligt hos ashkenaziska judar (bärarfrekvens ~1 av 90), och FANCA-deletioner är vanligare hos spanska romska populationer.
FA kännetecknas av en varierande kombination av: medfödda fysiska missbildningar (defekter i tummen och radiusstrålen, kortväxthet, café-au-lait-fläckar, njurmissbildningar, hjärtfel – förekommer hos cirka 60–75 % av patienterna); progressiv benmärgsinsufficiens (aplastisk anemi, som vanligtvis uppträder under de första tio levnadsåren); och markant förhöjd cancerrisk – särskilt akut myeloisk leukemi och skivepitelcancer i huvud och hals. Medianåldern för när benmärgsinsufficiensen debuterar är cirka 7 år. Hematopoetisk stamcellstransplantation (HSCT) är den enda botande behandlingen för benmärgsinsufficiensen och risken för AML, men FA-patienter tolererar standardkemoterapi och strålning inför transplantationen extremt dåligt på grund av bristande DNA-reparation — vilket kräver specialutformade protokoll med reducerad intensitet.
Den specifika FA-komplementationsgruppen har direkta kliniska konsekvenser. FANCB är X-bundet (den enda X-bundna komplementationsgruppen) – kvinnliga bärare har ingen förhöjd cancerrisk, men hemizygota män drabbas allvarligt. Patogena varianter av FANCD1 är bialleliska BRCA2 – dessa patienter har den allvarligaste FA-fenotypen, tidigast uppkommande benmärgsinsufficiens och högst ytterligare cancerrisker (medulloblastom, Wilms tumör). Bialleliska patogena varianter av FANCN är bialleliska PALB2. Bialleliska varianter av FANCJ är bialleliska BRIP1. Denna överlappning med kända ärftliga cancergener har konsekvenser för heterozygota familjemedlemmar – bärare av FANCD1/BRCA2, FANCN/PALB2 och FANCJ/BRIP1 har heterozygot cancerrisk.
Patogena varianter av FANCD1 är bialleliska BRCA2 – den allvarligaste formen av FA med tidigast insjuknande i cancer, inklusive medulloblastom hos barn och Wilms tumör. Bärare är BRCA2-heterozygoter med förhöjd risk för bröst- och äggstockscancer.
23 komplementationsgrupper kräver att 23 gener analyseras samtidigt. Sekventiell testning av enstaka gener eller begränsade genpaneler är opraktiskt. Hela genomsekvensering identifierar alla FA-gener i ett enda test, vilket möjliggör en snabb klassificering i komplementationsgrupper.
Testning av kromosombrott diagnostiserar FA – men inte vilket gen det rör sig om, vilket är nödvändigt för planeringen av en transplantation
Den diagnostiska guldstandarden för Fanconis anemi är testet för kromosombrott (med diepobutan eller mitomycin C), vilket påvisar den karakteristiska defekten i DNA-reparationen vid FA men inte identifierar vilken komplementationsgrupp eller vilket gen som är ansvarigt. Bestämning av komplementationsgrupp – som historiskt sett har gjorts genom cellfusionsförsök – krävs för utformning av HSCT-konditioneringsprotokoll (vissa grupper kräver anpassade protokoll), planering av intensiteten i cancerövervakningen (FANCD1/FANCD2 påverkar riskprofilen) och familjekaskadtestning (för att identifiera vilka släktingar som kan bära på heterozygota varianter som ökar risken för cancer). Hela genomsekvensering utvärderar samtidigt alla 23 FA-komplementationsgruppgener, vilket ger en snabb komplementationsgruppstilldelning från ett enda DNA-prov.
Personer i familjen som är heterozygota för FA-genen kan ha en ärftlig cancerrisk som kräver särskild uppföljning
Familjer med FA-patienter innehåller obligatoriska heterozygota bärare. När FA-komplementationsgruppen omfattar BRCA2 (FANCD1), PALB2 (FANCN), BRIP1 (FANCJ) eller BRCA1 (FANCS), bär heterozygota familjemedlemmar på en risk för ärftlig bröst- och äggstockscancer som kräver särskild övervakning. En förälder till ett barn med FANCD1 som är obligatorisk BRCA2-heterozygot behöver omedelbar BRCA2-positiv ärftlig cancerbehandling – årlig MR-undersökning av brösten, NCCN-övervakningsprotokoll, övervägande av riskreducerande kirurgi. Att identifiera FA-komplementationsgruppen genom helgenomsekvensering leder direkt till lämplig ärftlig cancerrådgivning för alla förstegradssläktingar som är obligatoriska bärare.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för Fanconis anemi och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
