Familjär melanom — Funktionsförlust i CDKN2A-genen medför en livstidsrisk på 60–90 % för melanom och en förhöjd risk för bukspottkörtelcancer; detta avfärdas ofta som en kluster av cancerfall inom familjen snarare än att erkännas som ett ärftligt syndrom.
Vid helgenomsekvensering avläses hela CDKN2A-genen – som kodar för två olika tumörsuppressorer (p16/INK4a och p14/ARF) genom alternativa läsramar – vilket gör det möjligt att identifiera alla varianter, inklusive de omarrangemang som inte upptäcks vid standardpanelsekvensering.
Familjärt melanom — CDKN2A
Familjärt atypiskt syndrom med multipla födelsemärken och melanom (FAMMM) är ett autosomalt dominant ärftligt syndrom som ökar risken för cancer och som oftast orsakas av patogena variationer i CDKN2A-genen på kromosom 9p21.3. CDKN2A kodar för två olika tumörsuppressorproteiner genom alternativa läsramar: p16/INK4a (kodat av exonerna 1α, 2 och 3), som hämmar CDK4/6 och förhindrar cellcykelprogression, och p14/ARF (kodat av exonerna 1β, 2 och 3), som stabiliserar p53. Patogena varianter i CDKN2A står för cirka 20–40 % av familjerna med tre eller fler fall av melanom och förekommer hos en betydande andel av individer med flera primära melanom. Patogena varianter av CDK4 orsakar ett nästan identiskt kliniskt syndrom hos en minoritet av fallen av familjärt melanom.
Livstidsrisken för melanom hos bärare av patogena CDKN2A-varianter varierar från cirka 28–67 % i regioner med låg förekomst till 58–92 % i regioner med hög UV-exponering (framför allt Australien). Medianåldern vid den första melanomdiagnosen hos CDKN2A-bärare är betydligt lägre än hos den allmänna befolkningen, och förekomsten av flera primära melanom under bärarens livstid är hög. Bärare av CDKN2A löper också en väsentligt förhöjd risk för bukspottkörtelcancer – uppskattad till 11–17 % under livstiden – särskilt när det finns en familjehistoria av bukspottkörtelcancer. Bärare med p14/ARF-specifika varianter (som endast påverkar exon 1β) kan ha en isolerad predisposition för bukspottkörtelcancer utan risk för melanom.
Trots den dramatiskt höga livstidsrisken för melanom är familjär melanom i betydande utsträckning underdiagnostiserad. Vårdcentraler och hudkliniker möter ofta patienter med flera förstegradssläktingar som har drabbats av melanom, vilka får höra att det handlar om ”dålig tur i familjen” eller helt enkelt får allmänna råd om solskydd utan att remitteras för genetisk testning. NCCN:s riktlinjer för melanom rekommenderar genetisk utvärdering för personer med tre eller fler invasiva melanom i en och samma familj, flera primära melanom hos en och samma person, eller en familj med ett eller flera melanom samt ett fall av bukspottkörtelcancer. Bekräftade CDKN2A-bärare behöver årlig helkroppsundersökning av huden, dermatoskopi var sjätte månad och övervakning av bukspottkörteln – ett strukturerat protokoll som kräver molekylär bekräftelse för att kunna genomföras.
CDKN2A kodar för två proteiner genom alternativa läsramar. Variationer i exon 1β påverkar endast p14/ARF, vilket medför en ökad risk för bukspottkörtelcancer utan att det medför någon risk för melanom. Variationer i exon 1α samt exon 2–3 påverkar p16/INK4a och medför vanligtvis en ökad risk för både melanom och bukspottkörtelcancer.
Standardpaneler för melanom använder begränsade sekvenseringsmetoder för CDKN2A som inte upptäcker stora omarrangemang och varianter med alternativa läsramar. Hela genomsekvensering kartlägger den fullständiga strukturen hos CDKN2A, inklusive både p16/INK4a- och p14/ARF-läsramarna.
Två proteiner, två läsramar – vid standardsekvensering av exoner kanske inte båda utvärderas korrekt
CDKN2A är unik genom att den kodar för två tumörsuppressorproteiner från en enda genomisk lokus via alternativa första exoner: exon 1α (för p16/INK4a) och exon 1β (för p14/ARF). Standardpaneler för ärftlig cancer sekvenserar vanligtvis CDKN2A:s kodande exoner i p16/INK4a-läsramen. Variationer som specifikt påverkar p14/ARF-läsramen – särskilt i exon 1β – kan missas om panelens utformning inte uttryckligen täcker detta alternativa första exon. Sådana variationer medför en predisposition för bukspottkörtelcancer som kan missas i en panel utformad med fokus på melanom. Hela genomsekvensering täcker hela 9p21 CDKN2A-lokuset, inklusive båda alternativa första exonerna och hela den regulatoriska regionen.
Risken för bukspottkörtelcancer hos familjer med CDKN2A-mutationer kräver särskild övervakning som inte ingår i den vanliga uppföljningen av melanom
Bärare av CDKN2A-mutationen som identifierats genom en familj med fall av melanom får eventuellt inte information om sin parallella risk på 11–17 % för bukspottkörtelcancer om de inte uttryckligen är medvetna om denna dubbla fenotyp. Nuvarande riktlinjer för CDKN2A-bärare med en familjehistoria som tyder på risk för bukspottkörtelcancer rekommenderar årlig övervakning av bukspottkörteln från 40–45 års ålder med endoskopisk ultraljudsundersökning eller MR/MRCP – samma övervakning som rekommenderas för bärare av BRCA2- och ATM-gener som medför risk för bukspottkörtelcancer. Detta protokoll för övervakning av bukspottkörteln inleds endast när CDKN2A-diagnosen är fastställd och det kliniska teamet är medvetet om den dubbla cancerrisken. Hela genomsekvensering identifierar patogena CDKN2A-varianter i samband med en omfattande cancerriskbedömning.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för familjär melanom (CDKN2A) och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
