Familjär adenomatös polypos – hundratals till tusentals kolorektala polyper orsakade av funktionsförlust i APC-genen, vilket nästan med säkerhet leder till cancer om kirurgiskt ingrepp inte sker.
Vid helgenomsekvensering avläses den fullständiga sekvensen av APC-genen – inklusive djupa intronregioner, stora deletioner och mosaikvarianter som standardpaneler för ärftlig cancer systematiskt missar att upptäcka.
Familjär adenomatös polypos
Familjär adenomatös polypos (FAP) är ett autosomalt dominant ärftligt kolorektalt cancersyndrom som orsakas av patogena varianter i tumörsuppressorgenen APC (adenomatous polyposis coli) på kromosom 5q22.2. Klassisk FAP kännetecknas av att hundratals till tusentals adenomatösa polyper utvecklas i hela tjocktarmen och tunntarmen, vilket vanligtvis uppträder under 20-årsåldern. Utan kirurgiskt ingrepp är kolorektal cancer praktiskt taget oundviklig vid 50 års ålder – livstidsrisken för kolorektal cancer närmar sig 100 % vid obehandlad klassisk FAP. FAP står för cirka 0,5–1 % av alla fall av kolorektal cancer och beräknas drabba 1 av 5 000 till 1 av 10 000 individer.
Attenuerad FAP (AFAP) är en mildare fenotypisk variant som orsakas av mutationer i specifika APC-regioner (5'-änden, exon 9 eller 3'-änden) och kännetecknas av färre polyper (10–100), senare debut av polypbildning, lägre men ändå betydligt förhöjd risk för kolorektal cancer samt mer varierande uttryck. Korrelationer mellan genotyp och fenotyp vid FAP är väl etablerade: variationer i kodonerna 1250–1464 (särskilt kodon 1309) är förknippade med tät polypos och tidigare kolorektal cancer; varianter vid kodonerna 1310–1330 och 1445–1580 är förknippade med en högre risk för desmoida tumörer; och varianter vid 5'-änden är förknippade med AFAP. Manifestationer utanför kolon – inklusive duodenala adenom (100 % livstidsrisk), sköldkörtelcancer, hepatoblastom (hos barn), desmoida tumörer, medfödd hypertrofi av näthinnans pigmentepitel (CHRPE) och osteom – varierar beroende på APC-variantens placering.
Cirka 20–30 % av fallen av klassisk FAP beror på de novo-varianter i APC-genen utan familjehistoria av polypbildning. Ytterligare 7–10 % av patienterna som uppfyller de kliniska kriterierna för FAP har inga påvisbara APC-varianter vid standardsekvensering – denna grupp kan bära på djupa introniska splicingvarianter, stora genomiska omarrangemang (deletioner, duplikationer) eller somatisk mosaik som inte kan upptäckas med standardiserade genpaneltester. MUTYH-associerad polypos (MAP), orsakad av bialleliska MUTYH-varianter, kan ge upphov till en fenotyp som är omöjlig att skilja från försvagad FAP och kräver samtidig MUTYH-genotypning hos APC-negativa polypospatienter.
Klassisk FAP, atenuated FAP (AFAP) och MUTYH-associerad polypbildning (MAP) ger upphov till kliniska bilder som överlappar varandra, men som har olika genetiska orsaker och kirurgiska konsekvenser. Placeringen av APC-varianten avgör risken för manifestationer utanför tjocktarmen.
Standardpaneler för ärftlig cancer analyserar APC-genens kodande exoner. De missar djupa intronvariationer, stora omarrangemang och mosaikmutationer – just de variationer som förklarar negativa testresultat hos kliniskt drabbade familjer.
Upp till 30 % av patienterna med kliniskt diagnostiserad FAP testar negativt för APC vid standardanalyser
Standardpaneler för ärftlig cancer sekvensbestämmer APC:s kodande region och splitsningsställen. De upptäcker inte på ett tillförlitligt sätt stora genomiska deletioner eller duplikationer som sträcker sig över flera exoner, djupa intronvariationer som skapar avvikande splitsningsställen, eller somatisk mosaik – där APC-varianten endast förekommer i en bråkdel av cellerna. Studier har visat att 7–10 % av patienter med klassisk FAP utan identifierad APC-kodande variant bär på djupa introniska eller strukturella omarrangemangsvarianter som endast kan detekteras genom omfattande genomisk analys. En ytterligare undergrupp bär på somatiska mosaik-APC-mutationer, där variantallelfraktioner på 10–20 % kan missas vid standardpanelsekvensering. Helgenomsekvensering med 30X täckning och analys av kopiantalsvariationer löser alla dessa problem.
APC-variantens lokalisering avgör vilken kirurgisk strategi som ska tillämpas och hur intensiv övervakningen ska vara
Den kirurgiska behandlingen av kolorektala tumörer vid FAP är inte enhetlig. Patienter med varianter i kodonerna 1250–1464 och tät polypos kräver vanligtvis en rekonstruktiv proktokolektomi med ileal pouch-anal anastomos. Patienter med AFAP eller gles polypos kan behandlas med segmentell kolektomi med ileorektal anastomos och endoskopisk övervakning. Riskstratifiering av desmoidtumörer – avgörande för den kirurgiska planeringen hos patienter med risk för intraabdominella desmoidtumörer – beror på APC-variantens placering vid kodonerna 1310–1580. Ingen av dessa genotyp-fenotyp-stratifieringar är möjlig utan en fullständig APC-genotyp, vilket kräver sekvensering av hela genen, inklusive regulatoriska och introniska regioner.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för familjär adenomatös polypos och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
