Dravets syndrom – en funktionsnedsättning i SCN1A-genen som orsakar svår epilepsi med tidig debut, där de vanligaste läkemedlen mot epilepsi förvärrar tillståndet.
Hela genomsekvensering kartlägger den fullständiga sekvensen av SCN1A-genen, vilket gör det möjligt att upptäcka mosaikvarianter och djupa intronvarianter som orsakar Dravets syndrom hos patienter vars genetiska bakgrund är oklar – och identifierar de farmakogenomiska kontraindikationerna som avgör vilka läkemedel som kan användas på ett säkert sätt och vilka som inte kan det.
Dravets syndrom
Dravets syndrom (DS) – tidigare kallat svår myoklonisk epilepsi hos spädbarn (SMEI) – är en allvarlig utvecklingsstörande och epileptisk encefalopati som debuterar under det första levnadsåret, vanligtvis hos ett tidigare friskt spädbarn. Sjukdomen kännetecknas av långvariga feber- och feberfria anfall (ofta kloniska eller hemikloniska), efterföljande polymorfa anfallstyper (myokloniska, frånvaroanfall, fokala) och en progressiv utvecklingsfördröjning som börjar under det andra levnadsåret. Dravets syndrom har en prevalens i befolkningen på cirka 1 av 15 000–22 000 födda och står för cirka 3–8 % av epilepsierna som debuterar under de tre första levnadsåren.
Patogena eller sannolikt patogena SCN1A-varianter identifieras hos cirka 70–85 % av de patienter som uppfyller de kliniska diagnoskriterierna för Dravets syndrom. SCN1A kodar för alfa-subenheten Nav1.1 i spänningsstyrda natriumkanaler, vilken är avgörande för de hämmande interneuronernas funktion. Funktionsförlust stör de GABAerga interneuronernas aktivering, vilket leder till avbruten hämning i hjärnbarken och överkänslighet. Cirka 95 % av de patogena SCN1A-varianterna vid Dravets syndrom är de novo (inte ärvda från en förälder). Patogena varianttyper inkluderar trunkeringar (nonsense, frameshift – cirka 40 %), splice-platsvarianter och missense-varianter (cirka 40 %); stora deletioner eller duplikationer står för cirka 2–3 % och kräver analys av kopiantalsvariationer för detektion.
SCN1A-genotypen har direkta, livsavgörande farmakogenomiska konsekvenser. Antiepileptiska läkemedel som hämmar natriumkanaler – däribland lamotrigin, karbamazepin, oxkarbazepin, fenytoin och vigabatrin – försämrar anfallskontrollen och kan utlösa epileptisk encefalopati hos SCN1A-positiva patienter genom att ytterligare minska Nav1.1-funktionen i hämmande interneuron. Denna kontraindikation gäller oavsett varianttyp. Behandlingar med etablerad evidens vid Dravets syndrom inkluderar valproat, klobazam, topiramat, stiripentol och (hos lämpliga patienter) fenfluramin och cannabidiol (Epidiolex). En oklart eller felaktigt ställd diagnos innebär att felaktiga läkemedel kan förskrivas under det kritiska fönstret då valet av läkemedel har störst inverkan på det långsiktiga utvecklingsresultatet.
Cirka 15–30 % av patienterna med en klinisk diagnos av Dravets syndrom är SCN1A-negativa vid standardpanelanalys. En del av dessa bär på djupa introniska, mosaik- eller strukturella SCN1A-varianter som kan påvisas genom helgenomsekvensering.
Standardpaneler för epilepsi upptäcker kodande SCN1A-varianter. De missar mosaikmutationer, djupa introniska splicingvarianter och stora strukturella omarrangemang, vilka står för en kliniskt betydande andel av de SCN1A-negativa fallen av Dravets syndrom.
Variationer i SCN1A-genen kräver en sekvenseringsdjup och -bredd som panelanalyser inte kan erbjuda
Somatisk mosaik – där den patogena SCN1A-varianten endast förekommer i en delmängd av cellerna – förklarar en del av de kliniska fallen av Dravets syndrom med negativa panelresultat. Mosaikvarianter med en allelfrekvens på 10–30 % kan förbises vid standardpanelsekvensering, där den kliniska känsligheten är optimerad för heterozygota varianter i könscellerna med en allelfraktion på cirka 50 %. Studier som använder djup helgenomsekvensering har identifierat mosaikvariationer av SCN1A hos 4–8 % av patienterna med Dravets syndrom som testats negativt i panelen. Djupa introniska SCN1A-variationer som skapar kryptiska splitsningsställen utgör en ytterligare kategori av patogena variationer som inte syns i panelen. Båda kräver bredden och djupet hos helgenomsekvensering för tillförlitlig detektion.
Resultatet av SCN1A-testet avgör vilka läkemedel mot epilepsi som är säkra att förskriva
Vid Dravets syndrom handlar valet av läkemedelsklass inte om optimering – det handlar om säkerhet. Natriumkanalblockerare är kontraindicerade vid funktionsnedsättning av SCN1A och har visat sig kunna utlösa förvärrade anfall, status epilepticus och i vissa fall akut encefalopatisk försämring. Flera fallserier har dokumenterat patienter med Dravets syndrom som förvärrades avsevärt efter insättning av lamotrigin eller karbamazepin innan den genetiska diagnosen fastställdes. Bekräftelse av en patogen variant av SCN1A ger en konkret genetisk grund för att undvika natriumkanalblockerare och inleda evidensbaserade DS-specifika behandlingar – ett beslut som har en akut inverkan på anfallsbördan och utvecklingsförloppet.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för Dravets syndrom och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
