Cowdens syndrom — en funktionsnedsättning i PTEN-genen som medför en av de högsta livstidsriskerna för bröstcancer bland alla ärftliga syndrom, samt en förhöjd risk för livmodercancer, sköldkörtelcancer, tjocktarms- och ändtarmscancer samt njurcancer.
PTEN finns med på ACMG:s SF v3.2-lista över gener som kräver rapportering av sekundära fynd vid klinisk genomsekvensering. Hela genomsekvensering kartlägger hela PTEN-lokuset – inklusive varianter i promotorregionen och stora deletioner som vanligtvis inte upptäcks vid standardiserade cancerpaneler.
Cowdens syndrom — PTEN-hamartomtumörsyndrom
Cowdens syndrom (CS) – det vanligaste av PTEN-hamartomtumörsyndromen (PHTS) – är ett autosomalt dominant ärftligt syndrom som ökar risken för cancer och orsakas av patogena variationer i PTEN-genen (fosfatas och tensinhomolog) på kromosom 10q23.31. PTEN är en tumörsuppressor som reglerar PI3K/AKT/mTOR-signalvägen; förlust av PTEN-funktionen leder till okontrollerad cellproliferation och tumörbildning. Cowdens syndrom kännetecknas av mukokutana lesioner (trichilemmom, papillomösa papler och akrala keratoser), makrocefali, godartade hamartom i flera organ och väsentligt förhöjd risk för flera maligniteter. Den uppskattade prevalensen är 1 på 200 000, även om molekylära diagnoser visar på en betydligt högre frekvens.
Livstidsrisken för cancer hos bärare av patogena PTEN-varianter är bland de högsta som dokumenterats för något ärftligt cancergen: risken för bröstcancer uppgår till 67–85 % (jämfört med cirka 12 % i genomsnitt i befolkningen); risken för livmodercancer ligger på 28–44 %; risken för sköldkörtelcancer (främst follikulär) uppgår till 21–38 %; risken för kolorektal cancer är förhöjd (9–18 %); och risken för njurcellscancer är cirka 34 %. Manliga bärare har en förhöjd risk för bröstcancer och löper även en förhöjd risk för sköldkörtel- och kolorektalcancer. Bannayan-Riley-Ruvalcaba-syndromet (BRR) och Proteus-syndromet (PS) är alleliska PTEN-sjukdomar med överlappande men distinkta kliniska drag, som alla orsakas av patogena PTEN-varianter.
Cirka 25 % av de personer som uppfyller de kliniska diagnoskriterierna för Cowdens syndrom har ingen identifierbar variant i PTEN-kodningssekvensen – denna grupp kan bära på varianter i PTEN-promotorregionen, djupa intronvarianter, stora genomiska omarrangemang eller patogena varianter i andra PHTS-associerade gener (SDHB, SDHD, KLLN). NCCN-riktlinjerna rekommenderar en omfattande PTEN-analys, inklusive testning av deletioner/duplikationer, som en del av en fullständig PHTS-utvärdering. Behandlingen av bekräftade PTEN-bärare omfattar årlig MR-undersökning av brösten från 30 års ålder, årliga mammografier från 30–35 års ålder, övervägande av riskreducerande mastektomi, årlig endometrialprovtagning från 30–35 års ålder och årlig ultraljudsundersökning av sköldkörteln.
Tumörsyndrom associerade med PTEN-hamartom omfattar Cowdens syndrom, Bannayan-Riley-Ruvalcabas syndrom, Proteus syndrom och Proteus-liknande syndrom – alleliska tillstånd med överlappande men kliniskt åtskiljbara symtom, vilka alla orsakas av patogena varianter av PTEN-genen.
Variationer i PTEN-promotorn och stora genomiska omarrangemang står för upp till 25 % av fallen av PHTS – variationer som systematiskt förbises av standardpaneler för ärftlig cancer, eftersom dessa endast sekvensbestämmer PTEN:s kodande exoner.
Variationer i PTEN-promotorregionen utesluts från de flesta cancerpanelernas utformning
Patogena varianter i PTEN-promotorregionen – särskilt en återkommande c.-1019_-1018dupTA-variant – har identifierats hos patienter med Cowdens syndrom som testar negativt vid standardiserad exonsekvensering av PTEN. Dessa varianter minskar PTEN-transkriptionen, vilket leder till funktionell haploinsufficiens utan att den kodande sekvensen förändras. Standardpaneler för cancer sekvenserar endast de 9 kodande exonerna i PTEN och de kanoniska splitsningsställena; de inkluderar inte promotorregionen eller intergena regulatoriska element. Hela genomsekvensering läser av hela PTEN-lokuset, inklusive promotorn, alla introner och 3'-UTR – de regioner där regulatoriska patogena varianter finns.
För att kunna hantera risken för flera olika cancerformer krävs det att PTEN-statusen fastställs så tidigt som möjligt
Risken för PTEN-relaterad cancer är bland de högsta av alla ärftliga syndrom, och uppföljningen måste inledas redan i 30-årsåldern – innan de flesta fall av bröstcancer och livmodercancer i denna patientgrupp kan upptäckas kliniskt. NCCN rekommenderar årlig MR-undersökning av brösten och mammografi från 30 års ålder, med övervakning av livmodercancer från 30–35 års ålder. Detta aggressiva övervakningsschema motiveras av livstidsriskdata, men kräver en bekräftad patogen PTEN-variant för att kunna genomföras. Ett negativt resultat på en ofullständig panel – en som inte utvärderat PTEN-promotorn eller strukturella omarrangemang – kan ge en falsk trygghet som fördröjer nödvändig övervakning med flera år.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Learn more →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för Cowdens syndrom – PTEN-hamartomtumörsyndrom och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor