BAP1-tumörpredispositionssyndrom – ett nyligen beskrivet ärftligt cancersyndrom med hög penetrans, där en genvariant ökar risken för fyra olika cancerformer samtidigt, varav många är extremt sällsynta i den allmänna befolkningen.
Genomsekvensering av hela genomet identifierar patogena varianter av BAP1 – som finns med på ACMG SF v3.2-listan – vid ett syndrom där ett enda genetiskt resultat utlöser övervakning av uvealt melanom, mesoteliom, hudmelanom och njurcellscancer.
BAP1-tumörpredispositionssyndrom
BAP1-tumörpredispositionssyndrom (BAP1-TPDS) är ett autosomalt dominant ärftligt cancersyndrom som orsakas av patogena variationer i BAP1-genen (BRCA1-associerat protein 1) på kromosom 3p21.1. BAP1 är ett deubiquitylas som spelar en roll i kromatinomformning, respons på DNA-skador och kontroll av cellcykeln. Patogena varianter i BAP1 i könscellerna har systematiskt karakteriserats först från och med 2011 – syndromet är relativt nyligen beskrivet, vilket innebär att många drabbade familjer har ackumulerat flera ovanliga cancerformer i generationer utan någon ärftlig förklaring. BAP1-TPDS erkänns nu som ett syndrom med hög penetrans och predisposition för flera tumörer.
Spektrumet av tumörer vid BAP1-TPDS är karakteristiskt – bärare löper avsevärt förhöjd risk för: uvealt melanom (ögonmelanom som drabbar åderhinnan, iris och ciliarkroppen; >50 gånger högre än risken i allmänheten), malignt pleuralmesoteliom (en sällsynt cancerform som är starkt förknippad med exponering för asbest, men som nu även konstaterats förekomma hos BAP1-bärare med minimal eller ingen exponering för asbest), hudmelanom (flera primära melanom, ofta med distinkta melanocytiska, BAP1-muterade, atypiska intradermala tumörer – ”BAPom”-lesioner) och njurcellscancer (särskilt subtyperna klarcellscancer och kromofob cancer). Var och en av dessa cancerformer är enskilt sett ovanlig; deras samtidiga förekomst i en familj är det epidemiologiska tecknet som identifierade BAP1-TPDS.
De kliniska konsekvenserna av en molekylär diagnos av BAP1 är omedelbara och berör flera specialiteter. Årlig ögonundersökning inklusive fundoskopisk utvärdering (övervakning av uvealt melanom), årlig dermatologisk undersökning med dermatoskopi (övervakning av hudmelanom och BAP-om), bilddiagnostik av njurarna med start i 30-40-årsåldern (övervakning av RCC), övervägande av årlig bilddiagnostik av bröstkorgen (övervakning av mesoteliom hos exponerade bärare) samt kaskadtestning av alla släktingar i första ledet inleds vid diagnos. Det är viktigt att notera att BAP1-associerat mesoteliom erkänns som en klinisk enhet som skiljer sig från asbestinducerat mesoteliom — patienter med BAP1-mesoteliom tenderar att vara yngre, har längre överlevnad efter diagnos och kan ha olika profiler för respons på kemoterapi.
BAP1 erkändes som ett gen för ärftlig cancer först efter 2011 och ingår inte i många äldre testpaneler för ärftlig cancer. Familjer med uvealt melanom, mesoteliom eller ovanliga cancerkluster kan ha BAP1-TPDS utan att någonsin ha genomgått lämpliga tester.
BAP1 saknas i äldre paneler för ärftlig cancer – familjer med ovanliga cancerfall har aldrig testats
Den systematiska kartläggningen av BAP1-TPDS inleddes först 2011. Många familjer med patogena BAP1-varianter genomgick under det föregående decenniet genetiska cancerpaneler som inte inkluderade BAP1. Personer med familjehistoria som inkluderar uvealt melanom, mesoteliom eller ovanlig klustring av melanom och njurcancer – det huvudsakliga BAP1-tumörspektrumet – kan ha fått negativa panelresultat från tester före 2011 eller från paneler som aldrig lade till BAP1 i sin genlista. Hela genomsekvensering utvärderar hela genomet och identifierar patogena BAP1-varianter oavsett när sekvenseringen utfördes, utan begränsning till en fördefinierad genlista.
Ett bekräftat BAP1-resultat utlöser fyra övervakningsprotokoll för cancer samtidigt
Till skillnad från ärftliga cancersyndrom, där ett enda gen främst ökar risken för en viss cancerform, kräver BAP1-TPDS samordnad övervakning av fyra olika cancerformer – uvealt melanom (oftalmologi), hudmelanom (dermatologi), njurcellscancer (urologi/radiologi) och mesoteliom (pulmonologi/onkologi). Denna samordning mellan flera specialiteter inleds vid den första molekylära diagnosen och fortsätter årligen under hela livet. Varje övervakningsmetod riktar sig mot en cancerform som inte ingår i standardiserad befolkningsscreening – inget befintligt allmänt cancerscreeningprogram täcker uvealt melanom, och screening för mesoteliom är inte standard hos odiagnostiserade BAP1-bärare. En molekylär diagnos är en förutsättning för att aktivera detta nätverk för övervakning av flera organ.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för BAP1-tumörpredispositionssyndrom och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
