Risk för ärftlig cancer vid ATM — ett gen som reglerar reparationen av DNA-skador och som finns med på ACMG:s lista över sekundära fynd. Det medför en förhöjd risk för bröst-, bukspottkörtel- och prostatacancer samt påverkar direkt känsligheten för PARP-hämmare och platinabaserad kemoterapi.
Vid helgenomsekvensering läses alla 66 ATM-exoner av samtidigt – det enda sättet att på ett tillförlitligt sätt identifiera hela spektrumet av ATM-varianter, inklusive stora deletioner och djupa intronvarianter som standardpaneler för cancer systematiskt underskattar.
Risk för ärftlig cancer hos ATM
ATM (ataxia-telangiectasia mutated) kodar för ett serin-treoninproteinkinas som är en huvudregulator för responsen på dubbelsträngsbrott i DNA. Bialleliska patogena ATM-varianter orsakar ataxia-telangiectasia (AT), en sällsynt allvarlig multisystemsjukdom som kännetecknas av cerebellär ataxi, okulomotorisk apraxi, immunbrist, telangiektasier och markant förhöjd cancerrisk – särskilt lymfoida maligniteter. Heterozygota patogena ATM-varianter, som förekommer hos cirka 0,5–1 % av den allmänna befolkningen, är förknippade med ett mindre allvarligt men kliniskt signifikant cancerpredispositionssyndrom som först under de senaste åren har kunnat karakteriseras exakt genom storskaliga populationsgenomikstudier.
Heterozygota bärare av ATM-mutationen har en uppskattad livstidsrisk för bröstcancer på 20–25 % (jämfört med cirka 12 % i genomsnitt för befolkningen), och enligt NCCN:s riktlinjer rekommenderas förstärkt bröstcancerövervakning (årlig MR-undersökning av brösten från 40 års ålder) för drabbade personer. ATM-bärare löper också en förhöjd risk för bukspottkörtelcancer (cirka 5–7 % under livstiden, jämfört med ~1,5 % i genomsnitt för befolkningen), förhöjd risk för prostatacancer hos män (särskilt höggradig sjukdom) och potentiellt förhöjd risk för kolorektal cancer och äggstockscancer. ATM ingår nu i ACMG SF v3.2:s lista över sekundära fynd, vilket återspeglar konsensus om att det är motiverat med konkreta förändringar i den kliniska hanteringen för identifierade bärare.
ATM har direkta konsekvenser som sträcker sig bortom riskklassificering av cancer – det är en teranostisk biomarkör. Cancerformer som uppstår hos patienter med ATM-brist kan vara särskilt känsliga för läkemedel som utnyttjar brister i DNA-reparationsvägarna: PARP-hämmare, platinabaserad kemoterapi och ATM-kinashämmare som för närvarande prövas i kliniska studier. ATM-status i könscellerna ligger nu till grund för beslut om cancerbehandling – olaparib är godkänt av FDA för metastaserad kastrationsresistent prostatacancer hos patienter med patogena ATM-varianter, och kliniska prövningar utvärderar kombinationer av PARP-hämmare för bukspottkörtelcancer hos ATM-bärare. Denna dubbla roll – hantering av ärftlig cancerrisk och val av behandling – gör en fullständig ATM-genotypning alltmer angelägen.
ATM är ett gen med 66 exoner och över 3 000 dokumenterade varianter. Många av de rapporterade ATM-varianterna är varianter av oklar betydelse – för att kunna tolka dem korrekt krävs en fullständig gensekvensering i sitt funktionella sammanhang.
ATM-genen har 66 exoner och tusentals varianter – begränsade testpaneler missar ofta sällsynta patogena alleler
ATM-genen är en av de största generna som ökar risken för cancer; den sträcker sig över 150 kilobaser och består av 66 kodande exoner. Över 3 000 sekvensvarianter av ATM har dokumenterats, varav majoriteten är missense-varianter av osäker betydelse. Trunkerande varianter (nonsense, frameshift, väsentliga splitsningsställen) klassificeras definitivt som patogena när de identifieras. Stora ATM-deletioner – som endast kan detekteras genom analys av kopiantalsvariationer – står för en betydande andel av de patogena ATM-varianterna i fall av familjär cancer och detekteras inte på ett tillförlitligt sätt genom standardpanelsekvensering. Helgenomsekvensering täcker alla 66 exoner med samtidig analys av kopiantalsvariationer, vilket ger en fullständig bild av hela spektrumet av ATM-varianter.
ATM-status i könscellerna avgör nu om patienter med prostatacancer är lämpliga för behandling med PARP-hämmare
FDA har godkänt olaparib (Lynparza) och rucaparib (Rubraca) för behandling av metastaserad kastrationsresistent prostatacancer hos patienter med patogena ATM-varianter, i kombination med BRCA1/2-varianter. Detta godkännande innebär att genomprovning av ATM direkt möjliggör behandling för prostatacancerpatienter – en patient som testar positivt för ATM vid en fullständig genanalys kan komma i fråga för monoterapi med PARP-hämmare istället för kemoterapi. Kliniska prövningar utvärderar också PARP-hämmare specifikt vid ATM-positiv pankreascancer i könscellerna (ett tillstånd med mycket få godkända behandlingsalternativ). Fullständig ATM-genotypning – inte en partiell panel som kan missa sällsynta trunkeringar eller strukturella varianter – krävs för en korrekt bestämning av statusen som somatisk eller i könscellerna och för bedömning av behandlingsbehörighet.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för ärftlig cancerrisk vid ATM och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
