Överkänslighet mot abakavir — HLA-B*57:01, den variant som gör att abakavir fungerar som HIV-behandling för de flesta, men som kan orsaka en potentiellt livshotande överkänslighetsreaktion hos de 5–8 % av européerna som bär på den.
Hela genomsekvensering ger en fullständig HLA-klass I-typning – inklusive allelen HLA-B*57:01, som FDA kräver att man screenar för innan abakavir förskrivs – tillsammans med alla andra HLA-alleler som är relevanta för farmakogenomik.
Överkänslighet mot abakavir — HLA-B*57:01
Abakavir (Ziagen) är en nukleosidbaserad revers transkriptashämmare (NRTI) som används som en central komponent i kombinerad antiretroviral behandling av hiv-infektion. Cirka 5–8 % av patienterna som ordinerats abakavir utan föregående HLA-B*57:01-screening utvecklar en potentiellt livshotande överkänslighetsreaktion (HSR) som kännetecknas av feber, utslag, gastrointestinala symtom och allmän sjukdomskänsla och som börjar inom de första 6 veckorna av behandlingen. Hos patienter som utvecklar HSR och sedan oavsiktligt utsätts för abakavir igen – till exempel om diagnosen inte var tydligt dokumenterad – kan reaktionen bli allvarlig och snabbt leda till döden, med akut hypotension och multiorgansvikt.
Sambandet mellan HLA-B*57:01 och överkänslighet mot abakavir är ett av de starkaste farmakogenomiska sambanden inom medicinen. HLA-B*57:01-bärare som får abakavir har en risk på cirka 50–60 % att utveckla HSR, jämfört med cirka 0–1 % hos icke-bärare. Mekanismen innebär att HLA-B*57:01-proteinet presenterar abakavir eller dess metaboliter som en del av peptidbindningsspåret för CD8+ T-celler, vilket utlöser en polyklonal cytotoxisk T-cellsreaktion. HLA-B*57:01 förekommer hos cirka 5–8 % av personer med europeiskt ursprung, 1–3 % av personer med afrikanskt ursprung och mindre än 1 % av personer med asiatiskt ursprung, vilket gör screening särskilt betydelsefullt i HIV-populationer med europeiskt ursprung.
FDA införde 2008 en varning i ramtext för abakavir som kräver screening för HLA-B*57:01 före eller vid inledandet av behandling med abakavir. WHO:s riktlinjer för hiv-behandling rekommenderar likaså screening för HLA-B*57:01 före användning av abakavir. Införandet av allmän screening före behandling har minskat förekomsten av immunologiskt bekräftade abakavir-relaterade överkänslighetsreaktioner med cirka 50 %. Testet är standard vid HIV-behandling i USA, EU och i allt större utsträckning även i låg- och medelinkomstländer. HLA-B*57:01 är också förknippat med flucloxacillin-inducerad leverskada och risk för överkänslighet mot karbamazepin, vilket gör fullständig HLA-typning – som tillhandahålls genom helgenomsekvensering – mycket värdefull för patienter med komplexa medicineringsregimer.
Det finns kommersiella tester som endast mäter HLA-B*57:01, och dessa utgör standardbehandling före behandling med abakavir. Det som helgenomsekvensering tillför är en omfattande HLA-typning – som i ett enda test täcker HLA-B*15:02, HLA-B*58:01 och andra kliniskt relevanta HLA-alleler vid sidan av B*57:01.
En fullständig HLA-typning omfattar flera livsviktiga alleler för läkemedelsöverkänslighet i ett enda resultat
HLA-B*57:01 är bara en av flera HLA-alleler som har dokumenterade kopplingar till läkemedelsöverkänslighet. HLA-B*15:02 (karbamazepin-SJS/TEN hos sydostasiatiska populationer), HLA-B*58:01 (allopurinol-SJS/TEN), HLA-B*57:01 (flucloxacillin-leverskada) och HLA-A*31:01 (överkänslighet mot karbamazepin hos européer) är alla kliniskt användbara alleler med tydliga geografiska fördelningar och läkemedelsspecifika kopplingar. En patient som får flera läkemedel kan ha flera relevanta HLA-farmakogenomiska överväganden. Hela genomsekvensering utför fullständig högupplöst HLA-typning av klass I och II – vilket ger den fullständiga HLA-farmakogenomiska profilen i ett enda test istället för att beställa separata enkelalleltester för varje relevant läkemedel.
HLA-B*57:01-status är ett bestående resultat – samma genom som förutsäger risken vid behandling med abakavir ligger också till grund för förskrivningsbeslut under hela livet
Till skillnad från många kliniska laboratorieresultat som kräver regelbundna omprov fastställs HLA-genotypen vid födseln och förändras aldrig. Ett HLA-B*57:01-resultat som erhållits en gång – oavsett om det kommer från ett riktat test eller helgenomsekvensering – är giltigt livet ut. Kontraindikationen för förskrivning av abakavir gäller oavsett HIV-behandlingsstadium eller komorbiditeter. För patienter med HIV som kan byta behandlingsregim under många år säkerställer en permanent dokumentation av HLA-genotypen i journalen att abakavirhaltiga regimer undviks vid varje framtida behandlingsbeslut utan att upprepade tester krävs.
Hela din DNA (inte bara en del av den)
Traditionella genetiska tester undersöker endast begränsade genuppsättningar, vilket innebär att de flesta delar av ditt genom utelämnas. Vi sekvenserar hela ditt genom – varje gen och varje område mellan generna.
Omfattande insikter och specialiserade rapporter
Lättläst och med svar som du och din läkare kan agera utifrån. Inget dokument som måste tolkas – över 200 kliniska rapporter, indelade efter kategori.
Ditt prov blir mer värdefullt för varje år
Ditt DNA förändras inte, men genomforskningen går allt snabbare. Varje månad upptäcks nya samband mellan varianter och sjukdomar. Vi granskar dessa resultat och uppdaterar dina rapporter automatiskt. Ditt test blir mer värdefullt för varje år.
De resultat som läkarna uppnår i sina svåraste fall.
Fyrtio år av ovisshet. Ett enda prov.
En patient hade tillbringat årtionden inom den brittiska sjukvården utan att få någon diagnos. Data från Dante, som godkänts av NHS:s kliniska team vid Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifierade Noonans syndrom och en RUNX1-variant kopplad till leukemi som tidigare hade förblivit oupptäckt. Efter 40 år fick de äntligen ett svar.
En fullständig genomläsning ger en fullständig bild.
En patient kom till Dante för att undersöka periodisk förlamning. Genom att analysera hela genomet upptäcktes ett samtidigt ärftligt hjärtproblem – Brugadas syndrom – vilket patientens läkare bekräftade med ett EKG. Resultatet förklarade också en familjemedlems tidigare oklar hjärthistoria. Ett enda test. Alla svar finns där.
Sekvenserades 2019. Data bearbetades 2021.
Jennifer sekvenserade sitt genom med hjälp av Dante två år innan hon fick sin bröstcancerdiagnos. När behandlingen inleddes visade Dantes farmakogenomiska data att den kemoterapi som hade ordinerats henne skulle orsaka allvarliga biverkningar. Hennes läkare valde ett alternativ – och hon kunde påbörja en effektiv behandling redan från första dagen.
Varje fråga om genetik förtjänar ett uttömmande svar.
Oavsett om du söker svar idag eller vill värna om din hälsa inför framtiden, är en fullständig kartläggning av hela ditt genom den enda rätta utgångspunkten.
Det ligger i släkten. Nu kan du ta reda på om det ligger i dina gener.
Ditt genom innehåller ärftliga variationer som är kopplade till sjukdomar såsom hjärtsjukdomar, cancer och neurologiska sjukdomar. Vi analyserar dem alla – med den kliniska djupgående kunskap som krävs för att ge resultatet en meningsfull tolkning.
Läs mer →När de traditionella laboratorietesterna visar att du mår bra. Men du vet att det inte stämmer.
Vanliga diagnostiska tester letar efter ett förutbestämt antal svar. Vi sekvenserar hela ditt DNA – även de delar som inget test är utformat för att undersöka. Om svaret finns i ditt genom hjälper vi dig att hitta det.
Läs mer →Din diagnos kan vara korrekt. Din behandlingsplan kan vara ofullständig.
Dina gener avgör vilka behandlingar som har störst chans att fungera – och vilka som inte gör det. Vi förser din läkare med verktyg och kunskap som underlag för din behandlingsplan.
Läs mer →Du vill veta det innan något tvingar fram frågan.
Vissa väntar inte på en diagnos eller information om familjehistoriken innan de agerar. Hela genomsekvensering ger dig en fullständig genetisk bild redan nu – så att du och din läkare kan fatta välgrundade beslut innan situationen blir akut.
Läs mer →Du har redan gjort ett DNA-test. Här är vad det inte kunde avslöja.
De flesta DNA-tester för privatpersoner analyserar mindre än 0,1 % av ditt genom. Vi analyserar hela genomet.
Läs mer →Resultat av klinisk kvalitet. Ett förstahandsval för privatpersoner och en pålitlig partner för läkare i de mest komplexa fallen.
Dante Genome Test hjälpte specialister vid ett nationellt akutsjukhus i Storbritannien att diagnostisera Noonans syndrom samt en sällsynt genetisk variant kopplad till leukemi som tidigare inte hade upptäckts. Detta resultat förändrade den medicinska vården för patienten.
Godkänd av och publicerad i
Vanliga frågor om helgenomsekvensering.
Vad är skillnaden mellan helgenomsekvensering och ett riktat gentest?
Riktade genetiska tester – inklusive standardpaneler för ärftlig cancer – analyserar en fördefinierad lista över kända varianter i en specifik uppsättning gener. De är utformade för att hitta det man redan vet att man ska leta efter. Hela genomsekvensering analyserar hela ditt genom: alla 6 miljarder baspar, varje gen, varje region mellan generna. En studie från Mayo Clinic publicerad i JAMA Oncology fann att standardriktlinjerna för testning missade mer än hälften av patienterna med ärftliga cancermutationer. Genometestet har ingen fast lista.
Vad får jag när mina provsvar är klara?
Dante Genome tillhandahåller över 200 läkarvänliga rapporter indelade efter klinisk kategori – ärftlig cancer, hjärtsjukdomar, sällsynta sjukdomar, farmakogenomik, bärarstatus och mycket mer. Rapporterna levereras till din säkra Genome Manager och är utformade för direkt klinisk användning. Dina genomdata sparas permanent och analyseras om automatiskt i takt med den vetenskapliga utvecklingen.
Vad händer om en kliniskt signifikant variant upptäcks?
Om en patogen eller sannolikt patogen variant identifieras kommer den att tydligt markeras i din läkaranpassade rapport, tillsammans med klinisk bakgrund, publicerad forskning och rekommenderade nästa steg. Vi rekommenderar att du delar alla kliniskt betydelsefulla fynd med din läkare eller en genetisk rådgivare, som kan ge vägledning om beslut gällande uppföljning, riskminimering eller vidareundersökningar av familjemedlemmar.
Hur skiljer sig detta från ett DNA-test för privatpersoner som 23andMe eller AncestryDNA?
DNA-tester för konsumenter använder genotypningschips som avläser mindre än 0,1 % av ditt genom – en mycket liten, i förväg utvald uppsättning vanliga varianter. De är optimerade för härkomst och egenskaper på populationsnivå, inte för kliniska genetiska fynd. Dante Genome Test sekvenserar 100 % av ditt genom med 30X täckning, samma standard som används inom klinisk diagnostik. De två testerna är inte jämförbara vad gäller omfattning, metodik eller klinisk nytta.
Hur lång tid tar det innan man ser resultat, och hur presenteras de?
Ditt provtagningskit skickas inom 48 timmar efter beställningen. När ditt prov anländer till vårt CLIA-certifierade laboratorium tar sekvensering och analys 6–8 veckor. Resultaten skickas på ett säkert sätt till din Genome Manager, där du kan ta del av dina rapporter, dela dem med din läkare och få automatiska uppdateringar när nya fynd valideras mot ditt genom.
Vi samarbetar med patientorganisationer över hela världen.
Dante Labs samarbetar med patientorganisationer av alla storlekar – för överkänslighet mot abakavir – HLA-B*57:01 och andra sjukdomar, både sällsynta och vanliga. Vi stöder organisationer i alla länder, inklusive virtuella patientorganisationer.
Vi kan erbjuda skräddarsydda rapporter, grupprabatter och paket anpassade efter era medlemmar. Kontakta oss via formuläret så hör vi av oss inom två arbetsdagar.
- Skräddarsydda genomrapporter för dina medlemmar
- Grupprabatter och skräddarsydda paket
- Vilket land som helst – inklusive virtuella grupper
- Sällsynta och vanliga sjukdomar som omfattas
Meddelandet mottaget.
Vi hör av oss inom två arbetsdagar. Om du vill kontakta oss direkt: hello@dantelabs.com
Ett test.
Svar för hela livet.
Ett kit som skickas hem till dig. Hela ditt genom sekvenseras enligt den kliniska standard som används vid diagnostiska beslut. Över 200 läkarvänliga rapporter levereras till din Genome Manager inom 6–8 veckor – de är permanenta och uppdateras i takt med vetenskapens framsteg.
Levereras inom 48 timmar · Resultat inom 6–8 veckor
