Genă
OR4C11
olfactory receptor family 4 subfamily C member 11
- HGNC 15167↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000172188↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 219429↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 11q11
- Coordonate
- Cromozomul 11: 55.602.360–55.607.645 (GRCh38)
- Exoni
- 4 de exoni pe 5,3 kb
- Proteină
- 310 de aminoacizi
- Simboluri anterioare
- OR4C11P
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000641580.1NM_001004700.3
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/or4c11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți OR4C11 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă OR4C11. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei OR4C11
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 2,7 kb din cei 5,3 kb ai genei; 933 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere OR4C11
0Ușor
Cât de greu este de secvențiat OR4C11 cu citiri scurte, din 100
0 · Ușor100 · Greu
Aproape toți exonii lui OR4C11 se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.
Ce adaugă: ponderea exonilor lui OR4C11 din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Pondere 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, cum sunt paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Pondere 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Pondere 15 %.0 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Pondere 10 %.1,6 %
- Acoperire de referințăGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există secvență cu care citirile să se alinieze. Pondere 10 %.0 %
Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă ponderea bazelor exonice ale lui OR4C11 din acel tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează după cât costă fiecare un apel cu citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în vreuna, 100 când fiecare bază se află în toate.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena OR4C11: olfactory receptor family 4 subfamily C member 11. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/or4c11
Dante Labs. Gena OR4C11: olfactory receptor family 4 subfamily C member 11 [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/or4c11
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni