Genă
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000149311↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 472↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 11q22.3
- Coordonate
- Cromozomul 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Exoni
- 63 de exoni pe 146 kb
- Proteină
- 3.056 de aminoacizi, 350,7 kDa
- Denumiri alternative
- TEL1, TELO1
- Simboluri anterioare
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Tip de locus
- Care codifică proteine
Share this page
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atm.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți ATM și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Ataxia-telangiectazia
- Autozomal recesivă
Ataxie cerebeloasă progresivă, telangiectazii, imunodeficiență și predispoziție la cancer cauzate de modificări bialelice ale genei ATM.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 8 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Diagnosticul ghidează prevenirea infecțiilor și terapia de substituție cu imunoglobuline, reducerea expunerii la radiații ionizante, monitorizarea pentru cancer și a plămânilor, precum și testarea de purtător la rude.
Infertilitate feminină
Capacitate redusă sau absentă a unei femei de a concepe.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 8 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Gene pentru cancer mamar și ovarian, altele decât BRCA1/2
- Predispoziție la cancer asociată cu ATMAutozomal dominantă
O singură variantă în ATM crește moderat riscul de cancer mamar și este asociată cu cancerul pancreatic și cel de prostată.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 1 transmițător GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
În general, se recomandă un screening mamar intensificat; purtătorii al căror partener este, de asemenea, purtător al unei variante ATM pot dori să afle riscul de ataxie-telangiectazie la copiii lor.
- Cancer mamar ereditarAutozomal dominantă
Predispoziție ereditară la cancer mamar, cauzată de variante ale uneia dintre mai multe gene.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
În funcție de genă, poate fi recomandată o screening mamar mai precoce și mai intensiv, inclusiv RMN.
Grupări mai largi
Alte erori înnăscute ale imunității
- Boală de imunodeficiență
Una dintre cele 170 gene legate de ea
Boală în care există o deficiență sau un defect al mecanismelor imunității, fie celulare, fie umorale.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 8 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Transplant de celule stem hematopoietice (HSCT) pentru SCID și imunodeficiențe primare (PID) severe; substituție cu imunoglobuline (IVIG/SCIG) pentru deficiențele de anticorpi; leniolisib (Joenja, FDA 2023) pentru APDS; terapie genică pentru SCID-ADA; abatacept pentru deficiența CTLA4/LRBA; antibiotice profilactice; G-CSF pentru CGD
Tulburări neurodegenerative ereditare
- Tulburare neurodegenerativă asociată cu KIF5AAutozomal dominantă
Una dintre cele 372 gene legate de ea
Cauzată de modificări ale unei copii a genei KIF5A, care codifică o proteină motorie cu o coadă de legare a cargoului. Diferite tipuri de modificări duc la afecțiuni diferite: paraplegie spastică ereditară de tip 10, o formă axonală a bolii Charcot-Marie-Tooth și scleroza laterală amiotrofică (SLA).
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 8 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Tratamentul este simptomatic și depinde de manifestări, incluzând kinetoterapie, medicamente antispastice și îngrijire multidisciplinară pentru SLA. Fiecare copil al unei persoane afectate are o șansă de 1 din 2 de a moșteni modificarea; consilierea genetică ajută familiile să înțeleagă acest lucru.
Structura genei ATM
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
- Variante cu pagină
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 12,9 kb din cei 146 kb ai genei; 9.171 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere ATM
2Ușor
Cât de greu este de secvențiat ATM cu citiri scurte, din 100
0 · Ușor100 · Greu
Aproape toți exonii lui ATM se află în zone în care citirile scurte se aliniază curat.
Ce adaugă: ponderea exonilor lui ATM din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, astfel încât un apel de acolo poate lipsi sau fi greșit. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 100.0,5 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogi și pseudogene, cu identitate de 90% sau mai mare. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Comună cu chrYRegiunile pseudoautozomale și regiunea transpusă X, unde chrX și chrY conțin aceeași secvență sau una aproape identică, astfel încât o citire de pe unul poate fi plasată pe celălalt. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Acoperire de referințăGoluri din apropiere în asamblarea de referință, unde nu există secvență cu care citirile să se alinieze. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 50.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 30.2,1 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 20.5,4 %
Un scor Dante Labs din propriile noastre cercetări, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă ponderea bazelor exonice ale lui ATM aflate în acel tip de regiune dificilă. Fiecare tip poate face singur o genă greu de analizat, iar fiecare tip suplimentar adaugă mai puțin: 0 când nicio bază nu se află în niciunul, 100 când fiecare bază se află acolo unde citirile nu pot fi plasate unic.
2.935
poziții în ATM unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
11 dintre ele (0,4 %) se află în regiuni în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (11 de situri)
Un genom complet acoperă toți cei 146 kb ai ATM, inclusiv intronii, nu doar cei 12,9 kb de exoni.
Variante cu pagină (811)
Variantele ATM cu pagină aici, cu cele mai multe stele de revizuire primele. Fiecare pagină descrie înregistrarea publică a ClinVar despre variantă, niciodată un rezultat.
| Variantă | HGVS c. | Exon sau intron | Poziție (GRCh38) | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exon 18 | 108.268.501 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| c.2T>C | Exon 2 | 108.227.626 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.332-1G>A | Intron 4 | 108.235.669 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.496+5G>A | Intron 5 | 108.235.839 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.1122_1123del | Exon 9 | 108.248.987 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.1607+1G>T | Intron 10 | 108.251.073 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.2251-2A>T | Intron 14 | 108.257.479 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.2251-4A>G | Intron 14 | 108.257.477 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.2466+5G>C | Intron 16 | 108.259.080 | Probabil patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți | |
| c.2639-23_2639-21del | Intron 17 | 108.268.386 | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
Variante patogene ClinVar (3.833)
Variantele ATM pe care ClinVar le clasifică drept patogene sau probabil patogene pentru orice afecțiune, evaluate de cel puțin un contribuitor cu criterii, și cele mai bine evaluate dintre acestea. Este înregistrarea publică a genei din ClinVar, niciodată un rezultat.
- Patogenă 2.826
- Patogenă/probabil patogenă 278
- Probabil patogenă 729
| Variantă | Afecțiuni | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogenă | ★★★★3 stele din 4 revizuit de un grup de experți |
Gene asociate acelorași afecțiuni
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Are 2 de afecțiuni în comun
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseAre 2 de afecțiuni în comun
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Are 1 afecțiune în comun
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialAre 1 afecțiune în comun
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Are 1 afecțiune în comun
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Are 1 afecțiune în comun
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseAre 1 afecțiune în comun
- ACER3alkaline ceramidase 3Are 1 afecțiune în comun
- ACO2aconitase 2Are 1 afecțiune în comun
- ADAadenosine deaminaseAre 1 afecțiune în comun
- ADARadenosine deaminase RNA specificAre 1 afecțiune în comun
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolaseAre 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu ATM
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca ATM. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Afișați încă 29 de trăsături
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Afișați încă 3 de trăsături
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Afișați încă 1 trăsătură
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-21: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.21-c791e85a.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena ATM: ATM serine/threonine kinase. Accesat 23 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/atm
Dante Labs. Gena ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citat 23 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/atm
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni