Dante Omics AI, în colaborare cu Universitatea Rockefeller, Laboratorul Giunta și o rețea de parteneri internaționali, a creat cel mai complet și mai precis genom de referință diploid pentru linia celulară RPE-1 – unul dintre cele mai utilizate standarde în experimentele complexe de inginerie celulară.
Această realizare reprezintă un adevărat „cod sursă” pentru cercetătorii din întreaga lume, oferind perspective mai aprofundate asupra complexității structurale, stabilității genomice și ingineriei bazate pe CRISPR.
De ce este important acest lucru
Linia RPE-1 reprezintă o referință mondială în domeniul biologiei celulare, al cercetării în domeniul cancerului și al editării genomului. Cu toate acestea, până în prezent, genomul său era incomplet, unele regiuni cheie fiind neclare sau lipsind cu desăvârșire.
Noua noastră versiune schimbă acest lucru:
► Completitudine diploidă – haplotipurile materne și paterne au fost identificate pe toate cromozomii.► Precizie extrem de ridicată – > 99,9999% pe mai mulți cromozomi.► Acoperire completă a regiunilor complexe – centromerii, secvențele repetitive și secvențele de ADN dificil de cartografiat din punct de vedere structural sunt acum cartografiate.► Integrare multiplataformă – date provenite din secvențe scurte Illumina, PacBio HiFi, secvențe lungi Oxford Nanopore și resurse complementare.► Acces liber – ansamblul RPE1v1.1 este acum disponibil prin NCBI și UCSC Genome Browser.
O realizare colectivă
Acest proiect a fost posibil doar datorită expertizei comune a unui consorțiu internațional, din care fac parte:
Universitatea RockefellerLaboratorul GiuntaUniversitatea „La Sapienza” din RomaUniversitatea din TennesseeParcul Științific din TriesteUniversitatea din L’AquilaDante Omics AI
Așa cum a explicat Andrea Riposati, directorul general al Dante Omics AI: „Imaginați-vă că depanați un program fără a avea la dispoziție anumite părți ale codului sursă. Grație acestei asamblări, cercetătorii dispun în sfârșit de un «cod sursă» complet și precis pentru celulele RPE-1 – până la cele mai complexe regiuni care înainte erau invizibile.”
Implicații pentru știință și medicină
Un nou standard în ingineria celulară: tehnicile CRISPR și alte tehnici de editare se pot baza acum pe o referință mai fiabilă.O explorare mai aprofundată a complexității ADN-ului: centromerii și secvențele repetitive, odată inaccesibile, pot fi acum studiate.Un impact mai amplu în diverse domenii de cercetare: de la oncologie la biologia sintetică, acest genom sporește precizia experimentelor la nivel mondial.Un model pentru asamblările viitoare: această abordare poate fi extinsă la alte linii celulare și specii.
Concluzie
De la imagini neclare la 4K: ADN-ul este mai mult decât un simplu titlu – acesta marchează un punct de cotitură în cercetarea genomică. Prin combinarea multiomicii accelerate de IA cu tehnologii de secvențiere de ultimă generație, Dante Omics AI și partenerii săi au realizat cea mai clară hartă genomică de până acum pentru unul dintre cele mai importante modele celulare din biologie.
➡ Citiți comunicatul de presă pe BusinessWire
Primește noutățile de la Dante Labs
Informații din domeniul genomicii, noutăți despre produse și perspective clinice — direct în căsuța ta de e-mail.
