Gen
RPS5
ribosomal protein S5
- HGNC 10426↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000083845↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6193↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 19q13.43
- Współrzędne
- Chromosom 19: 58 387 269–58 394 804 (GRCh38)
- Eksony
- 6 eksonów na odcinku 7,5 kb
- Białko
- 204 aminokwasów
- Znany również jako
- S5, uS7
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000196551.8NM_001009.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rps5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj RPS5 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu RPS5. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu RPS5
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 0,7 kb z 7,5 kb genu; 615 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie RPS5
3Łatwo
Jak trudno sekwencjonować RPS5 krótkimi odczytami, w skali 0–100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RPS5's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RPS5's exons in each kind of hard region
- MapowalnośćOdcinki, na których odczyty 100 lub 250 bp nie mogą być jednoznacznie umieszczone, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.0,3%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, na przykład paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i mogą ich nie obejmować. Waga 15%.0%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.27%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim zestawie referencyjnym, gdzie brak sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredKażdy słupek to udział zasad eksonów RPS5 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je według tego, jak bardzo każda zasada utrudnia wywołanie krótkim odczytem: 0, gdy żadna zasada nie leży w żadnym regionie, 100, gdy każda zasada leży we wszystkich.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen RPS5: ribosomal protein S5. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/rps5
Dante Labs. Gen RPS5: ribosomal protein S5 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/rps5
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni