Wariant
RPGR E701X
NM_001034853.2(RPGR):c.2101G>T (p.Glu701Ter)
- p.Glu701Ter
- p.E701*
- Klasyfikacja ClinVar
- Prawdopodobnie patogenny
- Status przeglądu
- 3 gwiazdek z 4zweryfikowane przez panel ekspertów
- Ostatnia ocena
- 7 września 2025
- Panel ekspertów
- ClinGen X-linked Inherited Retinal Disease Variant Curation Expert Panel, ClinGen
Dane aktualne wg wydania ClinVar 2026-10-12 · wydanie danych Dante Labs 2026.10.16-c6eea6bfDane ostatnio zmienione 16 października 2026
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Podsumowanie
E701X to wariant nonsense w genie RPGR: tworzy wczesny sygnał zatrzymania, dlatego przewiduje się, że białko kodowane przez ten gen zostanie skrócone. ClinVar klasyfikuje go jako prawdopodobnie patogenny w odniesieniu do RPGR-Related Retinopathy (zweryfikowane przez panel ekspertów).
Klasyfikacje ClinVar
| Schorzenie | Klasyfikacja | Status przeglądu | Zgłoszenia | Ostatnia ocena |
|---|---|---|---|---|
| RPGR-Related RetinopathyClinVar VCV004082162 (otworzy się w nowej karcie) | Prawdopodobnie patogenny | 3 gwiazdek z 4zweryfikowane przez panel ekspertów | 1 zgłoszenie | 7 września 2025 |
Klasyfikacje w takiej postaci, w jakiej ClinVar je zapisuje w wydaniu 2026-10-12. ClinVar aktualizuje je w miarę weryfikacji dowodów.
Położenie w genie RPGR
E701X znajduje się w eksonie 15 spośród 15 w transkrypcie MANE Select genu RPGR, NM_001034853.2.
Szczegóły molekularne
| Gen | RPGR |
|---|---|
| Transkrypt | NM_001034853.2MANE Select |
| Zmiana w DNA kodującym (HGVS c.) | c.2101G>T |
| Zmiana białka (HGVS p.) | p.Glu701Terp.E701* |
| Przewidywany skutek | Nonsense (przedwczesny kodon stop)stop_gained (otworzy się w nowej karcie) |
| Przewidywany wpływ | Wysoki |
| Pozycja (GRCh38) | chrX:38286898 C>A |
| Pozycja (GRCh37) | chrX:38146151 C>A |
| Identyfikator wariantu ClinVar | VCV004082162 (otworzy się w nowej karcie) |
| Identyfikator alleli ClinVar | 4194837 |
| Nazwa w ClinVar | NM_001034853.2(RPGR):c.2101G>T (p.Glu701Ter) |
RPGR E701X w innych bazach danych
Raport badający ten wariant (1)
W tych raportach dotyczących chorób z testu Genome Test uwzględniono E701X wśród analizowanych wariantów.
| Raport | Choroby | Dziedziczenie |
|---|---|---|
| Retinitis Pigmentosa | RPGR-Related Retinopathy | Recesywne sprzężone z chromosomem X |
Inne warianty w RPGR
- A308PPrawdopodobnie patogenny3 gwiazdek z 4
- A365Cfs*12Patogenny3 gwiazdek z 4
- A781Rfs*34Patogenny3 gwiazdek z 4
- c.28+1G>APatogenny3 gwiazdek z 4
- c.28+1G>CPatogenny3 gwiazdek z 4
- c.28+2T>CPatogenny3 gwiazdek z 4
- c.28+2T>GPatogenny3 gwiazdek z 4
- c.29-2A>GPatogenny3 gwiazdek z 4
- c.154+1G>APatogenny3 gwiazdek z 4
- c.154+3_154+6delPatogenny3 gwiazdek z 4
Ograniczenia
Ta strona opisuje publicznie dostępne informacje o wariancie genetycznym. Nie jest diagnozą i nic nie mówi o tym, czy ktokolwiek, w tym czytający, posiada ten wariant.
Klasyfikacje pochodzą z ClinVar i zmieniają się wraz z przeglądem nowych dowodów. Klasyfikacja podana tutaj może różnić się od tej, która widnieje dziś w ClinVar, lub od tej zgłoszonej przez laboratorium.
Sekwencjonowanie całego genomu metodą krótkich odczytów może nie wykryć niektórych wariantów lub błędnie je zinterpretować, szczególnie w powtarzających się lub bardzo podobnych fragmentach DNA oraz przy dużych insercjach, delecjach lub przearanżowaniach.
W razie pytań dotyczących wariantu w wynikach lub w rodzinie warto skonsultować się z doradcą genetycznym lub lekarzem.
Źródła i autorzy
- Klasyfikacje z ClinVar (wydanie 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Nazwy chorób z Mondo Disease Ontology (wydanie 2026-10-06), wykorzystywane na licencji CC BY 4.0.
- Symbole i nazwy genów z HUGO Gene Nomenclature Committee (wydanie 2026-10-16).
- Identyfikatory alleli z ClinGen Allele Registry (wydanie 2026-10-16-c4908f54).
- Identyfikatory referencyjnych SNP z dbSNP (wydanie b157), National Center for Biotechnology Information.
- Powiązania gen–choroba z Gene Curation Coalition, GenCC (wydanie 2026-10-16).
- Trudne regiony z Genome in a Bottle Consortium (wydanie v3.6).
- Transkrypty z MANE (wydanie v1.5), NCBI i EMBL-EBI.
- Przewidywane konsekwencje z mehari (wydanie 0.11.0), z modelami transkryptów z cdot.
- Opracowano na podstawie wydania danych Dante Labs 2026.10.16-c6eea6bf z 16 października 2026.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (16 października 2026). RPGR E701X (c.2101G>T) (wersja 2026.10.16-c6eea6bf). Pobrano 16 października 2026 z https://dantelabs.com/genes/rpgr/variants/e701x
Dante Labs. RPGR E701X (c.2101G>T) [Internet]. Wersja 2026.10.16-c6eea6bf. 16 października 2026 [dostęp: 16 października 2026]. Dostępne z: https://dantelabs.com/genes/rpgr/variants/e701x
Odczytaj cały genom
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni