Gen
RAET1G
retinoic acid early transcript 1G
- HGNC 16795↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000203722↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 353091↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 6q25.1
- Współrzędne
- Chromosom 6: 149 916 878–149 923 121 (GRCh38)
- Eksony
- 5 eksonów na odcinku 6,2 kb
- Białko
- 334 aminokwasów
- Znany również jako
- ULBP5
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000367360.7NM_001001788.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/raet1g.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj RAET1G oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu RAET1G. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu RAET1G
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,2 kb z 6,2 kb genu; 1005 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie RAET1G
66Trudny
Stopień trudności sekwencjonowania genu RAET1G krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Duża część genu RAET1G znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją błędnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu RAET1G w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 100%.25%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 60%.88%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Waga 60%.0%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 50%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 30%.7,3%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 20%.17%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu RAET1G w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen RAET1G: retinoic acid early transcript 1G. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/raet1g
Dante Labs. Gen RAET1G: retinoic acid early transcript 1G [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/raet1g
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni