Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

LATS1

large tumor suppressor kinase 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
6q25.1
Współrzędne
Chromosom 6: 149 658 153–149 718 101 (GRCh38)
Eksony
8 eksonów na odcinku 59,9 kb
Białko
1130 aminokwasów
Znany również jako
WARTS
Transkrypt MANE Select
ENST00000543571.6NM_004690.4
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu LATS1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu LATS1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 6, z nawiasem wskazującym położenie LATS1. LATS1 i 17 genów w pobliżu na chromosomie 6, od 149 188 127 do 150 188 126.Chromosom 66q25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27149,2 Mb149,4 Mb149,6 Mb149,8 Mb150 MbTAB2: 149 218 641–149 411 901, nić dodatniejTAB2SUMO4: 149 400 262–149 401 278, nić dodatniejSUMO4ZC3H12D: 149 446 795–149 485 036, nić ujemnejZC3H12DPPIL4: 149 501 435–149 546 111, nić ujemnejPPIL4GINM1: 149 566 190–149 591 751, nić dodatniejGINM1KATNA1: 149 594 873–149 648 972, nić ujemnejKATNA1LATS1: 149 658 153–149 718 101, nić ujemnejLATS1NUP43: 149 723 373–149 750 286, nić ujemnejNUP43PCMT1: 149 749 197–149 811 422, nić dodatniejPCMT1LRP11: 149 793 455–149 864 424, nić ujemnejLRP11: 149 817 937–149 896 011, nić ujemnejRAET1E: 149 882 982–149 898 118, nić ujemnejRAET1ERAET1G: 149 915 593–149 923 126, nić ujemnejRAET1GULBP2: 149 941 938–149 949 235, nić dodatniejULBP2ULBP1: 149 963 935–149 973 715, nić dodatniejULBP1RAET1L: 150 018 334–150 025 567, nić ujemnejRAET1LULBP3: 150 057 438–150 069 191, nić ujemnejULBP3PPP1R14C: 150 142 993–150 250 392, nić dodatniejPPP1R14CSchemat LATS1: 8 eksonów na nici ujemnej chromosomu 6Ekson 8: 149 658 153–149 662 238, 4086 zasadEkson 7: 149 676 260–149 676 366, 107 zasadEkson 6: 149 676 555–149 676 737, 183 zasadEkson 5: 149 679 875–149 680 457, 583 zasadEkson 4: 149 683 079–149 684 592, 1514 zasadEkson 3: 149 695 074–149 695 221, 148 zasadEkson 2: 149 701 779–149 702 266, 488 zasadEkson 1: 149 717 849–149 718 101, 253 zasad864215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 7,4 kb z 59,9 kb genu; 3393 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie LATS1

4Łatwy

Stopień trudności sekwencjonowania genu LATS1 krótkimi odczytami w skali 0–100

Niemal wszystkie eksony genu LATS1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.

Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu LATS1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Pokrycie referencji0%
  • Powtórzenia4,1%
  • Zawartość GC14%

Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen LATS1: large tumor suppressor kinase 1. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/lats1

Vancouver

Dante Labs. Gen LATS1: large tumor suppressor kinase 1 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/lats1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test