Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PPP4R1

protein phosphatase 4 regulatory subunit 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
18p11.22
Współrzędne
Chromosom 18: 9 546 794–9 614 559 (GRCh38)
Eksony
20 eksonów na odcinku 67,8 kb
Białko
950 aminokwasów
Znany również jako
PP4R1
Transkrypt MANE Select
ENST00000400556.8NM_001042388.3
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PPP4R1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PPP4R1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 18, z nawiasem wskazującym położenie PPP4R1. PPP4R1 i 7 genów w pobliżu na chromosomie 18, od 9 080 677 do 10 080 676.Chromosom 1818p11.22p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q239,2 Mb9,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 MbNDUFV2: 9 102 433–9 134 570, nić dodatniejNDUFV2ANKRD12: 9 136 228–9 285 985, nić dodatniejANKRD12TWSG1: 9 334 618–9 402 424, nić dodatniejTWSG1RALBP1: 9 474 991–9 538 114, nić dodatniejRALBP1PPP4R1: 9 546 794–9 614 559, nić ujemnejPPP4R1RAB31: 9 708 218–9 862 551, nić dodatniejRAB31TXNDC2: 9 885 766–9 889 275, nić dodatniejTXNDC2VAPA: 9 913 916–9 960 021, nić dodatniejVAPASchemat PPP4R1: 20 eksonów na nici ujemnej chromosomu 18Ekson 20: 9 546 794–9 547 952, 1159 zasadEkson 19: 9 549 197–9 549 338, 142 zasadEkson 18: 9 550 052–9 550 186, 135 zasadEkson 17: 9 550 278–9 550 398, 121 zasadEkson 16: 9 553 322–9 553 422, 101 zasadEkson 15: 9 557 221–9 557 382, 162 zasadEkson 14: 9 559 419–9 559 604, 186 zasadEkson 13: 9 561 980–9 562 075, 96 zasadEkson 12: 9 563 378–9 563 550, 173 zasadEkson 11: 9 570 157–9 570 683, 527 zasadEkson 10: 9 577 064–9 577 191, 128 zasadEkson 9: 9 583 117–9 583 275, 159 zasadEkson 8: 9 584 515–9 584 580, 66 zasadEkson 7: 9 584 721–9 584 828, 108 zasadEkson 6: 9 588 089–9 588 235, 147 zasadEkson 5: 9 588 711–9 588 853, 143 zasadEkson 4: 9 593 768–9 593 874, 107 zasadEkson 3: 9 595 018–9 595 153, 136 zasadEkson 2: 9 614 226–9 614 270, 45 zasadEkson 1: 9 614 478–9 614 559, 82 zasad201510515′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 3,9 kb z 67,8 kb genu; 2853 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie PPP4R1

1Łatwe

Stopień trudności sekwencjonowania PPP4R1 krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony PPP4R1 leżą w miejscach, gdzie krótkie odczyty dopasowują się jednoznacznie.

Co na to wpływa: udział eksonów PPP4R1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Powtórzenia1,2%
  • Zawartość GC5,5%
  • Pokrycie referencji0%

Wynik Dante Labs oparty na naszych własnych badaniach, zbudowany na mapach trudnych do sekwencjonowania regionów Genome in a Bottle instytutu NIST.Jak to jest oceniane

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PPP4R1: protein phosphatase 4 regulatory subunit 1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ppp4r1

Vancouver

Dante Labs. Gen PPP4R1: protein phosphatase 4 regulatory subunit 1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ppp4r1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test