Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PCDHGB1

protocadherin gamma subfamily B, 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
5q31
Współrzędne
Chromosom 5: 141 350 099–141 512 975 (GRCh38)
Eksony
4 eksonów na odcinku 162,9 kb
Białko
927 aminokwasów
Znany również jako
PCDH-GAMMA-B1
Transkrypt MANE Select
ENST00000523390.2NM_018922.3
Typ locus
Inne
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PCDHGB1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PCDHGB1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 5, z nawiasem wskazującym położenie PCDHGB1. PCDHGB1 i 62 genów w pobliżu na chromosomie 5, od 140 931 537 do 141 931 536.Chromosom 55q31p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, nić dodatniejPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, nić dodatniejPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, nić dodatniejPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, nić dodatniejPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, nić dodatniejPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, nić dodatniejPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, nić dodatniejPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, nić dodatniejPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, nić dodatniejPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, nić dodatniejPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, nić dodatniejPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, nić dodatniejPCDHA12PCDHA13: 140 882 079–141 012 347, nić dodatniejPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, nić dodatniejPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, nić dodatniejPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, nić dodatniejPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, nić dodatniejPCDHB3: 141 100 473–141 103 827, nić dodatniejPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, nić dodatniejPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, nić dodatniejPCDHB5PCDHB6: 141 150 057–141 153 287, nić dodatniejPCDHB6PCDHB7: 141 172 644–141 176 383, nić dodatniejPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, nić dodatniejPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, nić dodatniejPCDHB9: 141 187 127–141 191 541, nić dodatniejPCDHB10: 141 192 353–141 195 647, nić dodatniejPCDHB11: 141 199 610–141 203 779, nić dodatniejPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, nić dodatniejPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, nić dodatniejPCDHB13PCDHB14: 141 223 343–141 227 759, nić dodatniejPCDHB14: 141 223 372–141 245 861, nić dodatniejPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, nić dodatniejPCDHB15TAF7: 141 259 884–141 320 784, nić ujemnejTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, nić ujemnejSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA3PCDHGB1: 141 350 099–141 512 975, nić dodatniejPCDHGB1PCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA4PCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB2PCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB4: 141 387 698–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, nić dodatniejPCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, nić dodatniejPCDHGA12: 141 430 507–141 512 977, nić dodatniejPCDHGC3: 141 475 929–141 512 977, nić dodatniejPCDHGC4: 141 484 997–141 512 977, nić dodatniejPCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, nić dodatniejDIAPH1: 141 515 016–141 619 194, nić ujemnejHDAC3: 141 620 766–141 637 304, nić ujemnejHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, nić dodatniejRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, nić ujemnejFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, nić ujemnejARAP3PCDH1: 141 853 090–141 879 246, nić ujemnejPCDH1DELE1: 141 923 800–141 952 031, nić dodatniejDELE1Schemat PCDHGB1: 4 eksonów na nici dodatniej chromosomu 5Ekson 1: 141 350 099–141 352 669, 2571 zasadEkson 2: 141 494 807–141 494 865, 59 zasadEkson 3: 141 505 393–141 505 481, 89 zasadEkson 4: 141 510 947–141 512 975, 2029 zasad12345′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 4,7 kb z 162,9 kb genu; 2784 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie PCDHGB1

10Łatwy

Stopień trudności sekwencjonowania genu PCDHGB1 krótkimi odczytami w skali 0–100

Niemal wszystkie eksony genu PCDHGB1 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.

Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu PCDHGB1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność7%
  • Homologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Pokrycie referencji0%
  • Powtórzenia1,5%
  • Zawartość GC13%

Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PCDHGB1: protocadherin gamma subfamily B, 1. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/pcdhgb1

Vancouver

Dante Labs. Gen PCDHGB1: protocadherin gamma subfamily B, 1 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/pcdhgb1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test