Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

LPP

LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
3q27.3-q28
Współrzędne
Chromosom 3: 188 154 157–188 890 671 (GRCh38)
Eksony
12 eksonów na odcinku 736,5 kb
Białko
612 aminokwasów
Transkrypt MANE Select
ENST00000617246.5NM_001375462.1
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu LPP. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu LPP

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Znane miejsca powodujące choroby
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 3, z nawiasem wskazującym położenie LPP. LPP i 4 genów w pobliżu na chromosomie 3, od 187 417 642 do 189 627 186.Chromosom 33q27.3-q28p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29187,5 Mb188 Mb188,5 Mb189 Mb189,5 MbSST: 187 668 856–187 670 401, nić ujemnejSSTRTP2: 187 698 259–187 702 656, nić ujemnejRTP2BCL6: 187 721 377–187 745 725, nić ujemnejBCL6LPP: 188 154 157–188 890 671, nić dodatniejLPPTPRG1: 188 947 165–189 325 304, nić dodatniejTPRG1Schemat LPP: 12 eksonów na nici dodatniej chromosomu 3Ekson 9: 1 znane miejsce powodujące chorobęEkson 1: 188 154 157–188 154 252, 96 zasadEkson 2: 188 225 405–188 225 527, 123 zasadEkson 3: 188 341 663–188 341 719, 57 zasadEkson 4: 188 406 112–188 406 313, 202 zasadEkson 5: 188 484 592–188 484 704, 113 zasadEkson 6: 188 524 665–188 524 787, 123 zasadEkson 7: 188 609 161–188 609 844, 684 zasadEkson 8: 188 708 267–188 708 393, 127 zasadEkson 9: 188 760 113–188 760 282, 170 zasadEkson 10: 188 866 200–188 866 378, 179 zasadEkson 11: 188 872 643–188 872 763, 121 zasadEkson 12: 188 874 351–188 890 671, 16 321 zasad1125′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 18,3 kb z 736,5 kb genu; 1839 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie LPP

3Niski

Jak trudno sekwencjonować LPP krótkimi odczytami, w skali 0–100

  • Mapowalność5%
  • Homologia0%
  • Powtórzenia5,2%
  • Zawartość GC6,5%
  • Pokrycie referencyjne0%

1

pozycja w LPP, w której ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną

Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.

Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 736,5 kb LPP, łącznie z intronami, a nie tylko 18,3 kb eksonów.

Cechy powiązane z genem LPP

Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać LPP. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
  • Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
  • Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen LPP: LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/lpp

Vancouver

Dante Labs. Gen LPP: LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/lpp

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test