Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

C5orf52

chromosome 5 open reading frame 52

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
5q33.3
Współrzędne
Chromosom 5: 157 671 533–157 680 158 (GRCh38)
Eksony
3 eksonów na odcinku 8,6 kb
Białko
159 aminokwasów
Transkrypt MANE Select
ENST00000409999.4NM_001145132.2
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu C5orf52. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu C5orf52

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 5, z nawiasem wskazującym położenie C5orf52. C5orf52 i 10 genów w pobliżu na chromosomie 5, od 157 175 846 do 158 175 845.Chromosom 55q33.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3157,2 Mb157,4 Mb157,6 Mb157,8 Mb158 MbITK: 157 142 933–157 255 185, nić dodatniejITKCYFIP2: 157 266 079–157 395 595, nić dodatniejCYFIP2: 157 341 596–157 460 100, nić ujemnejFNDC9: 157 341 598–157 345 766, nić ujemnejFNDC9ADAM19: 157 395 534–157 575 858, nić ujemnejADAM19NIPAL4: 157 460 213–157 474 723, nić dodatniejNIPAL4SOX30: 157 624 798–157 671 480, nić ujemnejSOX30C5orf52: 157 671 533–157 680 158, nić dodatniejC5orf52THG1L: 157 731 402–157 741 449, nić dodatniejTHG1LLSM11: 157 743 706–157 760 709, nić dodatniejLSM11CLINT1: 157 783 121–157 859 206, nić ujemnejCLINT1Schemat C5orf52: 3 eksonów na nici dodatniej chromosomu 5Ekson 1: 157 671 533–157 671 826, 294 zasadEkson 2: 157 675 092–157 675 200, 109 zasadEkson 3: 157 679 841–157 680 158, 318 zasad1235′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 0,7 kb z 8,6 kb genu; 480 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie C5orf52

9Łatwo

Jak trudno zsekwencjonować C5orf52 krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony C5orf52 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.

Co na to wpływa: udział eksonów C5orf52 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia4,9%
  • Zawartość GC41%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen C5orf52: chromosome 5 open reading frame 52. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/c5orf52

Vancouver

Dante Labs. Gen C5orf52: chromosome 5 open reading frame 52 [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/c5orf52

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test