Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

AHCTF1

AT-hook containing transcription factor 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
1q44
Współrzędne
Chromosom 1: 246 839 098–246 931 948 (GRCh38)
Eksony
36 eksonów na odcinku 92,9 kb
Białko
2266 aminokwasów, 252,5 kDa
Znany również jako
ELYS
Transkrypt MANE Select
ENST00000648844.2NM_001323342.2
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu AHCTF1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu AHCTF1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 1, z nawiasem wskazującym położenie AHCTF1. AHCTF1 i 12 genów w pobliżu na chromosomie 1, od 246 385 523 do 247 385 522.Chromosom 11q44p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44246,4 Mb246,6 Mb246,8 Mb247 Mb247,2 MbSMYD3: 245 749 342–246 507 323, nić ujemnejSMYD3TFB2M: 246 540 561–246 566 290, nić ujemnejTFB2MCNST: 246 566 300–246 677 298, nić dodatniejCNSTSCCPDH: 246 724 064–246 768 798, nić dodatniejSCCPDHAHCTF1: 246 839 098–246 931 948, nić ujemnejAHCTF1ZNF695: 246 945 315–247 008 093, nić ujemnejZNF695ZNF670-ZNF695: 246 945 547–247 078 811, nić ujemnejZNF670-ZNF695ZNF670: 247 033 691–247 078 818, nić ujemnejZNF670ZNF669: 247 098 035–247 104 386, nić ujemnejZNF669ZNF124: 247 121 975–247 172 063, nić ujemnejZNF124VN1R5: 247 255 972–247 257 210, nić dodatniejVN1R5ZNF496: 247 290 854–247 332 822, nić ujemnejZNF496NLRP3: 247 332 331–247 449 668, nić dodatniejNLRP3Schemat AHCTF1: 36 eksonów na nici ujemnej chromosomu 1Ekson 36: 246 839 098–246 840 998, 1901 zasadEkson 35: 246 842 694–246 842 776, 83 zasadEkson 34: 246 843 795–246 843 928, 134 zasadEkson 33: 246 849 615–246 851 442, 1828 zasadEkson 32: 246 853 091–246 853 299, 209 zasadEkson 31: 246 855 730–246 855 827, 98 zasadEkson 30: 246 857 691–246 857 814, 124 zasadEkson 29: 246 860 899–246 861 295, 397 zasadEkson 28: 246 861 959–246 862 153, 195 zasadEkson 27: 246 863 924–246 864 116, 193 zasadEkson 26: 246 867 244–246 867 351, 108 zasadEkson 25: 246 867 661–246 867 811, 151 zasadEkson 24: 246 876 037–246 876 187, 151 zasadEkson 23: 246 876 950–246 877 081, 132 zasadEkson 22: 246 877 158–246 877 302, 145 zasadEkson 21: 246 885 493–246 885 680, 188 zasadEkson 20: 246 887 211–246 887 357, 147 zasadEkson 19: 246 888 177–246 888 233, 57 zasadEkson 18: 246 888 394–246 888 517, 124 zasadEkson 17: 246 889 966–246 890 059, 94 zasadEkson 16: 246 890 956–246 891 060, 105 zasadEkson 15: 246 891 779–246 891 919, 141 zasadEkson 14: 246 894 659–246 894 748, 90 zasadEkson 13: 246 895 835–246 895 925, 91 zasadEkson 12: 246 898 208–246 898 336, 129 zasadEkson 11: 246 899 451–246 899 512, 62 zasadEkson 10: 246 900 065–246 900 246, 182 zasadEkson 9: 246 900 337–246 900 469, 133 zasadEkson 8: 246 902 525–246 902 675, 151 zasadEkson 7: 246 903 949–246 904 033, 85 zasadEkson 6: 246 905 541–246 905 657, 117 zasadEkson 5: 246 907 551–246 907 758, 208 zasadEkson 4: 246 913 232–246 913 412, 181 zasadEkson 3: 246 916 142–246 916 395, 254 zasadEkson 2: 246 918 250–246 918 377, 128 zasadEkson 1: 246 931 578–246 931 948, 371 zasad36353025201510515′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 8,9 kb z 92,9 kb genu; 6801 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie AHCTF1

67Trudno

Jak trudno zsekwencjonować AHCTF1 krótkimi odczytami, w skali do 100

Duża część AHCTF1 znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub błędnie ją umiejscowić.

Co na to wpływa: udział eksonów AHCTF1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność54%
  • Homologia42%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia1,4%
  • Zawartość GC8%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen AHCTF1: AT-hook containing transcription factor 1. Pobrano 21 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ahctf1

Vancouver

Dante Labs. Gen AHCTF1: AT-hook containing transcription factor 1 [Internet]. [cytowano 21 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ahctf1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test