Gen
VTCN1
V-set domain containing T cell activation inhibitor 1
- HGNC 28873↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000134258↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 79679↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1p13.1-p12
- Koordinater
- Kromosom 1: 117 143 587–117 210 927 (GRCh38)
- Eksoner
- 6 eksoner over 67,3 kb
- Protein
- 282 aminosyrer
- Også kjent som
- B7-H4, FLJ22418, B7S1, B7x, B7H4
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000369458.8NM_024626.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/vtcn1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes VTCN1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser VTCN1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er VTCN1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,6 kb av genets 67,3 kb, og 849 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av VTCN1
19Moderat
Hvor vanskelig VTCN1 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av VTCN1s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0,5 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.63 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.0 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). VTCN1-genet: V-set domain containing T cell activation inhibitor 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/vtcn1
Dante Labs. VTCN1-genet: V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/vtcn1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker