Gen
RFC3
replication factor C subunit 3
- HGNC 9971↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000133119↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 5983↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 13q13.2
- Koordinater
- Kromosom 13: 33 818 149–33 837 500 (GRCh38)
- Eksoner
- 9 eksoner over 19,4 kb
- Protein
- 356 aminosyrer
- Også kjent som
- RFC38, MGC5276
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000380071.8NM_002915.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rfc3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes RFC3 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser RFC3 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er RFC3 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,3 kb av genets 19,4 kb, og 1 071 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av RFC3
1Lett
Hvor vanskelig RFC3 er å sekvensere med korte avlesninger, av 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RFC3's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RFC3's exons in each kind of hard region
- KartleggbarhetOmråder der 100 eller 250 bp lange avlesninger ikke kan plasseres entydig, slik at et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av samme base, som avlesninger glir av på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.1,7 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.3,4 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for avlesninger å justere mot. Vekt 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredHver søyle er andelen av RFC3s eksonbaser i den typen vanskelige områder. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver koster for et kall basert på korte avlesninger: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RFC3-genet: replication factor C subunit 3. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rfc3
Dante Labs. RFC3-genet: replication factor C subunit 3 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rfc3
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker