PMS2-genet — Lynch-syndrom forårsaket av PMS2 har lavere kreftpenetrans enn MLH1 eller MSH2, men pseudogenet PMS2CL gjør standard genetisk testing upålitelig, og WGS gir en mer nøyaktig evaluering.
Helgenomsekvensering evaluerer PMS2 med forbedret nøyaktighet sammenlignet med paneltesting ved å lese gjennom den komplekse PMS2/PMS2CL-pseudogenregionen – og skille mellom ekte patogene varianter og pseudogensekvenser.
PMS2-genet — Lynch-syndrom
PMS2 (kromosom 7p22.1) koder for et DNA-mismatch-reparasjonsprotein. Patogene PMS2-varianter forårsaker Lynch syndrom med lavere penetrans enn MLH1/MSH2 – omtrent 15–20 % livstidsrisiko for kreft i karsinom (CRC) og 15 % risiko for livmorkreft (vs. 50–80 % risiko for kreft i karsinom for MLH1/MSH2). Til tross for lavere penetrans gir PMS2-Lynch fortsatt klinisk signifikant kreftrisiko som krever økt overvåking.
PMS2 har en unik testutfordring – pseudogenet PMS2CL deler >98 % sekvensidentitet med PMS2-ekson 1–5, noe som forårsaker feiltildeling av varianter i standard neste generasjons sekvenseringspaneler. Varianter i pseudogenet kan feilaktig bli kalt PMS2-patogene varianter (falske positive), eller ekte PMS2-varianter kan bli avfeid som pseudogenartefakter (falske negative). Langtrekkende PCR, genspesifikk amplifisering eller helgenomtilnærminger forbedrer nøyaktigheten.
PMS2-Lynch-behandling inkluderer koloskopi hvert 1.-2. år fra 25-30 år (senere enn MLH1/MSH2 på grunn av lavere penetrans), overvåking av endometriekreft for kvinnelige bærere og vurdering av aspirin-kjemoprevensjon. Immunterapi for PMS2-mangelfulle kreftformer er svært effektiv – svulster med høy MSI/dMMR responderer dramatisk på pembrolizumab uavhengig av hvilket MMR-gen som er mangelfullt.
PMS2-pseudogenet PMS2CL forvirrer standard genetisk testing. Varianter blir ofte feilklassifisert. Hvis du har hatt PMS2 'VUS'- eller 'patogene' resultater fra paneltesting, anbefales WGS-bekreftelse.
PMS2 er det vanskeligste Lynch-genet å teste nøyaktig på grunn av pseudogenet. WGS gir overlegen evaluering ved å lese hele genomisk kontekst, noe som reduserer falske positive og negative resultater fra pseudogeninterferens.
Pseudogen interferens forårsaker falske positive og negative resultater for PMS2 – WGS løser tvetydigheten
Standard NGS-paneler feiltilordner ofte varianter mellom PMS2 og PMS2CL. En pasient som får beskjed om at de har en patogen PMS2-variant, kan faktisk ha en godartet pseudogenvariant (falsk positiv → unødvendig overvåking). Omvendt kan en ekte PMS2-variant filtreres som pseudogenstøy (falsk negativ → tapt Lynch-diagnose). WGS leser hele genomisk kontekst, noe som forbedrer nøyaktigheten av varianttildelingen.
PMS2-Lynch-kreft responderer på immunterapi – dMMR-status åpner for pembrolizumab uavhengig av det spesifikke MMR-genet
PMS2-defekte svulster har høy MSI-verdi og responderer på immunkontrollpunkthemmere. Pembrolizumab er FDA-godkjent for alle kreftformer med høy MSI-verdi/dMMR, uavhengig av opprinnelsesvev. Bekreftelse av PMS2-kimlinjestatus identifiserer den molekylære mekanismen som ligger til grunn for høy MSI-verdi og utløser kaskadefamilietesting.
Ditt fulle DNA (ikke bare en del av det)
Tradisjonell genetisk testing ser på smale sett med gener, og mangler de fleste deler av genomet ditt. Vi sekvenserer hele genomet ditt – hvert gen og hver region mellom gener.
Omfattende innsikt og spesialiserte rapporter
Lett å lese og med svar som du og legen din kan handle ut fra. Ikke en fil å tolke – over 200 kliniske rapporter, organisert etter kategori.
Testen din blir mer verdifull for hvert år
DNA-et ditt endrer seg ikke, men genomforskningen akselererer. Hver måned oppdages nye assosiasjoner mellom varianter av sykdommer. Vi validerer disse funnene og oppdaterer rapportene dine automatisk. Testen din blir mer verdifull for hvert år.
Resultatene legene gir i sine vanskeligste tilfeller.
Førti år med usikkerhet. Én prøve.
En pasient hadde tilbrakt flere tiår i det britiske helsevesenet uten en diagnose. Dante-data, godkjent av kliniske team fra NHS ved Queen Elizabeth University Hospital i Glasgow, identifiserte Noonan syndrom og en RUNX1-leukemi-assosiert variant som hadde gått uoppdaget. Etter 40 år hadde de endelig et svar.
En fullstendig lesning gir et komplett bilde.
En pasient kom til Dante for å undersøke periodisk lammelse. Avlesning av hele genomet identifiserte et samtidig arvelig hjertefunn – Brugada syndrom – som legen deres bekreftet med et EKG. Resultatet forklarte også et familiemedlems uavklarte hjertehistorie. Én test. Alle svarene i den.
Sekvensert i 2019. Dataene fungerte i 2021.
Jennifer sekvenserte genomet sitt med Dante to år før brystkreftdiagnosen. Da behandlingen startet, viste Dantes farmakogenomiske data at den foreskrevne cellegiften ville forårsake alvorlige bivirkninger. Legen hennes valgte et alternativ – og hun startet effektiv behandling fra dag én.
Ethvert genetisk spørsmål fortjener et fullstendig svar.
Enten du søker etter svar i dag eller beskytter helsen din for morgendagen, er en fullstendig avlesning av hele genomet ditt det eneste stedet å starte.
Det går i familien din. Nå kan du vite om det går i genene dine.
Genomet ditt inneholder arvelige varianter assosiert med medisinske tilstander som hjerte-, kreft- og nevrologiske tilstander. Vi leser alle – med den kliniske dybden som gir resultatet mening.
Lær mer →Når tradisjonelle laboratorietester sier at du har det bra. Og du vet at du ikke har det.
Standard diagnostiske tester sjekker for et forhåndsvalgt sett med svar. Vi sekvenserer hele DNA-et ditt – inkludert deler som ingen test var utviklet for å sjekke. Hvis svaret finnes i genomet ditt, hjelper vi deg med å finne det.
Lær mer →Diagnosen din kan være riktig. Behandlingsplanen din kan være ufullstendig.
Genene dine avgjør hvilke behandlinger som mest sannsynlig vil fungere – og hvilke som ikke gjør det. Vi gir legen din verktøyene og innsikten som trengs for å informere behandlingsplanen din.
Lær mer →Du vil vite før noe tvinger frem spørsmålet.
Noen venter ikke på en diagnose eller en familiehistorie før de handler. Helgenomsekvensering gir deg det komplette genetiske bildet nå – slik at du og legen din kan ta informerte beslutninger før noe blir presserende.
Lær mer →Du har allerede tatt en DNA-test. Her er hva den ikke kunne fortelle deg.
De fleste DNA-tester for forbrukere leser mindre enn 0,1 % av genomet ditt. Vi leser alt.
Lær mer →Kliniske resultater. Valgt av enkeltpersoner, betrodd av leger for deres mest komplekse tilfeller.
Dante Genome Test hjalp spesialister ved et nasjonalt akuttsykehus i Storbritannia med å identifisere Noonan syndrom og en sjelden leukemi-assosiert genetisk variant som ikke hadde blitt oppdaget. Dette resultatet endret pasientens medisinske behandling.
Akkreditert av og publisert i
Vanlige spørsmål om helgenomsekvensering.
Hva er forskjellen mellom helgenomsekvensering og en målrettet genetisk test?
Målrettede genetiske tester – inkludert standard arvelige kreftpaneler – leser en forhåndsdefinert liste over kjente varianter i et spesifikt sett med gener. De er utformet for å finne det de allerede vet å lete etter. Helgenomsekvensering leser hele genomet ditt: alle 6 milliarder basepar, hvert gen, hver region mellom gener. En Mayo Clinic-studie publisert i JAMA Oncology fant at standard testretningslinjer gikk glipp av mer enn halvparten av pasientene med arvelige kreftmutasjoner. Genome Test har ikke en fast liste.
Hva får jeg når resultatene mine er klare?
Ditt Dante Genome leverer over 200 rapporter klare for leger, organisert etter klinisk kategori – arvelig kreft, hjertesykdommer, sjeldne sykdommer, farmakogenomikk, bærerstatus og mer. Rapportene leveres til din sikre Genome Manager og er formatert for direkte klinisk bruk. Genomdataene dine lagres permanent og analyseres automatisk på nytt etter hvert som vitenskapen utvikler seg.
Hva skjer hvis en klinisk signifikant variant oppdages?
Hvis en patogen eller sannsynlig patogen variant identifiseres, vil den bli tydelig markert i den legeklare rapporten din med klinisk kontekst, publisert evidens og anbefalte neste skritt. Vi anbefaler å dele eventuelle klinisk signifikante funn med legen din eller en genetisk rådgiver, som kan veilede beslutninger om overvåking, risikoreduksjon eller kaskadetesting for familiemedlemmer.
Hvordan er dette forskjellig fra en forbruker-DNA-test som 23andMe eller AncestryDNA?
Forbruker-DNA-tester bruker genotypingsbrikker som leser mindre enn 0,1 % av genomet ditt – et lite forhåndsvalgt sett med vanlige varianter. De er optimalisert for aner og populasjonsnivåegenskaper, ikke kliniske genetiske funn. Dante Genome Test sekvenserer 100 % av genomet ditt med 30 ganger dekning, samme standard som brukes i kliniske diagnostiske settinger. De to testene er ikke sammenlignbare i omfang, metodikk eller klinisk nytteverdi.
Hvor lang tid tar det å få resultater, og hvordan leveres de?
Prøvesettet ditt sendes innen 48 timer etter bestilling. Når prøven din ankommer vårt CLIA-sertifiserte laboratorium, tar sekvensering og analyse 6–8 uker. Resultatene leveres sikkert til din Genome Manager, hvor du kan få tilgang til rapportene dine, dele dem med legen din og motta automatiske oppdateringer når nye funn valideres mot ditt genom.
Vi samarbeider med pasientorganisasjoner over hele verden.
Dante Labs samarbeider med pasientgrupper av alle størrelser – for PMS2-genet – Lynch syndrom og andre tilstander, både sjeldne og vanlige. Vi støtter grupper i alle land, inkludert virtuelle pasientgrupper.
Vi kan tilby tilpassede rapporter, grupperabatter og pakker skreddersydd for medlemmene dine. Ta kontakt via skjemaet, så tar vi kontakt innen to virkedager.
- Tilpassede genomiske rapporter for medlemmene dine
- Grupperabatter og skreddersydde pakker
- Ethvert land – inkludert virtuelle grupper
- Sjeldne og vanlige tilstander dekkes
Melding mottatt.
Vi tar kontakt innen to virkedager. For å følge opp direkte: hello@dantelabs.com
Én test.
Et liv med svar.
Ett sett, sendt hjem til deg. Hele genomet ditt sekvensert i henhold til den kliniske standarden som brukes for diagnostiske avgjørelser. Over 200 legeklare rapporter levert til din Genome Manager i løpet av 6–8 uker – permanent og oppdatert etter hvert som vitenskapen utvikler seg.
Sendes innen 48 timer · Resultater innen 6–8 uker
