Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

SPANXN1

SPANX family member N1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
Xq27.3
Coördinaten
Chromosoom X: 145.247.503–145.256.208 (GRCh38)
Exons
2 exons over 8,7 kb
Eiwit
72 aminozuren
Ook bekend als
SPANX-N1, CT11.6
MANE Select-transcript
ENST00000370493.4NM_001009614.3
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest SPANXN1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van SPANXN1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom X, met een haakje waar SPANXN1 zich bevindt. SPANXN1 en 0 genen in de buurt op chromosoom X, van 144.751.856 tot 145.751.855.Chromosoom XXq27.3p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28144,8 Mb145 Mb145,2 Mb145,4 Mb145,6 MbSPANXN1: 145.247.503–145.256.208, voorwaartse-strengSPANXN1Diagram van SPANXN1: 2 exons op de voorwaartse streng van chromosoom XExon 1: 145.247.503–145.247.661, 159 basenExon 2: 145.255.671–145.256.208, 538 basen125′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 0,7 kb van de 8,7 kb van het gen; 219 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing van SPANXN1

32Moeilijk

Hoe moeilijk SPANXN1 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100

Een groot deel van SPANXN1 ligt waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.

Wat dit verder beïnvloedt: het aandeel van de exons van SPANXN1 in elk type moeilijke regio

  • Mappability1,6%
  • Homologie85%
  • Repeats39%
  • GC-gehalte0%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs uit ons eigen onderzoek, gebaseerd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt de score berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). SPANXN1-gen: SPANX family member N1. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/spanxn1

Vancouver

Dante Labs. SPANXN1-gen: SPANX family member N1 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/spanxn1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen