Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

PPP1R2

protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2

Samenvatting

Cytogenetische locatie
3q29
Coördinaten
Chromosoom 3: 195.514.428–195.543.325 (GRCh38)
Exons
6 exons over 28,9 kb
Eiwit
205 aminozuren
Ook bekend als
IPP2, PPP1R2A
MANE Select-transcript
ENST00000618156.5NM_006241.8
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest PPP1R2 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van PPP1R2

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 3, met een haakje waar PPP1R2 zich bevindt. PPP1R2 en 8 genen in de buurt op chromosoom 3, van 195.028.877 tot 196.028.876.Chromosoom 33q29p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29195,2 Mb195,4 Mb195,6 Mb195,8 Mb196 MbXXYLT1: 195.067.373–195.271.176, omgekeerde-strengXXYLT1ACAP2: 195.274.738–195.443.139, omgekeerde-strengACAP2PPP1R2: 195.514.428–195.543.325, omgekeerde-strengPPP1R2APOD: 195.568.701–195.584.047, omgekeerde-strengAPODMUC20: 195.720.868–195.741.123, voorwaartse-strengMUC20MUC4: 195.746.765–195.811.973, omgekeerde-strengMUC4TNK2: 195.863.364–195.911.945, omgekeerde-strengTNK2: 195.908.695–195.909.561, omgekeerde-strengTFRC: 196.012.511–196.082.162, omgekeerde-strengTFRCDiagram van PPP1R2: 6 exons op de omgekeerde streng van chromosoom 3Exon 6: 195.514.428–195.516.942, 2.515 basenExon 5: 195.519.018–195.519.185, 168 basenExon 4: 195.523.692–195.523.786, 95 basenExon 3: 195.524.819–195.524.896, 78 basenExon 2: 195.529.794–195.529.901, 108 basenExon 1: 195.542.904–195.543.325, 422 basen6543215′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 3,4 kb van de 28,9 kb van het gen; 618 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing van PPP1R2

28Gemiddeld

Hoe moeilijk PPP1R2 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100

Sommige exons van PPP1R2 liggen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.

Wat dit verder beïnvloedt: het aandeel van de exons van PPP1R2 in elk type moeilijke regio

  • Mappability9,4%
  • Homologie74%
  • Repeats7,3%
  • GC-gehalte12%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs uit ons eigen onderzoek, gebaseerd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt de score berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). PPP1R2-gen: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/ppp1r2

Vancouver

Dante Labs. PPP1R2-gen: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/ppp1r2

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen