Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

KPNB1

karyopherin subunit beta 1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
17q21.32
Coördinaten
Chromosoom 17: 47.649.919–47.685.505 (GRCh38)
Exons
22 exons over 35,6 kb
Eiwit
876 aminozuren
Ook bekend als
NTF97, IPOB, MGC2155, MGC2156, MGC2157, IMB1, Impnb, IPO1
MANE Select-transcript
ENST00000290158.9NM_002265.6
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest KPNB1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van KPNB1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 17, met een haakje waar KPNB1 zich bevindt. KPNB1 en 22 genen in de buurt op chromosoom 17, van 47.167.712 tot 48.167.711.Chromosoom 1717q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.347,2 Mb47,4 Mb47,6 Mb47,8 Mb48 MbCDC27: 47.117.703–47.189.422, omgekeerde-strengCDC27MYL4: 47.188.903–47.227.760, voorwaartse-strengMYL4ITGB3: 47.253.649–47.323.218, voorwaartse-strengITGB3: 47.253.897–47.344.292, voorwaartse-strengEFCAB13: 47.323.290–47.441.312, voorwaartse-strengEFCAB13NPEPPS: 47.522.942–47.624.707, voorwaartse-strengNPEPPSKPNB1: 47.649.919–47.685.505, voorwaartse-strengKPNB1TBKBP1: 47.694.030–47.712.063, voorwaartse-strengTBKBP1TBX21: 47.733.236–47.746.126, voorwaartse-strengTBX21OSBPL7: 47.807.363–47.821.890, omgekeerde-strengOSBPL7MRPL10: 47.823.272–47.831.545, omgekeerde-strengMRPL10LRRC46: 47.831.634–47.837.719, voorwaartse-strengLRRC46SCRN2: 47.837.683–47.842.125, omgekeerde-strengSCRN2SP6: 47.844.908–47.855.874, omgekeerde-strengSP2: 47.896.150–47.928.964, voorwaartse-strengSP2PNPO: 47.941.506–47.964.354, voorwaartse-strengPNPOPRR15L: 47.950.851–47.960.483, omgekeerde-strengPRR15LCDK5RAP3: 47.967.810–47.981.787, voorwaartse-strengCDK5RAP3COPZ2: 48.026.142–48.038.030, omgekeerde-strengCOPZ2NFE2L1: 48.047.889–48.088.647, voorwaartse-strengNFE2L1CBX1: 48.070.052–48.107.848, omgekeerde-strengCBX1SNX11: 48.103.357–48.128.226, voorwaartse-strengSNX11SKAP1: 48.133.433–48.430.275, omgekeerde-strengSKAP1Diagram van KPNB1: 22 exons op de voorwaartse streng van chromosoom 17Exon 1: 47.649.919–47.650.284, 366 basenExon 2: 47.650.386–47.650.444, 59 basenExon 3: 47.652.694–47.652.876, 183 basenExon 4: 47.656.860–47.657.060, 201 basenExon 5: 47.658.508–47.658.660, 153 basenExon 6: 47.661.119–47.661.178, 60 basenExon 7: 47.663.089–47.663.178, 90 basenExon 8: 47.664.159–47.664.269, 111 basenExon 9: 47.665.057–47.665.158, 102 basenExon 10: 47.668.186–47.668.410, 225 basenExon 11: 47.669.678–47.669.869, 192 basenExon 12: 47.670.702–47.670.832, 131 basenExon 13: 47.673.018–47.673.165, 148 basenExon 14: 47.673.490–47.673.561, 72 basenExon 15: 47.674.638–47.674.782, 145 basenExon 16: 47.676.409–47.676.491, 83 basenExon 17: 47.677.020–47.677.127, 108 basenExon 18: 47.678.046–47.678.189, 144 basenExon 19: 47.678.308–47.678.413, 106 basenExon 20: 47.680.020–47.680.134, 115 basenExon 21: 47.680.508–47.680.669, 162 basenExon 22: 47.682.404–47.685.505, 3.102 basen15101520225′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 6,1 kb van de 35,6 kb van het gen; 2.631 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing KPNB1

10Gemiddeld

Hoe moeilijk KPNB1 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Sommige exonen van KPNB1 liggen op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van KPNB1 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability5,3%
  • Homologie20%
  • Herhalingen9,3%
  • GC-gehalte7,3%
  • Referentiedekking0%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). KPNB1-gen: karyopherin subunit beta 1. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/kpnb1

Vancouver

Dante Labs. KPNB1-gen: karyopherin subunit beta 1 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/kpnb1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen