Gen
KHDRBS3
KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3
- HGNC 18117↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000131773↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10656↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 8q24.23
- Coördinaten
- Chromosoom 8: 135.457.456–135.647.610 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons over 190,2 kb
- Eiwit
- 346 aminozuren
- Ook bekend als
- T-STAR, Etle, etoile, SALP, SLM2, SLM-2
- MANE Select-transcript
- ENST00000355849.10NM_006558.3
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/khdrbs3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees KHDRBS3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest KHDRBS3 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van KHDRBS3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2 kb van de 190,2 kb van het gen; 1.041 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van KHDRBS3
6Makkelijk
Hoe moeilijk KHDRBS3 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of KHDRBS3's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of KHDRBS3's exons in each kind of hard region
- MappeerbaarheidStukken waarin reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Gewicht 15%.14%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding dun worden gedekt. Gewicht 10%.39%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assembly, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredElke balk toont het aandeel van de exonbasen van KHDRBS3 in dat type moeilijke regio. De score weegt die aandelen naar hoeveel elk een korte-read-call kost: 0 als geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 als elke base in alle moeilijke regio's ligt.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). KHDRBS3-gen: KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/khdrbs3
Dante Labs. KHDRBS3-gen: KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/khdrbs3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken