Gen
FIGN
fidgetin, microtubule severing factor
- HGNC 13285↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000182263↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 55137↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q24.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 163.602.611–163.736.008 (GRCh38)
- Exons
- 3 exons over 133,4 kb
- Eiwit
- 759 aminozuren
- MANE Select-transcript
- ENST00000333129.4NM_018086.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fign.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees FIGN en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest FIGN nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van FIGN
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 9,5 kb van de 133,4 kb van het gen; 2.280 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van FIGN
1Makkelijk
Hoe moeilijk FIGN is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of FIGN's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of FIGN's exons in each kind of hard region
- MappeerbaarheidStukken waarin reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Gewicht 15%.9,3%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding dun worden gedekt. Gewicht 10%.0%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assembly, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredElke balk toont het aandeel van de exonbasen van FIGN in dat type moeilijke regio. De score weegt die aandelen naar hoeveel elk een korte-read-call kost: 0 als geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 als elke base in alle moeilijke regio's ligt.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). FIGN-gen: fidgetin, microtubule severing factor. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/fign
Dante Labs. FIGN-gen: fidgetin, microtubule severing factor [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/fign
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken