Gen
CYRIA
CYFIP related Rac1 interactor A
- HGNC 25373↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000197872↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 81553↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2p24.2
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 16.549.459–16.665.834 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 116,4 kb
- Eiwit
- 323 aminozuren
- Ook bekend als
- DKFZP566A1524, FLJ11080, CYRI-A
- Eerdere symbolen
- FAM49A
- MANE Select-transcript
- ENST00000381323.7NM_030797.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cyria.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees CYRIA en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest CYRIA nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van CYRIA
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,7 kb van de 116,4 kb van het gen; 972 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van CYRIA
1Makkelijk
Hoe moeilijk CYRIA is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of CYRIA's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of CYRIA's exons in each kind of hard region
- MappeerbaarheidStukken waarin reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Gewicht 15%.6%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding dun worden gedekt. Gewicht 10%.1,2%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assembly, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredElke balk toont het aandeel van de exonbasen van CYRIA in dat type moeilijke regio. De score weegt die aandelen naar hoeveel elk een korte-read-call kost: 0 als geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 als elke base in alle moeilijke regio's ligt.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). CYRIA-gen: CYFIP related Rac1 interactor A. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/cyria
Dante Labs. CYRIA-gen: CYFIP related Rac1 interactor A [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/cyria
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken