Gen
JAK2
Janus kinase 2
- HGNC 6192↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000096968↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 3717↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 9p24.1
- Coördinaten
- Chromosoom 9: 4.985.272–5.129.948 (GRCh38)
- Exons
- 25 exons over 144,7 kb
- Eiwit
- 1.132 aminozuren, 130,7 kDa
- Ook bekend als
- JTK10
- MANE Select-transcript
- ENST00000381652.4NM_004972.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina delen
Deze pagina als data
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag om application/json, om deze als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/jak2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees JAK2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke trombocytemie (JAK2)
- Trombocytemie 3Autosomaal dominant
Veroorzaakt door een erfelijke wijziging in JAK2, dat een signaleringseiwit maakt dat de aanmaak van bloedcellen regelt. De beschreven wijzigingen liggen in de delen van het eiwit die de activiteit ervan regelen en maken het actiever, waardoor de aanmaak van bloedplaatjes toeneemt. De eerst beschreven wijziging, JAK2 R564Q, werd gevonden in een familie met dominant overerfbare trombocytemie.
- GenCC 22 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Vervolgcontrole bij een hematoloog, inclusief controle van de bloedwaarden, omdat bij sommige getroffen families bloedkanker is voorgekomen. Het bewijs is beperkt en voor kinderen bestaan geen afgesproken richtlijnen. Omdat de aandoening autosomaal dominant overerft, heeft elk kind van een getroffen ouder een kans van 1 op 2 de wijziging te erven, en onderzoek van familieleden kan laten zien wie er nog meer drager van is.
Lees JAK2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenOpbouw van JAK2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7 kb van de 144,7 kb van het gen; 3.399 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van JAK2
3Makkelijk
Hoe moeilijk JAK2 is te sequencen met korte reads, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Bijna alle exonen van JAK2 liggen op plaatsen waar korte reads correct worden uitgelijnd.
Wat dit verergert: het aandeel van de exonen van JAK2 in elk type moeilijke regio
- MapbaarheidStukken waar reads van 100 of 250 bp niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 100 krijgen.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- Gedeeld met chrYDe pseudoautosomale regio's en de X-getransponeerde regio, waar chrX en chrY dezelfde of bijna dezelfde sequentie bevatten, zodat een read van de ene op de andere kan worden geplaatst. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- ReferentiedekkingHiaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 50 krijgen.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 30 krijgen.2,7%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding slechts dun worden gedekt. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 20 krijgen.11%
Een Dante Labs-score op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt er gescoordElke balk is het aandeel van de exonbasen van JAK2 in dat type moeilijke regio. Elk type kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra type voegt steeds minder toe: 0 wanneer geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 wanneer elke base ligt waar reads niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst.
5
posities in JAK2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen ervan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een heel genoom dekt alle 144,7 kb van JAK2, inclusief de introns, en niet alleen de 7 kb aan exonen.
ClinVar-pathogene varianten (5)
De JAK2-varianten die ClinVar als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert voor een willekeurige aandoening, beoordeeld door ten minste één indiener met criteria, en de meest beoordeelde daarvan. Het is het openbare ClinVar-register van het gen, nooit een resultaat.
- Pathogeen 1
- Waarschijnlijk pathogeen 4
| Variant | Aandoeningen | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004972.4(JAK2):c.1849G>T (p.Val617Phe) | Budd-Chiari syndrome en 5 andere | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_004972.4(JAK2):c.1691G>A (p.Arg564Gln) | Budd-Chiari syndrome en 5 andere | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_004972.4(JAK2):c.2600G>A (p.Arg867Gln) | Budd-Chiari syndrome en 5 andere | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_004972.4(JAK2):c.2813G>A (p.Arg938Gln) | thrombocythemia 3 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_004972.4(JAK2):c.3284C>T (p.Pro1095Leu) | acquired polycythemia vera | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Kenmerken gekoppeld aan JAK2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die JAK2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Extramedullary hematopoiesis
- Increased circulating hemoglobin concentration
- Increased hematocrit
- Increased number of platelets in blood
- Myelofibrosis
- Abnormal shape of platelets
- Acute blood cancer
- Bleeding gums
Toon 36 kenmerken meer
- Bleeding tendency
- Blood clot in artery
- Blood clot in vein
- Bloody nose
- Bone marrow disease
- Bruising susceptibility
- Increased megakaryocyte count
- Increased red blood cells
- Megakaryocyte nucleus hyperlobulation
- Myelodysplasia
- Platelet abnormalities
- Prolonged bleeding time
- Abnormal megakaryocyte morphology
- Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood clot in liver vein
- Low number of red blood cells or hemoglobin
- Low platelet count
- Abnormal blood clot
- Acute myeloid leukemia
- Blood clot in portal vein
- Blood spots
- Bone marrow hypercellularity
- Chronic myelogenous leukemia
- Ecchymosis
- Elevated white blood count
- Gastrointestinal bleeding
- Low blood cell count
- Petechiae
- Poikilocytosis
- Blood tumor
- Bleeding in brain
- Increased micromegakaryocyte count
- Increased red blood cell mass
- Myeloproliferative disorder
- Peripheral blood clot
- Thromboembolism
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-23: welke aandoeningen het gen met elkaar verbindt en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's die korte reads moeilijk vinden.
- De Genome in a Bottle-genoomstratificaties van NIST: de score voor de moeilijkheid van de sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- AlphaFold DB-model AF-O60674-F1, versie 6, van Google DeepMind en EMBL-EBI (CC BY 4.0): de eiwitstructuur zoals AlphaFold die voorspelt, niet zoals die is gemeten, en de betrouwbaarheid ervan in elk deel.
- Gegevensrelease 2026.10.23-dc0c0517.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). JAK2-gen: Janus kinase 2. Geraadpleegd op 24 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/jak2
Dante Labs. JAK2-gen: Janus kinase 2 [Internet]. [geraadpleegd 24 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/jak2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken