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Gene

TET1

tet methylcytosine dioxygenase 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
10q21.3
Coordinate
Cromosoma 10: 68.560.337–68.694.487 (GRCh38)
Esoni
12 esoni su 134,2 kb
Proteina
2136 amminoacidi
Noto anche come
LCX, KIAA1676, bA119F7.1
Simboli precedenti
CXXC6
Trascritto MANE Select
ENST00000373644.5NM_030625.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora TET1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di TET1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 10, con una parentesi dove si trova TET1. TET1 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 10, da 68.127.412 a 69.127.411.Cromosoma 1010q21.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.368,2 Mb68,4 Mb68,6 Mb68,8 Mb69 MbMYPN: 68.087.897–68.212.017, filamento direttoMYPNATOH7: 68.230.595–68.232.113, filamento inversoATOH7PBLD: 68.262.014–68.334.114, filamento inversoPBLDHNRNPH3: 68.331.174–68.344.002, filamento direttoHNRNPH3RUFY2: 68.341.107–68.407.381, filamento inversoRUFY2DNA2: 68.414.061–68.472.121, filamento inversoDNA2SLC25A16: 68.473.079–68.527.539, filamento inversoSLC25A16TET1: 68.560.337–68.694.487, filamento direttoTET1CCAR1: 68.721.012–68.793.908, filamento direttoCCAR1STOX1: 68.827.199–68.895.448, filamento direttoSTOX1DDX50: 68.901.199–68.947.348, filamento direttoDDX50DDX21: 68.956.135–68.985.417, filamento direttoDDX21KIFBP: 68.988.732–69.043.544, filamento direttoKIFBPSRGN: 69.087.579–69.105.696, filamento direttoSRGNVPS26A: 69.123.512–69.174.412, filamento direttoVPS26ADiagramma di TET1: 12 esoni sul filamento diretto del cromosoma 10Esone 1: 68.560.337–68.560.742, 406 basiEsone 2: 68.572.217–68.574.252, 2036 basiEsone 3: 68.600.981–68.601.034, 54 basiEsone 4: 68.644.698–68.647.005, 2308 basiEsone 5: 68.651.846–68.651.936, 91 basiEsone 6: 68.652.501–68.652.594, 94 basiEsone 7: 68.667.045–68.667.256, 212 basiEsone 8: 68.672.895–68.673.045, 151 basiEsone 9: 68.681.399–68.681.488, 90 basiEsone 10: 68.682.836–68.682.973, 138 basiEsone 11: 68.686.356–68.686.707, 352 basiEsone 12: 68.690.808–68.694.487, 3680 basi1246810125′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 9,6 kb dei 134,2 kb del gene; 6411 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene TET1: tet methylcytosine dioxygenase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/tet1

Vancouver

Dante Labs. Gene TET1: tet methylcytosine dioxygenase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/tet1

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