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Gene

SPATS2

spermatogenesis associated serine rich 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q13.12
Coordinate
Cromosoma 12: 49.367.462–49.527.425 (GRCh38)
Esoni
14 esoni su 160 kb
Proteina
545 amminoacidi
Noto anche come
SPATA10, SCR59, FLJ13117
Trascritto MANE Select
ENST00000552918.6NM_023071.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SPATS2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SPATS2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova SPATS2. SPATS2 e 27 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 48.947.444 a 49.947.443.Cromosoma 1212q13.12p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3349 Mb49,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 MbARF3: 48.903.141–48.957.531, filamento inversoARF3: 48.903.503–48.957.365, filamento inversoWNT10B: 48.965.185–48.972.669, filamento inversoWNT1: 48.978.322–48.982.620, filamento direttoWNT1DDN: 48.995.149–48.999.375, filamento inversoDDNPRKAG1: 49.002.272–49.018.820, filamento inversoPRKAG1: 49.002.274–49.024.075, filamento inversoKMT2D: 49.018.975–49.060.794, filamento inversoKMT2DRHEBL1: 49.064.675–49.070.127, filamento inversoRHEBL1DHH: 49.086.656–49.094.807, filamento inversoDHHLMBR1L: 49.096.550–49.110.900, filamento inversoLMBR1LTUBA1B: 49.127.780–49.131.398, filamento inversoTUBA1BTUBA1A: 49.184.146–49.189.324, filamento inversoTUBA1ATUBA1C: 49.188.736–49.274.600, filamento direttoTUBA1CPRPH: 49.295.141–49.298.686, filamento direttoPRPHTROAP: 49.323.165–49.331.735, filamento direttoTROAPC1QL4: 49.332.409–49.337.227, filamento inversoC1QL4DNAJC22: 49.345.607–49.357.546, filamento direttoDNAJC22SPATS2: 49.367.462–49.527.425, filamento direttoSPATS2KCNH3: 49.539.020–49.558.346, filamento direttoKCNH3MCRS1: 49.556.544–49.568.150, filamento inversoMCRS1PRPF40B: 49.568.218–49.644.666, filamento direttoPRPF40BFAM186B: 49.582.885–49.605.639, filamento inversoFAM186BFMNL3: 49.636.499–49.708.165, filamento inversoFMNL3TMBIM6: 49.707.725–49.764.935, filamento direttoTMBIM6NCKAP5L: 49.790.615–49.828.750, filamento inversoNCKAP5LBCDIN3D: 49.836.043–49.843.133, filamento inversoBCDIN3DFAIM2: 49.866.896–49.904.217, filamento inversoFAIM2Diagramma di SPATS2: 14 esoni sul filamento diretto del cromosoma 12Esone 1: 49.367.462–49.367.587, 126 basiEsone 2: 49.371.228–49.371.290, 63 basiEsone 3: 49.460.770–49.461.037, 268 basiEsone 4: 49.484.590–49.484.669, 80 basiEsone 5: 49.489.465–49.489.573, 109 basiEsone 6: 49.490.682–49.490.731, 50 basiEsone 7: 49.494.741–49.495.002, 262 basiEsone 8: 49.496.833–49.497.009, 177 basiEsone 9: 49.500.070–49.500.205, 136 basiEsone 10: 49.514.555–49.514.613, 59 basiEsone 11: 49.519.073–49.519.182, 110 basiEsone 12: 49.522.751–49.522.853, 103 basiEsone 13: 49.524.682–49.524.896, 215 basiEsone 14: 49.525.944–49.527.425, 1482 basi124681012145′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,2 kb dei 160 kb del gene; 1638 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SPATS2: spermatogenesis associated serine rich 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/spats2

Vancouver

Dante Labs. Gene SPATS2: spermatogenesis associated serine rich 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/spats2

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