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Gene

SELENOS

selenoprotein S

Sintesi

Localizzazione citogenetica
15q26.3
Coordinate
Cromosoma 15: 101.272.191–101.277.485 (GRCh38)
Esoni
6 esoni su 5,3 kb
Proteina
189 amminoacidi
Noto anche come
SELS, MGC2553, SBBI8, AD-015, SEPS1
Simboli precedenti
VIMP
Trascritto MANE Select
ENST00000526049.6NM_018445.6
Tipo di locus
Codificanti per proteine

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SELENOS. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SELENOS

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 15, con una parentesi dove si trova SELENOS. SELENOS e 7 geni nelle vicinanze sul cromosoma 15, da 100.774.838 a 101.774.837.Cromosoma 1515q26.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.3100,8 Mb101 Mb101,2 Mb101,4 Mb101,6 MbALDH1A3: 100.861.924–100.916.760, filamento direttoALDH1A3LRRK1: 100.918.893–101.078.257, filamento direttoLRRK1CHSY1: 101.145.640–101.252.339, filamento inversoCHSY1SELENOS: 101.272.191–101.277.485, filamento inversoSELENOSSNRPA1: 101.281.508–101.295.305, filamento inversoSNRPA1PCSK6: 101.289.784–101.525.202, filamento inversoPCSK6TM2D3: 101.555.713–101.652.401, filamento inversoTM2D3TARS3: 101.653.575–101.724.565, filamento inversoTARS3Diagramma di SELENOS: 6 esoni sul filamento inverso del cromosoma 15Esone 6: 101.272.191–101.272.856, 666 basiEsone 5: 101.274.420–101.274.495, 76 basiEsone 4: 101.274.592–101.274.681, 90 basiEsone 3: 101.275.255–101.275.361, 107 basiEsone 2: 101.276.541–101.276.675, 135 basiEsone 1: 101.277.342–101.277.485, 144 basi6543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 1,2 kb dei 5,3 kb del gene; 570 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di SELENOS

4Facile

Quanto è difficile sequenziare SELENOS con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di SELENOS si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di SELENOS in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni6,4%
  • Contenuto GC28%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SELENOS: selenoprotein S. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/selenos

Vancouver

Dante Labs. Gene SELENOS: selenoprotein S [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/selenos

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