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Gene

FYCO1

FYVE and coiled-coil domain autophagy adaptor 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3p21.31
Coordinate
Cromosoma 3: 45.917.903–45.995.824 (GRCh38)
Esoni
18 esoni su 77,9 kb
Proteina
1478 amminoacidi
Noto anche come
FLJ13335, ZFYVE7
Trascritto MANE Select
ENST00000296137.7NM_024513.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora FYCO1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di FYCO1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova FYCO1. FYCO1 e 14 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 45.456.864 a 46.456.863.Cromosoma 33p21.31p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2945,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 MbLARS2: 45.388.516–45.554.726, filamento direttoLARS2LIMD1: 45.555.394–45.686.341, filamento direttoLIMD1SACM1L: 45.689.056–45.745.425, filamento direttoSACM1LSLC6A20: 45.748.903–45.796.654, filamento inversoSLC6A20LZTFL1: 45.823.316–45.916.042, filamento inversoLZTFL1CCR9: 45.884.425–45.904.311, filamento direttoCCR9FYCO1: 45.917.903–45.995.824, filamento inversoFYCO1CXCR6: 45.940.915–45.948.640, filamento direttoCXCR6XCR1: 46.016.988–46.085.850, filamento inversoXCR1CCR3: 46.130.890–46.266.717, filamento direttoCCR3CCR1: 46.201.709–46.208.676, filamento inversoCCR1CCR2: 46.353.864–46.360.940, filamento direttoCCR2CCR5: 46.370.939–46.377.528, filamento direttoCCR5CCRL2: 46.407.144–46.412.997, filamento direttoCCRL2LTF: 46.434.347–46.485.234, filamento inversoLTFDiagramma di FYCO1: 18 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 14: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 12: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 11: 4 siti noti causativi di malattiaEsone 10: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 12 siti noti causativi di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 4: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 18: 45.917.903–45.921.840, 3938 basiEsone 17: 45.923.656–45.923.765, 110 basiEsone 16: 45.931.071–45.931.281, 211 basiEsone 15: 45.936.448–45.936.543, 96 basiEsone 14: 45.955.249–45.955.393, 145 basiEsone 13: 45.958.408–45.958.619, 212 basiEsone 12: 45.959.393–45.959.542, 150 basiEsone 11: 45.962.225–45.962.392, 168 basiEsone 10: 45.964.336–45.964.454, 119 basiEsone 9: 45.965.033–45.965.125, 93 basiEsone 8: 45.966.277–45.968.703, 2427 basiEsone 7: 45.969.675–45.969.765, 91 basiEsone 6: 45.973.088–45.973.231, 144 basiEsone 5: 45.975.239–45.975.345, 107 basiEsone 4: 45.979.705–45.979.830, 126 basiEsone 3: 45.981.570–45.981.676, 107 basiEsone 2: 45.984.856–45.985.022, 167 basiEsone 1: 45.995.722–45.995.824, 103 basi1816141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8,5 kb dei 77,9 kb del gene; 4437 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge FYCO1

28

posizioni in FYCO1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 77,9 kb di FYCO1, introni inclusi, non solo i 8,5 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene FYCO1: FYVE and coiled-coil domain autophagy adaptor 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/fyco1

Vancouver

Dante Labs. Gene FYCO1: FYVE and coiled-coil domain autophagy adaptor 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/fyco1

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