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Gene

CASC3

CASC3 exon junction complex subunit

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17q21.1
Coordinate
Cromosoma 17: 40.140.537–40.172.171 (GRCh38)
Esoni
14 esoni su 31,6 kb
Proteina
703 amminoacidi
Noto anche come
MLN51, BTZ
Trascritto MANE Select
ENST00000264645.12NM_007359.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CASC3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CASC3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova CASC3. CASC3 e 31 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 39.656.354 a 40.656.353.Cromosoma 1717q21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.339,8 Mb40 Mb40,2 Mb40,4 Mb40,6 MbSTARD3: 39.637.058–39.664.201, filamento direttoTCAP: 39.664.990–39.666.554, filamento direttoTCAPPNMT: 39.667.981–39.670.484, filamento direttoPNMTPGAP3: 39.671.120–39.696.797, filamento inversoPGAP3ERBB2: 39.687.914–39.730.426, filamento direttoERBB2MIEN1: 39.728.496–39.730.555, filamento inversoMIEN1GRB7: 39.737.490–39.747.292, filamento direttoGRB7IKZF3: 39.757.715–39.864.368, filamento inversoIKZF3ZPBP2: 39.868.202–39.877.896, filamento direttoZPBP2GSDMB: 39.904.595–39.919.854, filamento inversoGSDMBORMDL3: 39.919.927–39.982.186, filamento inversoORMDL3LRRC3C: 39.927.725–39.946.538, filamento direttoLRRC3CGSDMA: 39.953.263–39.977.875, filamento direttoGSDMAPSMD3: 39.980.800–39.997.960, filamento direttoPSMD3CSF3: 40.015.361–40.017.816, filamento direttoCSF3MED24: 40.019.097–40.061.215, filamento inversoMED24THRA: 40.058.290–40.093.867, filamento direttoTHRANR1D1: 40.092.793–40.100.630, filamento inversoNR1D1MSL1: 40.121.637–40.136.935, filamento direttoMSL1CASC3: 40.140.537–40.172.171, filamento direttoCASC3RAPGEFL1: 40.177.010–40.195.656, filamento direttoRAPGEFL1WIPF2: 40.218.743–40.284.136, filamento direttoWIPF2CDC6: 40.287.831–40.304.657, filamento direttoCDC6RARA: 40.309.165–40.357.643, filamento direttoRARAGJD3: 40.360.652–40.364.737, filamento inversoGJD3TOP2A: 40.388.521–40.417.941, filamento inversoTOP2AIGFBP4: 40.442.913–40.460.822, filamento direttoIGFBP4TNS4: 40.475.828–40.501.630, filamento inversoTNS4CCR7: 40.551.081–40.565.478, filamento inversoCCR7SMARCE1: 40.624.962–40.648.667, filamento inversoSMARCE1: 40.627.356–40.665.141, filamento inversoKRT222: 40.654.665–40.665.181, filamento inversoKRT222Diagramma di CASC3: 14 esoni sul filamento diretto del cromosoma 17Esone 1: 40.140.537–40.140.779, 243 basiEsone 2: 40.141.207–40.141.234, 28 basiEsone 3: 40.141.570–40.141.607, 38 basiEsone 4: 40.161.753–40.161.911, 159 basiEsone 5: 40.162.002–40.162.153, 152 basiEsone 6: 40.162.725–40.162.901, 177 basiEsone 7: 40.163.481–40.164.166, 686 basiEsone 8: 40.166.797–40.166.861, 65 basiEsone 9: 40.167.498–40.167.612, 115 basiEsone 10: 40.167.850–40.167.948, 99 basiEsone 11: 40.168.203–40.168.417, 215 basiEsone 12: 40.169.324–40.169.446, 123 basiEsone 13: 40.169.598–40.169.662, 65 basiEsone 14: 40.170.447–40.172.171, 1725 basi124681012145′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,9 kb dei 31,6 kb del gene; 2112 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CASC3: CASC3 exon junction complex subunit. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/casc3

Vancouver

Dante Labs. Gene CASC3: CASC3 exon junction complex subunit [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/casc3

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