La talassemia — la malattia monogenica più diffusa al mondo, in cui il genotipo completo della globina determina se una persona è portatrice asintomatica, affetta da una patologia cronica curabile o da una malattia che richiede trasfusioni.
Il sequenziamento dell'intero genoma analizza i cluster genici completi dell'alfa-globina (HBA1/HBA2) e della beta-globina (HBB), individuando ogni delezione, mutazione puntiforme e combinazione eterozigote composta: un quadro completo che i test standard di screening dei portatori non riescono a caratterizzare.
Talassemia
Le sindromi talassemiche sono emoglobinopatie autosomiche recessive causate da una produzione ridotta o assente delle catene alfa o beta della globina, che porta a uno squilibrio nella sintesi delle catene della globina, a un’eritropoiesi inefficace e ad anemia emolitica cronica. Nel loro insieme, le talassemie sono le malattie monogeniche più comuni al mondo: si stima che 270 milioni di persone siano portatrici di una variante della talassemia e che ogni anno nascano circa 60.000 bambini gravemente affetti. La frequenza dei portatori di talassemia è più elevata nelle regioni in cui la malaria è endemica: il Mediterraneo, l'Africa subsahariana, il Medio Oriente, l'Asia meridionale e sud-orientale e la Cina meridionale.
L'alfa-talassemia è causata da delezioni o mutazioni che interessano i geni HBA1 e HBA2 sul cromosoma 16p13.3. Poiché esistono quattro copie dei geni dell'alfa-globina (due HBA1 e due HBA2 su ciascun cromosoma 16), la gravità dell'alfa-talassemia segue un gradiente dose-dipendente: un gene deleto (portatore silente di alfa-talassemia), due geni deleti (tratto alfa-talassemico), tre geni deleti (malattia di HbH, anemia moderata), quattro geni deleti (idrope fetale di Hb Bart, uniformemente fatale in utero senza intervento). La beta-talassemia è causata da mutazioni puntiformi o piccole inserzioni/delezioni nel gene HBB. La beta-talassemia major (anemia di Cooley, beta⁰/beta⁰) richiede trasfusioni per tutta la vita; la beta-talassemia intermedia ha una gravità variabile; il tratto beta-talassemico è asintomatico.
L'architettura genetica della talassemia è tra le più complesse tra tutte le malattie mendeliane. Sono state caratterizzate oltre 300 varianti della beta-globina e decine di tipi di delezione dell'alfa-globina. L'eterozigosi composta — ovvero l'eredità di varianti della talassemia diverse da ciascun genitore — dà origine a fenotipi non prevedibili sulla base di una sola delle due varianti. La coeredità di alfa- e beta-talassemia modifica la gravità della malattia: l'alfa-talassemia concomitante riduce lo squilibrio delle catene di globina nella beta-talassemia, migliorando paradossalmente la condizione. La terapia genica (betibeglogene autotemcel, approvata nel 2022) e l'editing genetico (exagamglogene autotemcel/exa-cel, approvato nel 2023) offrono un potenziale curativo per i pazienti trasfusione-dipendenti, rendendo la genotipizzazione definitiva direttamente abilitante al trattamento.
L'alfa-talassemia e la beta-talassemia coinvolgono geni e modelli di trasmissione ereditaria diversi. Le combinazioni eterozigoti composte danno origine a fenotipi clinici distinti che non è possibile prevedere sulla base dei soli test sulle singole varianti.
Test di screening standard per individuare le varianti regionali più comuni della talassemia. Non è in grado di identificare il genotipo completo della delezione dell'alfa-globina, gli stati di eterozigosi composta né i loci modificatori che determinano la gravità clinica e il rischio riproduttivo.
Il numero di copie del gene dell'alfa-globina richiede una risoluzione a livello genomico: i pannelli di SNP non sono in grado di determinarlo
L'alfa-talassemia è causata prevalentemente da delezioni estese che eliminano uno o entrambi i geni dell'alfa-globina da un cromosoma. Per determinare il numero di copie funzionali residue del gene dell'alfa-globina — il principale fattore determinante della gravità clinica — è necessaria una mappatura della delezione con caratterizzazione dei punti di rottura. I pannelli di screening dei portatori basati sugli SNP non rilevano le delezioni geniche. Anche i test mirati per le delezioni (MLPA, Gap-PCR) valutano solo i tipi di delezione regionale più comuni e potrebbero non rilevare delezioni rare o atipiche. Il sequenziamento dell'intero genoma mappa tutte le delezioni dell'alfa-globina, determina il numero preciso di copie del gene e caratterizza i punti di rottura — le informazioni necessarie per distinguere il tratto alfa-talassemico (configurazioni di delezione "cis" vs "trans") e prevedere il rischio di idrope fetale.
Per poter beneficiare della terapia genica è necessario conoscere il genotipo definitivo, non il risultato dello screening
L'approvazione di betibeglogene autotemcel (Zynteglo, 2022) ed exa-cel (Casgevy, 2023) per la beta-talassemia trasfusionale ha reso la genotipizzazione definitiva dell'HBB un requisito diretto per l'accesso al trattamento. I criteri di idoneità alla terapia genica specificano il genotipo della beta-talassemia e, in alcuni protocolli, escludono determinati tipi di varianti. Per i pazienti sottoposti a valutazione per la terapia genica curativa o l'editing genetico, è necessario stabilire con certezza il genotipo completo della globina, compresa l'identificazione di qualsiasi alfa-talassemia coereditaria che possa influenzare la risposta al trattamento. Il sequenziamento dell'intero genoma fornisce questo genotipo definitivo in un unico test completo.
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Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.
Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?
I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.
Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?
Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.
Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?
Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.
In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?
I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.
Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?
Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.
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Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per la talassemia e altre patologie, sia rare che comuni. Sosteniamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.
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