ATROFIA MUSCOLARE SPINALE

Atrofia muscolare spinale: una persona su 50 è portatrice di una variante del gene SMN1. L'identificazione dei portatori prima della pianificazione familiare e la diagnosi precoce nei neonati consentono l'accesso a terapie geniche in grado di cambiare radicalmente l'esito della malattia.

Il sequenziamento dell'intero genoma consente di identificare le delezioni del gene SMN1 e il numero di copie del gene SMN2, rendendo così possibile un trattamento presintomatico mediante terapia genica o farmaci modificanti il decorso della malattia.

Certificato CLIA Accreditato CAP Laboratorio medico ISO 15189 Annunci ACMG HIPAA e GDPR Oltre 100.000genomi sequenziati
INFORMAZIONI SULL'ATROFIA MUSCOLARE SPINALE

Atrofia muscolare spinale (SMA)

Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive motor neuron disease caused by loss of function of SMN1 (survival motor neuron 1) gene, resulting in degeneration of anterior horn motor neurons. Incidence is approximately 1 in 6,000–10,000 live births; carrier frequency is approximately 1 in 50 across populations. SMA is characterized by progressive weakness, starting proximally and advancing distally, with respiratory and bulbar involvement in severe forms. The disease is classified into types based on age of onset and maximum motor function achieved: Type I (severe, onset <6 months, never able to sit independently, often fatal by age 2 without treatment), Type II (intermediate, onset 6–18 months, able to sit but never walk), Type III (mild, onset >18 months, able to walk), and Type IV (adult-onset). Approximately 95–98% of SMA cases are caused by homozygous deletion of SMN1 exons 7–8; the remaining cases result from homozygous or compound heterozygous point mutations. Disease severity is dramatically modulated by SMN2 copy number: SMN2 encodes an almost identical protein but with a critical splicing difference that produces mostly non-functional truncated protein; however, approximately 15% of SMN2 transcripts include exon 7, producing functional SMN protein.

SMN1 e SMN2 sono geni quasi identici (99,9% di omologia di sequenza) situati in tandem sul cromosoma 5q13, una regione caratterizzata da un’elevata omologia di sequenza e da frequenti variazioni del numero di copie. Il gene SMN codifica la proteina di sopravvivenza dei motoneuroni, fondamentale per la biogenesi degli snRNP e lo splicing dell’mRNA nei neuroni; la perdita della proteina SMN causa la degenerazione dei motoneuroni. SMN2 è presente in più copie nella maggior parte degli individui (1–4 copie, mediana 2) a causa della duplicazione. Sebbene SMN2 non possa compensare completamente la perdita di SMN1 a causa della carenza di splicing dell'esone 7, il numero di copie di SMN2 determina in modo critico la gravità della malattia: 1–2 copie producono tipicamente il Tipo I (grave); 3 copie producono il Tipo II (intermedio); 3–4 copie sono correlate al Tipo III (lieve). I pazienti affetti da SMA presintomatica individuati tramite screening neonatale con 2–3 copie di SMN2 sono a rischio di Tipo I o II; quelli con ≥4 copie presentano un rischio immediato inferiore, sebbene un trattamento precoce possa comunque prevenire l'espressione del fenotipo.

La genotipizzazione dei geni SMN1/SMN2 è fondamentale per la diagnosi della SMA e la scelta della terapia. Sono disponibili tre terapie approvate: nusinersen (Spinraza), un oligonucleotide antisenso somministrato per via intratecale che modula lo splicing del gene SMN2 per aumentare l’inclusione dell’esone 7 e la produzione della proteina SMN2 a lunghezza intera; onasemnogene abeparvovec (Zolgensma), una terapia genica che utilizza l'AAV9 per somministrare cDNA SMN1 funzionale per via endovenosa in un'unica infusione — un approccio curativo una tantum ora preferito nei pazienti presintomatici; e risdiplam (Evrysdi), un modificatore dello splicing orale che consente il trattamento domiciliare. Il trattamento presintomatico (neonati con diagnosi alla nascita) produce risultati notevolmente migliori: la maggior parte dei neonati presintomatici trattati non sviluppa mai sintomi osservabili di SMA e raggiunge tappe motorie normali o quasi normali. Il numero di copie di SMN2 aiuta a prevedere la gravità naturale della malattia e guida la prognosi, sebbene il trattamento precoce possa prevenire l'espressione del fenotipo anche nei pazienti destinati ad essere di Tipo I.

PERCHÉ IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA COMPLETO

Il sequenziamento standard non è in grado di distinguere in modo affidabile il gene SMN1 dal gene SMN2 a causa dell'elevata omologia di sequenza. È necessaria un'analisi specializzata del numero di copie.

La determinazione del numero di copie dei geni SMN1/SMN2 richiede un'analisi specialistica

La SMA è ora inclusa nel RUSP (pannello raccomandato per lo screening neonatale) nella maggior parte degli Stati Uniti e lo screening dei portatori sta diventando sempre più diffuso. Il sequenziamento standard non è in grado di distinguere in modo affidabile tra le copie di SMN1 e SMN2 a causa della loro omologia di sequenza del 99,9%; sono necessarie tecniche specializzate di analisi del numero di copie (ibridazione genomica comparativa, MLPA o NGS mirato con mappatura specializzata delle letture). I pannelli di screening dei portatori in genere rilevano la delezione di SMN1, ma potrebbero non determinare con precisione il numero di copie di SMN2. Il sequenziamento dell'intero genoma con algoritmi specializzati per il rilevamento del numero di copie può fornire una valutazione accurata del numero di copie di SMN1/SMN2, consentendo uno screening completo dei portatori e la previsione della gravità della malattia.

Il numero di copie del gene SMN2 determina la gravità della malattia e orienta la terapia presintomatica

Il numero di copie del gene SMN2 è il principale fattore che determina la gravità della malattia: 1–2 copie indicano la malattia di tipo I (grave, a esordio infantile); 3 copie indicano il tipo II (intermedio, esordio tra i 6 e i 18 mesi); 3–4 copie corrispondono al tipo III (lieve, con capacità di deambulare). I pazienti affetti da SMA presintomatica individuati tramite screening neonatale con 2–3 copie di SMN2 sono a rischio di rapida progressione della malattia e necessitano dell’avvio immediato della terapia. Quelli con ≥4 copie presentano un rischio immediato inferiore, ma traggono beneficio da un trattamento precoce. Tre terapie approvate offrono risultati trasformativi: la terapia genica (Zolgensma) è una cura una tantum; la terapia antisenso (Spinraza) richiede infusioni intratecali ripetute; la terapia orale (Evrysdi) consente il trattamento domiciliare. Documentato nella cartella clinica, il genotipo SMN consente la diagnosi presintomatica e l'avvio rapido della terapia, prevenendo lo sviluppo della malattia e consentendo un normale sviluppo motorio.

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Un paziente aveva trascorso decenni nel sistema sanitario britannico senza una diagnosi. I dati di Dante, accettati dai team clinici del Servizio Sanitario Nazionale (NHS) presso il Queen Elizabeth University Hospital di Glasgow, hanno permesso di identificare la sindrome di Noonan e una variante del gene RUNX1 associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Dopo 40 anni, hanno finalmente ottenuto una risposta.

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Un paziente si è rivolto a Dante per indagare su un caso di paralisi periodica. L'analisi del genoma completo ha permesso di individuare una patologia cardiaca ereditaria concomitante — la sindrome di Brugada — che il medico curante ha confermato con un ECG. Il risultato ha inoltre chiarito la storia cardiaca irrisolta di un membro della famiglia. Un solo esame. Tutte le risposte in un unico risultato.

Sequenziamento effettuato nel 2019. I dati sono stati analizzati nel 2021.

Jennifer ha fatto sequenziare il proprio genoma con Dante due anni prima della diagnosi di cancro al seno. All’inizio della terapia, i dati farmacogenomici di Dante hanno indicato che la chemioterapia prescritta le avrebbe causato gravi effetti collaterali. Il suo medico ha scelto un’alternativa e lei ha iniziato un trattamento efficace fin dal primo giorno.

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Il test Dante Genome ha aiutato gli specialisti di un ospedale di pronto soccorso nazionale del Regno Unito a diagnosticare la sindrome di Noonan e una rara variante genetica associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Questo risultato ha cambiato il percorso terapeutico del paziente.

Accreditato da e pubblicato su

Emendamenti per il miglioramento dei laboratori clinici Collegio dei Patologi Americani Società Americana di Genetica Umana Nature Società Internazionale per la Terapia Cellulare e Genica Gene Journal
DOMANDE FREQUENTI

Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.

Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?

I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.

Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?

Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.

Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?

Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.

In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?

I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.

Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?

Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.

ASSOCIAZIONI DI DIFESA DEI DIRITTI DEI PAZIENTI

Collaboriamo con associazioni di tutela dei pazienti in tutto il mondo.

Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per l'atrofia muscolare spinale (SMA) e altre patologie, sia rare che comuni. Sosteniamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.

Possiamo fornire report personalizzati, sconti per gruppi e pacchetti su misura per i vostri soci. Contattateci tramite il modulo e vi risponderemo entro due giorni lavorativi.

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