CARENZA DI PIRUVATO CHINASI

Deficit di piruvato chinasi — il difetto enzimatico glicolitico più comune all’origine dell’anemia emolitica cronica, per il quale è ora disponibile la prima terapia modificante il decorso della malattia approvata dalla FDA (mitapivat, 2022), in cui il genotipo del gene PKLR determina la risposta al trattamento.

Il sequenziamento dell'intero genoma identifica tutte le varianti del gene PKLR, consentendo di stabilire se il mitapivat (Pyrukynd) attiverà l'enzima piruvato chinasi mutante specifico del paziente o se la variante produce una proteina che non può essere ripristinata farmacologicamente.

Certificato CLIA Accreditato CAP Laboratorio medico ISO 15189 Annunci ACMG HIPAA e GDPR Oltre 100.000genomi sequenziati
INFORMAZIONI SULLA DEFICIENZA DI PIRUVATO CHINASI

Anemia emolitica ereditaria — Carenza di glucosio-6-fosfato isomerasi e carenza di piruvato chinasi

Il deficit di piruvato chinasi (PKD) è il difetto enzimatico glicolitico più comune all’origine dell’anemia emolitica ereditaria non sferocitica (HNSHA), che colpisce circa 1 persona su 20.000 in tutto il mondo. È causato da varianti patogene autosomiche recessive nel gene PKLR (cromosoma 1q22), che codifica l’isoforma epatica/eritrocitaria della piruvato chinasi. Il deficit di PK compromette la produzione glicolitica di ATP nei globuli rossi maturi (che sono privi di mitocondri e dipendono interamente dalla glicolisi per l’energia), causando emolisi extravascolare cronica con anemia, reticolocitosi, ittero, splenomegalia e calcoli biliari.

La gravità clinica varia notevolmente: si va dall’emolisi completamente compensata (emoglobina normale mantenuta grazie a un aumento della produzione di reticolociti) all’anemia grave trasfusionale, che richiede trasfusioni regolari di globuli rossi fin dalla prima infanzia. Nelle forme più gravi si verifica l'idrope fetale. Il sovraccarico di ferro è una delle principali complicanze a lungo termine, che si sviluppa sia nei pazienti che necessitano di trasfusioni sia in quelli che non ne necessitano, a causa di un assorbimento intestinale inappropriato del ferro determinato dall'emolisi cronica e dall'eritropoiesi inefficace. La splenectomia allevia parzialmente l'anemia ma non la cura e comporta un rischio di infezione per tutta la vita.

Il mitapivat (Pyrukynd, Agios Pharmaceuticals) è stato approvato dalla FDA nel 2022 per il trattamento dell’anemia emolitica negli adulti affetti da PKD: si tratta della prima terapia modificante il decorso della malattia per qualsiasi enzimopatia glicolitica. Il mitapivat è un attivatore allosterico orale della piruvato chinasi che si lega al tetramero della PK e lo stabilizza, aumentando l’attività catalitica dell’enzima mutante. Il trattamento aumenta l'emoglobina, riduce i marcatori di emolisi e, nei pazienti che necessitano di trasfusioni, può ridurre o eliminare la necessità di trasfusioni. Tuttavia, la risposta al mitapivat dipende dallo specifico genotipo PKLR: le varianti che non producono proteine (alleli nulli) non possono essere attivate farmacologicamente. Per la pianificazione del trattamento è necessaria la genotipizzazione molecolare del PKLR.

Il mitapivat è in grado di attivare solo le varianti della PK che producono un enzima strutturalmente intatto ma funzionalmente compromesso. Le varianti PKLR nulle (che non producono alcuna proteina) non rispondono al trattamento. È il genotipo a determinare se il farmaco ha un bersaglio molecolare su cui agire.

PERCHÉ IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA COMPLETO

In passato, la PKD veniva trattata esclusivamente con splenectomia e supporto trasfusionale. Il mitapivat cambia questa situazione, ma per stabilire l'idoneità al trattamento è necessario eseguire un genotipizzazione molecolare della PKLR, al fine di determinare se la variante specifica possa essere trattata farmacologicamente.

La reattività del mitapivato dipende dal fatto che la variante del gene PKLR produca o meno un enzima attivabile: la genotipizzazione molecolare consente di prevedere questo aspetto

Le varianti missenso del gene PKLR che producono un enzima piruvato chinasi strutturalmente intatto ma con funzionalità cinetica compromessa sono candidate all’attivazione da parte del mitapivat: il farmaco stabilizza il tetramero della PK e ripristina parzialmente l’efficienza catalitica. Al contrario, le varianti nonsense, frameshift o di splicing del gene PKLR che non producono alcuna proteina stabile non possono essere recuperate farmacologicamente. I pazienti omozigoti per alleli nulli sono considerati non-responder, mentre i pazienti eterozigoti composti per un allele missenso e uno nullo hanno un potenziale di risposta intermedio (un allele può essere attivato). Questa relazione genotipo-risposta è clinicamente validata e determina direttamente la pianificazione del trattamento.

L'eccesso di ferro nella PKD si sviluppa anche in assenza di trasfusioni: la diagnosi molecolare porta a un monitoraggio proattivo dei livelli di ferro

A differenza della talassemia, in cui il sovraccarico di ferro è dovuto principalmente alle trasfusioni, nei pazienti affetti da PKD il sovraccarico di ferro deriva da un maggiore assorbimento intestinale del ferro, mediato dalla soppressione dell’epcidina. I pazienti affetti da PKD non dipendenti dalle trasfusioni possono sviluppare un significativo deposito di ferro nel fegato e, alla fine, una cirrosi senza un monitoraggio proattivo e una terapia chelante. La diagnosi molecolare della PKD — piuttosto che una vaga diagnosi di "anemia emolitica cronica" — garantisce che il paziente venga inserito in adeguati protocolli di monitoraggio del ferro (ferritina regolare, risonanza magnetica epatica T2*) e riceva una terapia chelante quando indicato.

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Un paziente aveva trascorso decenni nel sistema sanitario britannico senza una diagnosi. I dati di Dante, accettati dai team clinici del Servizio Sanitario Nazionale (NHS) presso il Queen Elizabeth University Hospital di Glasgow, hanno permesso di identificare la sindrome di Noonan e una variante del gene RUNX1 associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Dopo 40 anni, hanno finalmente ottenuto una risposta.

Una lettura completa offre un quadro completo.

Un paziente si è rivolto a Dante per indagare su un caso di paralisi periodica. L'analisi del genoma completo ha permesso di individuare una patologia cardiaca ereditaria concomitante — la sindrome di Brugada — che il medico curante ha confermato con un ECG. Il risultato ha inoltre chiarito la storia cardiaca irrisolta di un membro della famiglia. Un solo esame. Tutte le risposte in un unico risultato.

Sequenziamento effettuato nel 2019. I dati sono stati analizzati nel 2021.

Jennifer ha fatto sequenziare il proprio genoma con Dante due anni prima della diagnosi di cancro al seno. All’inizio della terapia, i dati farmacogenomici di Dante hanno indicato che la chemioterapia prescritta le avrebbe causato gravi effetti collaterali. Il suo medico ha scelto un’alternativa e lei ha iniziato un trattamento efficace fin dal primo giorno.

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Il test Dante Genome ha aiutato gli specialisti di un ospedale di pronto soccorso nazionale del Regno Unito a diagnosticare la sindrome di Noonan e una rara variante genetica associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Questo risultato ha cambiato il percorso terapeutico del paziente.

Accreditato da e pubblicato su

Emendamenti per il miglioramento dei laboratori clinici Collegio dei Patologi Americani Società Americana di Genetica Umana Nature Società Internazionale per la Terapia Cellulare e Genica Gene Journal
DOMANDE FREQUENTI

Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.

Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?

I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.

Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?

Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.

Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?

Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.

In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?

I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.

Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?

Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.

ASSOCIAZIONI DI DIFESA DEI DIRITTI DEI PAZIENTI

Collaboriamo con associazioni di tutela dei pazienti in tutto il mondo.

Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per l'anemia emolitica ereditaria — deficit di glucosio-6-fosfato isomerasi e deficit di piruvato chinasi — e altre patologie, sia rare che comuni. Sosteniamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.

Possiamo fornire report personalizzati, sconti per gruppi e pacchetti su misura per i vostri soci. Contattateci tramite il modulo e vi risponderemo entro due giorni lavorativi.

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Kit per il test genetico di Dante Labs