FIBROSI CISTICA

Fibrosi cistica — In alcune popolazioni, la frequenza dei portatori del gene CFTR raggiunge 1 su 25. Un'analisi completa delle varianti del gene CFTR prima della pianificazione familiare consente di individuare lo stato di portatore che gli screening standard potrebbero non rilevare.

Il sequenziamento dell'intero genoma identifica tutte le varianti note del gene CFTR, consentendo lo screening dei portatori, la pianificazione riproduttiva e l'accesso a terapie mirate con modulatori del CFTR.

Certificato CLIA Accreditato CAP Laboratorio medico ISO 15189 Annunci ACMG HIPAA e GDPR Oltre 100.000genomi sequenziati
INFORMAZIONI SULLA FIBROSI CISTICA

Fibrosi cistica

La fibrosi cistica (FC) è una malattia multisistemica autosomica recessiva che colpisce i polmoni, il pancreas, il fegato, l'apparato riproduttivo e le ghiandole sudoripare. La prevalenza è di circa 1 su 2.500-3.500 nella popolazione caucasica; la frequenza dei portatori è di circa 1 su 25 nei caucasici. La malattia è causata da varianti patogene bialleliche nel gene CFTR, che codifica il regolatore della conduttanza transmembrana della fibrosi cistica, un canale del cloro fondamentale per il corretto equilibrio idrico ed elettrolitico nei tessuti epiteliali. Sono state identificate più di 2.000 varianti del gene CFTR. La variante F508del (delezione della fenilalanina 508) è di gran lunga la più comune, rappresentando circa il 70% degli alleli della fibrosi cistica a livello mondiale ed essendo presente in circa il 90% dei pazienti affetti da fibrosi cistica (sia eterozigoti che omozigoti). Dal punto di vista clinico, la CF si manifesta con una malattia polmonare progressiva (infezioni ricorrenti, bronchiectasie), insufficienza pancreatica (malassorbimento, diabete) e perdita di sali. L'aspettativa di vita mediana si è estesa dall'infanzia negli anni '80 a circa 50 anni oggi, principalmente grazie a una gestione polmonare aggressiva e, sempre più, alle terapie con modulatori del CFTR, che hanno trasformato la CF da una malattia infantile fatale a una condizione cronica gestibile.

Il gene CFTR codifica un canale del cloro regolato dal cAMP, composto da 1.480 aminoacidi, localizzato sulle membrane apicali delle cellule epiteliali. Le varianti sono classificate in base al meccanismo: la Classe I (nonsense, frameshift, sito di splicing canonico) non produce alcuna proteina; la Classe II (difetti di processamento, tra cui F508del) causa un ripiegamento errato e la degradazione nel reticolo endoplasmatico; la Classe III (difetti nella regolazione del canale) compromette l'apertura; la Classe IV (conduttanza ridotta) consente un flusso parziale di cloruro; la Classe V (quantità ridotta) produce bassi livelli di proteina funzionale. F508del è una variante di Classe II che causa un ripiegamento errato e una degradazione prematura. La proteina CFTR è assolutamente fondamentale per la secrezione di cloruro; la perdita di funzione porta a secrezioni disidratate e viscose nelle vie aeree e nei dotti, causando ostruzione, infezione e infiammazione. Tre farmaci modulatori del CFTR sono ora approvati e hanno trasformato i risultati: l'ivacaftor attiva le mutazioni di gating; il lumacaftor/ivacaftor corregge il ripiegamento errato di F508del; l'elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor si estende a circa il 90% dei pazienti affetti da fibrosi cistica.

La genotipizzazione del gene CFTR è fondamentale per la diagnosi della fibrosi cistica e, sempre più spesso, per la scelta della terapia. L'ivacaftor (Kalydeco) attiva specifiche mutazioni di gating (G551D, G1244E e altre) e apporta benefici a circa il 4-6% dei pazienti affetti da fibrosi cistica. Lumacaftor/ivacaftor (Orkambi) è indicato per i pazienti omozigoti per la mutazione F508del — circa il 15% dei pazienti affetti da FC — e produce un miglioramento del FEV1 di circa 6 punti. Elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor (Trikafta), approvato per i pazienti affetti da FC con almeno una copia della mutazione F508del, estende l’idoneità a circa il 90% dei pazienti affetti da FC; Trikafta produce un miglioramento del FEV1 di circa 10 punti e ha cambiato radicalmente il panorama della FC: la mortalità sembra essere in calo dall'approvazione. Il genotipo CFTR determina direttamente a quali modulatori un paziente può accedere, rendendo i test genetici essenziali per l'orientamento terapeutico e consentendo la selezione di trattamenti personalizzati.

PERCHÉ IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA COMPLETO

I test standard per la fibrosi cistica rilevano 23-32 varianti comuni. Non individuano le mutazioni rare e presentano una scarsa sensibilità nelle popolazioni di origine non europea.

I pannelli standard non rilevano le varianti rare del gene CFTR e presentano lacune relative all'ascendenza

I pannelli standard per lo screening dei portatori di fibrosi cistica analizzano 23–32 varianti comuni (ad esempio, il pannello esteso ACMG-23). Questa strategia individua circa l’88% dei portatori nella popolazione caucasica, ma solo circa il 64% in quella ispanica, circa il 49% in quella afroamericana e circa il 30% in quella asiatica: un grave divario in termini di equità sanitaria. I pannelli ampliati che includono oltre 100 varianti migliorano la rilevazione, ma continuano a non individuare le varianti rare. Gli attuali pannelli standard non valutano i geni modificatori (come TGFB1, MBL2) che influenzano la gravità della malattia. Il sequenziamento dell’intero genoma rileva tutte le varianti del CFTR, comprese quelle nuove, fornendo una valutazione definitiva dello stato di portatore per tutte le popolazioni e consentendo una valutazione completa del rischio genetico.

Il genotipo del CFTR determina l'accesso alla terapia modulatrice in grado di cambiare la vita

Attualmente sono stati approvati tre farmaci modulatori del CFTR: l’ivacaftor per specifiche mutazioni di gating (G551D, G1244E, ecc.), il lumacaftor/ivacaftor per gli omozigoti F508del e l’elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor per i pazienti con almeno una copia della mutazione F508del. Trikafta è approvato per circa il 90% dei pazienti affetti da fibrosi cistica e, dalla sua approvazione, ha ridotto la mortalità, producendo un miglioramento del FEV1 di circa 10 punti. Il genotipo CFTR determina direttamente a quale modulatore un paziente può accedere. Documentato nella cartella clinica e comunicato al paziente, il genotipo consente una discussione informata sulle opzioni terapeutiche, sulle aspettative di trattamento e sulla prognosi, prevenendo ritardi nella diagnosi e consentendo un intervento precoce in grado di preservare la funzione polmonare e migliorare notevolmente gli esiti.

COSA SIGNIFICA IN REALTÀ IL SEQUENZIAMENTO DEL TUO INTERO GENOMA
01

Il tuo DNA completo (non solo una parte)

I test genetici tradizionali analizzano insiemi limitati di geni, tralasciando gran parte del genoma. Noi sequenziamo il tuo genoma completo: ogni gene e ogni regione tra i geni.

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Analisi approfondite e rapporti specialistici

Facile da leggere e con risposte su cui tu e il tuo medico potete basare le vostre decisioni. Non si tratta di un fascicolo da interpretare: oltre 200 referti clinici, organizzati per categoria.

03

Il tuo test acquista sempre più valore ogni anno

Il tuo DNA non cambia, ma la scienza del genoma sta facendo passi da gigante. Ogni mese vengono scoperte nuove associazioni tra varianti e malattie. Noi verifichiamo questi risultati e aggiorniamo automaticamente i tuoi referti. Il tuo test acquista sempre più valore ogni anno che passa.

RISULTATI

I risultati che i medici ottengono nei casi più difficili.

Quarant'anni di incertezza. Un unico test.

Un paziente aveva trascorso decenni nel sistema sanitario britannico senza una diagnosi. I dati di Dante, accettati dai team clinici del Servizio Sanitario Nazionale (NHS) presso il Queen Elizabeth University Hospital di Glasgow, hanno permesso di identificare la sindrome di Noonan e una variante del gene RUNX1 associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Dopo 40 anni, hanno finalmente ottenuto una risposta.

Una lettura completa offre un quadro completo.

Un paziente si è rivolto a Dante per indagare su un caso di paralisi periodica. L'analisi del genoma completo ha permesso di individuare una patologia cardiaca ereditaria concomitante — la sindrome di Brugada — che il medico curante ha confermato con un ECG. Il risultato ha inoltre chiarito la storia cardiaca irrisolta di un membro della famiglia. Un solo esame. Tutte le risposte in un unico risultato.

Sequenziamento effettuato nel 2019. I dati sono stati analizzati nel 2021.

Jennifer ha fatto sequenziare il proprio genoma con Dante due anni prima della diagnosi di cancro al seno. All’inizio della terapia, i dati farmacogenomici di Dante hanno indicato che la chemioterapia prescritta le avrebbe causato gravi effetti collaterali. Il suo medico ha scelto un’alternativa e lei ha iniziato un trattamento efficace fin dal primo giorno.

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CHI AIUTIAMO

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Che tu stia cercando risposte oggi o voglia tutelare la tua salute per il futuro, l'analisi completa del tuo genoma è l'unico punto di partenza.

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La maggior parte dei test del DNA destinati al grande pubblico analizza meno dello 0,1% del tuo genoma. Noi lo analizziamo tutto.

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30X copertura dell'intero genoma
oltre 5 milioni varianti identificate per test
Oltre 200 rapporti clinici personalizzati
99,98% precisione di sequenziamento

Il test Dante Genome ha aiutato gli specialisti di un ospedale di pronto soccorso nazionale del Regno Unito a diagnosticare la sindrome di Noonan e una rara variante genetica associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Questo risultato ha cambiato il percorso terapeutico del paziente.

Accreditato da e pubblicato su

Emendamenti per il miglioramento dei laboratori clinici Collegio dei Patologi Americani Società Americana di Genetica Umana Nature Società Internazionale per la Terapia Cellulare e Genica Gene Journal
DOMANDE FREQUENTI

Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.

Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?

I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.

Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?

Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.

Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?

Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.

In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?

I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.

Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?

Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.

ASSOCIAZIONI DI DIFESA DEI DIRITTI DEI PAZIENTI

Collaboriamo con associazioni di tutela dei pazienti in tutto il mondo.

Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per la fibrosi cistica e altre patologie, sia rare che comuni. Sosteniamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.

Possiamo fornire report personalizzati, sconti per gruppi e pacchetti su misura per i vostri soci. Contattateci tramite il modulo e vi risponderemo entro due giorni lavorativi.

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  • Qualsiasi paese — compresi i gruppi virtuali
  • Patologie rare e comuni trattate

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Kit per il test genetico di Dante Labs