SINDROME DI COWDEN — PTEN

Sindrome di Cowden — La perdita di funzione del gene PTEN comporta uno dei rischi più elevati di sviluppare un tumore al seno nel corso della vita tra tutte le sindromi ereditarie, oltre a un aumento del rischio di tumore dell’endometrio, della tiroide, del colon-retto e del rene.

Il gene PTEN figura nell'elenco ACMG SF v3.2 dei geni per i quali è richiesta la segnalazione dei risultati secondari nel sequenziamento clinico del genoma. Il sequenziamento dell'intero genoma consente di caratterizzare il locus PTEN nella sua interezza, comprese le varianti della regione promotrice e le delezioni estese che i pannelli oncologici standard spesso non rilevano.

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INFORMAZIONI SULLA SINDROME DI COWDEN — PTEN

Sindrome di Cowden — Sindrome tumorale da amartoma PTEN

La sindrome di Cowden (CS) — la più comune tra le sindromi tumorali da amartoma PTEN (PHTS) — è una sindrome ereditaria di predisposizione al cancro a trasmissione autosomica dominante causata da varianti patogene germinali del gene PTEN (omologo della fosfatasi e della tensina) sul cromosoma 10q23.31. Il PTEN è un oncosoppressore che regola la via di segnalazione PI3K/AKT/mTOR; la perdita della funzione del PTEN porta a una proliferazione cellulare incontrollata e alla formazione di tumori. La sindrome di Cowden è caratterizzata da lesioni mucocutanee (trichilemmomi, papule papillomatose e cheratosi acrali), macrocefalia, amartomi benigni in più organi e rischi sostanzialmente elevati di neoplasie multiple. La prevalenza stimata è di 1 su 200.000, sebbene le diagnosi molecolari rivelino una frequenza significativamente più elevata.

I rischi di sviluppare un tumore nel corso della vita nei portatori di varianti patogene del gene PTEN sono tra i più elevati mai documentati per qualsiasi gene associato al cancro ereditario: il rischio di cancro al seno raggiunge il 67-85% (rispetto a una media della popolazione di circa il 12%); il rischio di cancro dell’endometrio si avvicina al 28-44%; il rischio di cancro alla tiroide (prevalentemente follicolare) raggiunge il 21-38%; il rischio di cancro colorettale è elevato (9-18%); e il rischio di carcinoma a cellule renali è di circa il 34%. I portatori di sesso maschile presentano un rischio elevato di cancro al seno e sono esposti a un rischio maggiore anche per i tumori della tiroide e del colon-retto. La sindrome di Bannayan-Riley-Ruvalcaba (BRR) e la sindrome di Proteus (PS) rappresentano disturbi allelici del PTEN con caratteristiche cliniche sovrapposte ma distinte, tutte causate da varianti patogene del PTEN.

Circa il 25% delle persone che soddisfano i criteri diagnostici clinici per la sindrome di Cowden non presenta una variante identificabile nella sequenza codificante del gene PTEN; questo gruppo può presentare varianti nella regione promotrice del PTEN, varianti introniche profonde, grandi riarrangiamenti genomici o varianti patogene in altri geni associati alla sindrome di Cowden (SDHB, SDHD, KLLN). Le linee guida NCCN raccomandano un'analisi completa del PTEN, compresi i test di delezione/duplicazione, come parte della valutazione completa della PHTS. La gestione dei portatori confermati di PTEN comprende una risonanza magnetica annuale al seno a partire dai 30 anni, mammografie annuali a partire dai 30-35 anni, la valutazione di una mastectomia di riduzione del rischio, un prelievo endometriale annuale a partire dai 30-35 anni e un'ecografia tiroidea annuale.

Le sindromi tumorali da amartoma PTEN comprendono la sindrome di Cowden, la sindrome di Bannayan-Riley-Ruvalcaba, la sindrome di Proteus e la sindrome simile a quella di Proteus: si tratta di condizioni alleliche con quadri clinici che si sovrappongono ma sono clinicamente distinguibili, tutte causate da varianti patogene del gene PTEN.

PERCHÉ IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA COMPLETO

Le varianti del promotore del gene PTEN e i grandi riarrangiamenti genomici rappresentano fino al 25% dei casi di PHTS — varianti che i pannelli standard per il cancro ereditario, che sequenziano solo gli esoni codificanti del gene PTEN, non rilevano sistematicamente.

Le varianti della regione promotrice del gene PTEN sono escluse dalla maggior parte dei pannelli per lo screening del cancro

In pazienti affetti dalla sindrome di Cowden, risultati negativi ai test standard di sequenziamento degli esoni del gene PTEN, sono state identificate varianti patogene germinali nella regione promotrice del PTEN — in particolare una variante ricorrente c.-1019_-1018dupTA. Queste varianti riducono la trascrizione del PTEN, causando un'aploinsufficienza funzionale senza alterare la sequenza codificante. I pannelli standard per il cancro sequenziano solo i 9 esoni codificanti del PTEN e i siti di splicing canonici; non includono la regione promotrice né gli elementi regolatori intergenici. Il sequenziamento dell'intero genoma legge il locus PTEN completo, compreso il promotore, tutti gli introni e l'UTR 3' — le regioni in cui risiedono le varianti patogene regolatorie.

La gestione del rischio di tumori multipli richiede la determinazione dello stato del gene PTEN il prima possibile

I rischi di cancro associati al gene PTEN sono tra i più elevati tra tutte le sindromi ereditarie, e la sorveglianza deve iniziare nella terza decade di vita — prima che la maggior parte dei tumori al seno e all’endometrio in questa popolazione sia clinicamente rilevabile. L'NCCN raccomanda una risonanza magnetica al seno e una mammografia annuali a partire dai 30 anni, con una sorveglianza dell'endometrio che inizia tra i 30 e i 35 anni. Questo programma di sorveglianza aggressivo è giustificato dai dati sul rischio a vita, ma richiede una variante patogena confermata del PTEN per essere attuato. Un risultato negativo su un pannello incompleto — che non ha valutato il promotore del PTEN o i riarrangiamenti strutturali — potrebbe fornire una falsa rassicurazione che ritarda di anni la necessaria sorveglianza.

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Un paziente aveva trascorso decenni nel sistema sanitario britannico senza una diagnosi. I dati di Dante, accettati dai team clinici del Servizio Sanitario Nazionale (NHS) presso il Queen Elizabeth University Hospital di Glasgow, hanno permesso di identificare la sindrome di Noonan e una variante del gene RUNX1 associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Dopo 40 anni, hanno finalmente ottenuto una risposta.

Una lettura completa offre un quadro completo.

Un paziente si è rivolto a Dante per indagare su un caso di paralisi periodica. L'analisi del genoma completo ha permesso di individuare una patologia cardiaca ereditaria concomitante — la sindrome di Brugada — che il medico curante ha confermato con un ECG. Il risultato ha inoltre chiarito la storia cardiaca irrisolta di un membro della famiglia. Un solo esame. Tutte le risposte in un unico risultato.

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Jennifer ha fatto sequenziare il proprio genoma con Dante due anni prima della diagnosi di cancro al seno. All’inizio della terapia, i dati farmacogenomici di Dante hanno indicato che la chemioterapia prescritta le avrebbe causato gravi effetti collaterali. Il suo medico ha scelto un’alternativa e lei ha iniziato un trattamento efficace fin dal primo giorno.

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Il test Dante Genome ha aiutato gli specialisti di un ospedale di pronto soccorso nazionale del Regno Unito a diagnosticare la sindrome di Noonan e una rara variante genetica associata alla leucemia che era rimasta inosservata. Questo risultato ha cambiato il percorso terapeutico del paziente.

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Emendamenti per il miglioramento dei laboratori clinici Collegio dei Patologi Americani Società Americana di Genetica Umana Nature Società Internazionale per la Terapia Cellulare e Genica Gene Journal
DOMANDE FREQUENTI

Domande frequenti sul sequenziamento dell'intero genoma.

Qual è la differenza tra il sequenziamento dell'intero genoma e un test genetico mirato?

I test genetici mirati — compresi i pannelli standard per il cancro ereditario — analizzano un elenco predefinito di varianti note in un insieme specifico di geni. Sono progettati per individuare ciò che già sanno di dover cercare. Il sequenziamento dell’intero genoma analizza l’intero genoma: tutti i 6 miliardi di coppie di basi, ogni gene, ogni regione tra i geni. Uno studio della Mayo Clinic pubblicato su JAMA Oncology ha rilevato che le linee guida standard per i test trascuravano più della metà dei pazienti con mutazioni tumorali ereditarie. Genome Test non ha un elenco fisso.

Cosa riceverò quando i miei risultati saranno pronti?

Il tuo Dante Genome fornisce oltre 200 referti pronti per i medici, organizzati per categoria clinica: tumori ereditari, patologie cardiache, malattie rare, farmacogenomica, stato di portatore e altro ancora. I referti vengono inviati al tuo Genome Manager protetto e sono formattati per un utilizzo clinico immediato. I tuoi dati genomici vengono conservati in modo permanente e rianalizzati automaticamente man mano che la scienza progredisce.

Cosa succede se viene individuata una variante clinicamente significativa?

Se viene individuata una variante patogena o potenzialmente patogena, questa verrà chiaramente segnalata nel vostro referto pronto per il medico, corredato dal contesto clinico, dalle evidenze scientifiche pubblicate e dalle azioni consigliate. Vi consigliamo di condividere qualsiasi risultato clinicamente significativo con il vostro medico o con un consulente genetico, che potrà guidarvi nelle decisioni relative alla sorveglianza, alla riduzione del rischio o ai test a cascata per i membri della famiglia.

In che cosa si differenzia da un test del DNA per privati come 23andMe o AncestryDNA?

I test del DNA per il grande pubblico utilizzano chip di genotipizzazione che analizzano meno dello 0,1% del genoma, ovvero un minuscolo insieme preselezionato di varianti comuni. Sono ottimizzati per l’ascendenza e i tratti a livello di popolazione, non per risultati genetici clinici. Il Dante Genome Test sequenzia il 100% del tuo genoma con una copertura di 30X, lo stesso standard utilizzato in ambito diagnostico clinico. I due test non sono comparabili in termini di portata, metodologia o utilità clinica.

Quanto tempo ci vuole per ottenere i risultati e in che modo vengono comunicati?

Il kit per il prelievo viene spedito entro 48 ore dall'ordine. Una volta che il campione arriva al nostro laboratorio certificato CLIA, il sequenziamento e l'analisi richiedono 6–8 settimane. I risultati vengono inviati in modo sicuro al tuo Genome Manager, dove potrai accedere ai tuoi referti, condividerli con il tuo medico e ricevere aggiornamenti automatici man mano che vengono convalidati nuovi risultati rispetto al tuo genoma.

ASSOCIAZIONI DI DIFESA DEI DIRITTI DEI PAZIENTI

Collaboriamo con associazioni di tutela dei pazienti in tutto il mondo.

Dante Labs collabora con associazioni di pazienti di qualsiasi dimensione — per la sindrome di Cowden — la sindrome da hamartomi e tumori PTEN e altre patologie, sia rare che comuni. Sosteniamo associazioni in qualsiasi paese, comprese quelle virtuali.

Possiamo fornire report personalizzati, sconti per gruppi e pacchetti su misura per i vostri soci. Contattateci tramite il modulo e vi risponderemo entro due giorni lavorativi.

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