Gene
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000149311↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 472↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 11q22.3
- Coordinate
- Cromosoma 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Esoni
- 63 esoni su 146 kb
- Proteina
- 3056 amminoacidi, 350,7 kDa
- Noto anche come
- TEL1, TELO1
- Simboli precedenti
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Trascritto MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
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Atassia-teleangectasia
- Autosomica recessiva
Atassia cerebellare progressiva, teleangectasia, immunodeficienza e predisposizione al cancro causate da alterazioni bialleliche di ATM.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
La diagnosi orienta la prevenzione delle infezioni e la terapia sostitutiva con immunoglobuline, riducendo l'esposizione alle radiazioni ionizzanti, nonché il monitoraggio oncologico e polmonare e il test di portatore nei familiari.
Infertilità femminile
Ridotta o assente capacità di una donna di concepire.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
Geni del seno e dell'ovaio oltre BRCA1/2
- Predisposizione al tumore correlata a ATMAutosomica dominante
Una singola variante in ATM aumenta moderatamente il rischio di tumore del seno ed è associata al tumore del pancreas e della prostata.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
▶Azionabilità
Generalmente si raccomanda uno screening mammario potenziato; i portatori il cui partner è anch'esso portatore di una variante in ATM potrebbero voler conoscere il rischio di atassia-teleangectasia nei figli.
- Tumore del seno ereditarioAutosomica dominante
Suscettibilità ereditaria al tumore del seno causata da varianti in uno di diversi geni.
- 2 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
A seconda del gene, può essere consigliato uno screening mammario anticipato e più intensivo, inclusa la risonanza magnetica.
Raggruppamenti più ampi
Altri errori innati dell'immunità
- Malattia da immunodeficienza
Uno di 170 geni collegati ad esso
Malattia caratterizzata da un deficit o da un'anomalia nei meccanismi dell'immunità, sia essa cellulare o umorale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
HSCT per SCID e PID gravi; terapia sostitutiva con immunoglobuline (IVIG/SCIG) per i deficit anticorpali; leniolisib (Joenja, FDA 2023) per APDS; terapia genica per ADA-SCID; abatacept per il deficit di CTLA4/LRBA; profilassi antibiotica; G-CSF per CGD
Malattie neurodegenerative ereditarie
- Malattia neurodegenerativa correlata a KIF5AAutosomica dominante
Uno di 372 geni collegati ad esso
Causata da alterazioni in una copia di KIF5A, che codifica una proteina motrice con una coda di legame per il carico. Tipi diversi di alterazione danno origine a condizioni diverse: paraplegia spastica ereditaria di tipo 10, una forma assonale della malattia di Charcot-Marie-Tooth e la sclerosi laterale amiotrofica (SLA).
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
La cura è sintomatica e dipende dal quadro clinico, e include fisioterapia, farmaci antispastici e un'assistenza multidisciplinare per la SLA. Ogni figlio di una persona affetta ha una probabilità su 2 di ereditare l'alterazione; la consulenza genetica aiuta le famiglie a comprendere questo rischio.
Struttura di ATM
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 12,9 kb dei 146 kb del gene; 9171 di queste basi codificano la proteina.
Varianti con una pagina (811)
Le varianti ATM con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Esone 18 | 108.268.501 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| c.2T>C | Esone 2 | 108.227.626 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.332-1G>A | Introne 4 | 108.235.669 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.496+5G>A | Introne 5 | 108.235.839 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.1122_1123del | Esone 9 | 108.248.987 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.1607+1G>T | Introne 10 | 108.251.073 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2251-2A>T | Introne 14 | 108.257.479 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2251-4A>G | Introne 14 | 108.257.477 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2466+5G>C | Introne 16 | 108.259.080 | Probabilmente patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti | |
| c.2639-23_2639-21del | Introne 17 | 108.268.386 | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Varianti patogeniche ClinVar (3833)
Le varianti ATM che ClinVar classifica come patogene o probabilmente patogene per qualsiasi condizione, esaminate da almeno un soggetto che le ha inviate con criteri, e le più esaminate tra queste. È il registro pubblico di ClinVar sul gene, non un risultato.
- Patogena 2826
- Patogena/probabilmente patogena 278
- Probabilmente patogena 729
| Variante | Condizioni | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogena | ★★★★3 stelle su 4 revisionata da un panel di esperti |
Vedi tutte le 3833 con ogni altra variante ATM in ClinVar → (si apre in una nuova scheda)
Geni associati alle stesse condizioni
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Condivide 2 condizioni
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseCondivide 2 condizioni
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Condivide 1 condizione
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialCondivide 1 condizione
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Condivide 1 condizione
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Condivide 1 condizione
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseCondivide 1 condizione
- ACER3alkaline ceramidase 3Condivide 1 condizione
- ACO2aconitase 2Condivide 1 condizione
- ADAadenosine deaminaseCondivide 1 condizione
- ADARadenosine deaminase RNA specificCondivide 1 condizione
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolaseCondivide 1 condizione
Tratti collegati a ATM
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che ATM può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Mostra altri 29 tratti
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Mostra altri 3 tratti
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati nel 2026-10-21: le condizioni a cui il gene è associato e il grado di associazione.
- L'elenco ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.21-c791e85a.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene ATM: ATM serine/threonine kinase. Consultato il 23 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/atm
Dante Labs. Gene ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citato il 23 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/atm
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