Quando si esegue un esame del sangue, il risultato è un’istantanea: accurata in quel preciso momento, ma irrilevante un anno dopo. Quando si sequenzia l’intero genoma, il risultato è permanente. La sequenza del DNA non cambia. Ma la scienza che la interpreta sì — ed è questo che rende il sequenziamento dell’intero genoma fondamentalmente diverso da qualsiasi altro esame medico.
I tuoi dati sono fissi. La scienza no.
Ogni mese, ricercatori di tutto il mondo pubblicano nuovi risultati che mettono in relazione varianti genetiche con malattie, risposte ai farmaci e condizioni di salute. La banca dati ClinVar — il principale archivio pubblico dedicato alle relazioni tra varianti e malattie — aggiunge migliaia di nuove voci ogni anno. Il ritmo sta accelerando man mano che diventano disponibili set di dati genomici più ampi per analisi su scala di popolazione.
Ciò significa che una variante presente nel vostro genoma, oggi classificata come "variante di significato incerto" (VUS), potrebbe essere riclassificata come patogena l'anno prossimo, quando si saranno accumulate prove sufficienti grazie agli studi clinici. Al contrario, una variante che inizialmente sembrava preoccupante potrebbe essere riclassificata come meno significativa man mano che saranno disponibili ulteriori dati sulla popolazione.
La domanda fondamentale è: il vostro fornitore di test rianalizza i vostri dati quando vengono effettuati questi aggiornamenti?
Perché la maggior parte dei test è rimasta ferma nel tempo
I test di genotipizzazione per il grande pubblico — come quelli offerti da 23andMe, AncestryDNA e servizi simili — analizzano una serie prestabilita di posizioni genetiche su un chip. Il referto che ricevi riflette ciò che si sapeva su quelle specifiche posizioni il giorno in cui il chip è stato progettato. Se la scienza scopre qualcosa di nuovo su una variante che non era presente sul chip, o riclassifica una variante che invece c'era, i risultati non vengono aggiornati, poiché i dati sottostanti sono incompleti.
Anche alcuni test clinici presentano questa limitazione. I pannelli genetici mirati analizzano solo i geni inclusi nel pannello. Se in futuro la ricerca dovesse individuare una variante clinicamente rilevante in un gene che non era presente nel vostro pannello, sarebbe necessario un nuovo test per rilevarla.
Come funziona la rianalisi dell'intero genoma
Il sequenziamento dell'intero genoma legge ogni singola posizione del tuo genoma — circa 6,4 miliardi di coppie di basi. Ciò significa che il tuo file di dati è completo fin dal primo giorno. Nulla è stato tralasciato. Non è necessario raccogliere nuovamente alcun dato.
Quando vengono pubblicate e clinicamente validate nuove associazioni tra varianti e malattie, i dati grezzi del tuo sequenziamento originale possono essere rianalizzati confrontandoli con banche dati aggiornate. È così possibile individuare nuovi risultati clinicamente significativi che non erano noti al momento del test originale, senza bisogno di un prelievo di sangue, un nuovo kit o un nuovo test.
In Dante Labs, questa rianalisi avviene automaticamente tramite la piattaforma Genome Manager. Quando convalidiamo nuove associazioni tra varianti e malattie attraverso il nostro processo di revisione clinica, i vostri rapporti vengono aggiornati per riflettere le ultime scoperte scientifiche. Riceverete una notifica in caso di eventuali modifiche clinicamente rilevanti .
Come funziona nella pratica
Prendiamo un esempio concreto: negli anni trascorsi da quando ClinVar ha iniziato a monitorare le classificazioni delle varianti, circa il 7% di tutte le varianti classificate è stato riclassificato almeno una volta alla luce di nuove evidenze. Alcune varianti VUS sono state riclassificate come patogene. Alcune varianti probabilmente patogene sono state declassate. Queste riclassificazioni hanno conseguenze cliniche dirette — determinano se lo screening è raccomandato, quali farmaci sono appropriati e quali membri della famiglia dovrebbero sottoporsi al test.
Se si dispone di un set di dati genomici completo, queste riclassificazioni vengono applicate automaticamente ai tuoi rapporti. Se invece il set di dati è incompleto — ovvero se non si tratta di un sequenziamento dell'intero genoma — potrebbero non essere applicate, sia perché la variante in questione non è stata analizzata, sia perché il fornitore non offre la possibilità di effettuare una nuova analisi.
I costi del sequenziamento una volta sola
C'è anche una considerazione di ordine pratico. Il sequenziamento dell'intero genoma costa oggi una frazione di quanto costava cinque anni fa — e la tendenza è in calo. Ma il calcolo non riguarda solo il prezzo attuale, bensì il costo totale delle informazioni genetiche nel corso della vita.
Se oggi si esegue un test con un pannello mirato e l'anno prossimo un test con un pannello diverso — perché la questione clinica è cambiata o perché al pannello sono stati aggiunti nuovi geni — si finisce per pagare due volte per una visione incompleta dello stesso genoma. Il sequenziamento dell'intero genoma rileva tutto in un'unica volta. Ogni domanda futura trova risposta nello stesso set di dati.
In conclusione
Il tuo genoma è l'unico test sanitario che acquista valore dopo che lo hai effettuato. Non perché il tuo DNA cambi — non è così. Ma perché la scienza che lo analizza non smette mai di progredire. L' unico requisito è che il test originale abbia rilevato tutto. Ed è esattamente ciò che fa il sequenziamento dell'intero genoma.
Scopri di più sul test genetico di Dante Labs →
Ricevi i nuovi post da Dante Labs
Approfondimenti sulla genomica, aggiornamenti sui prodotti e prospettive cliniche: direttamente nella tua casella di posta.
