Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ZNF576

zinc finger protein 576

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19q13.31
Koordináták
19. kromoszóma: 43 596 595–43 601 157 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 4,6 kb
Fehérje
170 aminosav
Más néven ismert
MGC2508
MANE Select transzkriptum
ENST00000336564.5NM_001145347.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZNF576 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ZNF576 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a ZNF576 helyét zárójel jelöli. A ZNF576 és környékén 32 gén a 19. kromoszómán, 43 098 876–44 098 875 között.19. kromoszóma19q13.31p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4343,2 Mb43,4 Mb43,6 Mb43,8 Mb44 MbPSG5: 43 159 949–43 186 600, fordított szálPSG5PSG4: 43 180 630–43 207 299, fordított szálPSG4PSG9: 43 211 791–43 269 563, fordított szálPSG9CD177: 43 353 686–43 364 397, előre szálCD177TEX101: 43 401 496–43 418 613, előre szálTEX101LYPD3: 43 460 787–43 465 608, fordított szálLYPD3PHLDB3: 43 473 625–43 505 301, fordított szálPHLDB3ETHE1: 43 506 713–43 527 259, fordított szálETHE1ZNF575: 43 525 497–43 541 813, előre szálZNF575XRCC1: 43 543 306–43 580 473, fordított szál: 43 554 692–43 593 036, fordított szálPINLYP: 43 575 801–43 583 964, előre szálIRGQ: 43 584 367–43 596 150, fordított szálIRGQZNF576: 43 596 595–43 601 157, előre szálZNF576SRRM5: 43 596 617–43 614 498, előre szálSRRM5ZNF428: 43 607 223–43 619 914, fordított szálZNF428CADM4: 43 622 055–43 639 858, fordított szálPLAUR: 43 645 672–43 670 547, fordított szálPLAURIRGC: 43 716 076–43 720 021, előre szálIRGCSMG9: 43 727 983–43 755 605, fordított szálSMG9KCNN4: 43 766 517–43 781 262, fordított szálKCNN4LYPD5: 43 785 874–43 827 206, fordított szálLYPD5ZNF283: 43 827 297–43 852 017, előre szálZNF283ZNF404: 43 864 321–43 901 831, fordított szálZNF404ZNF45: 43 910 549–43 935 306, fordított szálZNF45ZNF221: 43 951 204–43 972 739, előre szálZNF221ZNF155: 43 967 862–43 998 326, előre szálZNF155ZNF230: 44 002 934–44 013 924, előre szálZNF230ZNF222: 44 025 326–44 033 222, előre szálZNF222: 44 025 354–44 087 318, előre szálZNF223: 44 051 367–44 069 308, előre szálZNF223ZNF284: 44 072 138–44 089 613, előre szálZNF284ZNF224: 44 094 326–44 111 682, előre szálZNF224A ZNF576 ábrája: 3 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 43 596 595–43 596 743, 149 bázis2. exon: 43 597 094–43 597 193, 100 bázis3. exon: 43 598 831–43 601 157, 2327 bázis1235′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 4,6 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 513 bázis kódolja a fehérjét.

ZNF576 szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a ZNF576 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A ZNF576 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a ZNF576 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0,4%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,5%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ZNF576 gén: zinc finger protein 576. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/znf576

Vancouver

Dante Labs. ZNF576 gén: zinc finger protein 576 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/znf576

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet